Corchorus yellow vein Cuba virus
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Genomic Organization
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ACCGGATGGCCGCGCCCCCCCCCCCCTTGGTGCGCTCGTGGTCCAATCACATCGCGCTTGGCGAGCTTAGATATTTGAAACAACTTAGTGCGCAAGTTGTGAGCGTCTTTATAAATTAAAGACATTCTGGGCCACCTTCTTTAGTTCAAAATGCCTAAGCGCGATGCCCCGTGGCGCGCTATGGCTGGGACCTCAAAGGTTAGCCGGGCTGCTAATTATTCTCCCCGTGCAGGTAATGGCCCGAAATTGAACAGGGCCTCAGAGTGGGTTAATAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGGATTTATCGCACTTTGAGGTCCCCTGATGTGCCCAGAGGCTGTGAAGGCCCGTGTAAGGTCCAGTCCTATGAACAGCGCCACGATATCTCACATGTAGGTAAGGTAATGTGTATTTCTGATGTGACACGTGGTAACGGCATTACCCACCGTGTGGGTAAGCGTTTCTGTGTTAAGTCTGTTTACATTTTAGGGAAGGTCTGGATGGACGACAACATCAAGCTCAAGAACCACACTAACAGCGTCATGTTCTGGTTGGTCCGTGATCGGAGACCGTATGGAACTCCCATGGACTTTGGCCAAGTGTTCAACATGTTTGACAACGAGCCTAGCACTGCCACCGTTAAGAACGATCTCCGTGATCGTTATCAGGTCATGCACAGGTTCTATGCCAAAGTCACGGGTGGACAGTATGCCAGCAACGAGCAGTCTATAGTCAGGCGATTCTGGAAAGTCAACAACCACGTGGTGTATAACCACCAGGAAGCTGGCAAGTACGAGAATCATACGGAGAACGCCTTGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTATATGCAACGCTTAAGATCCGGATCTATTTTTATGATTCGATCAGCAATTAATAAAATTTGAATTTTATTTCATGATCCTCAAGTACATAATTGACATATGATTTAGCTGTTGCGAAACGAACAGCCCTAATTACATTATTTