Dicliptera yellow mottle Cuba virus


Basic Information

Genus Begomovirus
Isolate Cuba
Vector
Download Genome |GFF3 |PEP |CDS

Genomic Organization


JBrowse


Genome

AJ549960
ACCGGATGGCCGCGTCGGTCCCACTACTTTTCCGTACTCTCTGGTGGTCCCCCCTCTCTTTAATTTGAATTAAATGTTTGTGGACCAATCATATTGCATGTGCAGAGTCTAGATATTTGTGTTACTACTTGCTGATTAAGTTTAGTGGGCCTATAAAATTCAAATTAAAGCCCATTCTCAATAATTCAAAATGTCTAAGAGGGATGCCCCATGGCGTATGATGGTGGGTCCCTCTAAGGTTAGACGTACTCTCAATTTCTCACCTGGTGCTGGTTTGGGCTCAAAGTCCAATAGGGCTTCTTCTTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGAATGTACAGAACTCCTGATGTGCCCAAAGGGTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCTTATGAGCAGCGACATGACATCTCACATGTTGGTAAGGTGATGTGCATATCTGATGTGACACGTGGTAATGGTATTACTCACCGTGTGGGGAAACGTTTTTGTGTTAAGTCTGTGTACATTTTAGGGAAGATATGGATGGATGAGAACATCAAGCTCAAGAACCACACCAATAGTGTCATGTTTTGGGTGGTTAGAGACAGGAGACCATATGGCACTCCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTTTGATAATGAGCCCAGTACTGCTACTGTGAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAAGTCATGCATAAGTTCTATGCCAAGGTGACAGGTGGACAGTATGCCAGCAATGAGCAGGCTTTGGTGAAGCGTTTCTGGAAGGTGAATAATCATGTAGTGTACAATCATCAAGAAGCAGGGAAATATGAAAATCATACAGAGAATGCTCTGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCTAATCCTGTGTATGCTACATTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATTATGAATTTAATAAAATTTGAATTTTATTTCATGATTTTCTAGTACATCTGTTACATACGATTTGTCTGTTGCATAATGAACAGCTCTAATGACATTGTTAATTGAAATAACACCTATATTATCTAAATATGACAATACAAGGAATTTGAATCTATTTAAATAAATCATCCCAGAAGCTGTCAGAGAAGTCGTCCAGACTTGGAAGTTGAAGAAGGCTTTGTGAAGATCCAATTTCTTCCGAAGGTTGTAATTGAACCTGATTTGAAGGTGATACACCCTGCTGCGTGTGTACATTGGATCCTCTACTTGGAGTATCTTGAAATAGAGGGGATTTGGAACTTCCCAAATAAAAACGCCACTCGTTGCTTGAACTGCAGTGATGGTTCCCCCTGTGCGTGAATCCATGATTAGCACAATTAATGTGTATGTATATTGAACAACCACAATTGAGGTCAACTCTTCTTCGTCGGATTGCTCTTTTTTTAGCTCTCTTGTGAATTGGTTTGATAGAGGGGCAATGTGAGGGTGATGAAGATCGCATTATGAATGGTCCAATTATGTAAACCTTTATTTTCCTCTTTGTTTAGGAAATCTTTATAGCTGGAGCCCTCACCAGGATTGCATAGCACGATTGATGGTATACCTCCTTTAATTTGAACTGGCTTTCCATATTTACAGTTTGACTGCCAGTCTTTCTGGGCCCCAATTAAGTCTTCCCCGTGCTTTAATTTCAAATAATTAGGGCTGACATCATCAATGACGTTGTATTCCACGTCATTTGAATATACCCTAGAATTGAAATCCAGATGACCTGATAGATAGTTATGTTTGCCTAGAGTCCTGGCCCACATTGTCTTGCCTGTTCTTGAATCACCTTCGACGATGATACTAATAGGTCTCTCCGGCCGCGCAGCGGCACTCATGCCAAAATAATTGTCTGCCCATTCCTGCATTTCTTCTGGTACGTTAGTGAAGGAAGAAAGTTGAAACGGAGGGACCCACGGTTCTGGTGCTTTCATGAAAATCTTAGTTGCATTTGTAACCAGATTATGATGTTGGAGGAAGAAGTGCTGAGGTTGTTCCTCTTTTAATATTTGAAGTGCCTCAATTGCAGAAGATGCATTTAATGCCTTTGCATATGTATCGTTAACTGATTGGCAACCTCCTCTAGCACTTCTACCGTCGACCTGGAAAACTCCCCATTCAATTGTATCTCCGTCCTTGTTGATATAGGACTTGACGTCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGGGAAACCAGATCGAAGAATCTGTTATTTTTGCAGTTGAACTTTCCTTCGAACTGGATGAGCACATGAAGATGAGTCTCCCCATTTTCATGGAGTTCTCTACAAATCTTGATAAACTTCTTGTTAACTGGAGTAGATATGCTTTGTATTTGTGTTAGTGCTTCTTCTTTGCTAAGAGAACACTGTGGATATGTGAGGAAATAATTTTTGGCATTCACTGAAATCGTATAACTGATTGGCATATTTGTAATATGATATTGGTACCAGTTTGAGCTCTCTTCAAATGTCTATATAATTGGTAGAACTGGTAGACTATATATACATAAACCTTCTTTAAGGGATTAGCAACACGTTGCGGCCATCCGATATAATATT

Gene Information

NCBI Accession CAD79312.1
Location 191-979
Gene Name AV1
Protein Name coat protein
Coding Region ATGTCTAAGAGGGATGCCCCATGGCGTATGATGGTGGGTCCCTCTAAGGTTAGACGTACTCTCAATTTCTCACCTGGTGCTGGTTTGGGCTCAAAGTCCAATAGGGCTTCTTCTTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGAATGTACAGAACTCCTGATGTGCCCAAAGGGTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCTTATGAGCAGCGACATGACATCTCACATGTTGGTAAGGTGATGTGCATATCTGATGTGACACGTGGTAATGGTATTACTCACCGTGTGGGGAAACGTTTTTGTGTTAAGTCTGTGTACATTTTAGGGAAGATATGGATGGATGAGAACATCAAGCTCAAGAACCACACCAATAGTGTCATGTTTTGGGTGGTTAGAGACAGGAGACCATATGGCACTCCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTTTGATAATGAGCCCAGTACTGCTACTGTGAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAAGTCATGCATAAGTTCTATGCCAAGGTGACAGGTGGACAGTATGCCAGCAATGAGCAGGCTTTGGTGAAGCGTTTCTGGAAGGTGAATAATCATGTAGTGTACAATCATCAAGAAGCAGGGAAATATGAAAATCATACAGAGAATGCTCTGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCTAATCCTGTGTATGCTACATTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATTATGAATTTAATAAAATTTGAATTTTATTTCATGATTTTCTAG
Protein Sequence MSKRDAPWRMMVGPSKVRRTLNFSPGAGLGSKSNRASSWVNRPMYRKPRIYRMYRTPDVPKGCEGPCKVQSYEQRHDISHVGKVMCISDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVMFWVVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRYQVMHKFYAKVTGGQYASNEQALVKRFWKVNNHVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSIMNLIKFEFYFMIF

NCBI Accession CAD79313.1
Location 944-1342
Gene Name AC3
Protein Name replication enhacement protein
Coding Region ATGGATTCACGCACAGGGGGAACCATCACTGCAGTTCAAGCAACGAGTGGCGTTTTTATTTGGGAAGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATACTCCAAGTAGAGGATCCAATGTACACACGCAGCAGGGTGTATCACCTTCAAATCAGGTTCAATTACAACCTTCGGAAGAAATTGGATCTTCACAAAGCCTTCTTCAACTTCCAAGTCTGGACGACTTCTCTGACAGCTTCTGGGATGATTTATTTAAATAGATTCAAATTCCTTGTATTGTCATATTTAGATAATATAGGTGTTATTTCAATTAACAATGTCATTAGAGCTGTTCATTATGCAACAGACAAATCGTATGTAACAGATGTACTAGAAAATCATGAAATAAAATTCAAATTTTATTAA
Protein Sequence MDSRTGGTITAVQATSGVFIWEVPNPLYFKILQVEDPMYTRSRVYHLQIRFNYNLRKKLDLHKAFFNFQVWTTSLTASGMIYLNRFKFLVLSYLDNIGVISINNVIRAVHYATDKSYVTDVLENHEIKFKFY

NCBI Accession CAD79314.1
Location 1089-1478
Gene Name AC2
Protein Name Trans-activating protein
Coding Region ATGCGATCTTCATCACCCTCACATTGCCCCTCTATCAAACCAATTCACAAGAGAGCTAAAAAAAGAGCAATCCGACGAAGAAGAGTTGACCTCAATTGTGGTTGTTCAATATACATACACATTAATTGTGCTAATCATGGATTCACGCACAGGGGGAACCATCACTGCAGTTCAAGCAACGAGTGGCGTTTTTATTTGGGAAGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATACTCCAAGTAGAGGATCCAATGTACACACGCAGCAGGGTGTATCACCTTCAAATCAGGTTCAATTACAACCTTCGGAAGAAATTGGATCTTCACAAAGCCTTCTTCAACTTCCAAGTCTGGACGACTTCTCTGACAGCTTCTGGGATGATTTATTTAAATAG
Protein Sequence MRSSSPSHCPSIKPIHKRAKKRAIRRRRVDLNCGCSIYIHINCANHGFTHRGNHHCSSSNEWRFYLGSSKSPLFQDTPSRGSNVHTQQGVSPSNQVQLQPSEEIGSSQSLLQLPSLDDFSDSFWDDLFK

NCBI Accession CAD79315.1
Location 1420-2475
Gene Name AC1
Protein Name replication associated protein
Coding Region ATGCCAATCAGTTATACGATTTCAGTGAATGCCAAAAATTATTTCCTCACATATCCACAGTGTTCTCTTAGCAAAGAAGAAGCACTAACACAAATACAAAGCATATCTACTCCAGTTAACAAGAAGTTTATCAAGATTTGTAGAGAACTCCATGAAAATGGGGAGACTCATCTTCATGTGCTCATCCAGTTCGAAGGAAAGTTCAACTGCAAAAATAACAGATTCTTCGATCTGGTTTCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAATCCAGCTCCGACGTCAAGTCCTATATCAACAAGGACGGAGATACAATTGAATGGGGAGTTTTCCAGGTCGACGGTAGAAGTGCTAGAGGAGGTTGCCAATCAGTTAACGATACATATGCAAAGGCATTAAATGCATCTTCTGCAATTGAGGCACTTCAAATATTAAAAGAGGAACAACCTCAGCACTTCTTCCTCCAACATCATAATCTGGTTACAAATGCAACTAAGATTTTCATGAAAGCACCAGAACCGTGGGTCCCTCCGTTTCAACTTTCTTCCTTCACTAACGTACCAGAAGAAATGCAGGAATGGGCAGACAATTATTTTGGCATGAGTGCCGCTGCGCGGCCGGAGAGACCTATTAGTATCATCGTCGAAGGTGATTCAAGAACAGGCAAGACAATGTGGGCCAGGACTCTAGGCAAACATAACTATCTATCAGGTCATCTGGATTTCAATTCTAGGGTATATTCAAATGACGTGGAATACAACGTCATTGATGATGTCAGCCCTAATTATTTGAAATTAAAGCACGGGGAAGACTTAATTGGGGCCCAGAAAGACTGGCAGTCAAACTGTAAATATGGAAAGCCAGTTCAAATTAAAGGAGGTATACCATCAATCGTGCTATGCAATCCTGGTGAGGGCTCCAGCTATAAAGATTTCCTAAACAAAGAGGAAAATAAAGGTTTACATAATTGGACCATTCATAATGCGATCTTCATCACCCTCACATTGCCCCTCTATCAAACCAATTCACAAGAGAGCTAA
Protein Sequence MPISYTISVNAKNYFLTYPQCSLSKEEALTQIQSISTPVNKKFIKICRELHENGETHLHVLIQFEGKFNCKNNRFFDLVSPTRSAHFHPNIQGAKSSSDVKSYINKDGDTIEWGVFQVDGRSARGGCQSVNDTYAKALNASSAIEALQILKEEQPQHFFLQHHNLVTNATKIFMKAPEPWVPPFQLSSFTNVPEEMQEWADNYFGMSAAARPERPISIIVEGDSRTGKTMWARTLGKHNYLSGHLDFNSRVYSNDVEYNVIDDVSPNYLKLKHGEDLIGAQKDWQSNCKYGKPVQIKGGIPSIVLCNPGEGSSYKDFLNKEENKGLHNWTIHNAIFITLTLPLYQTNSQES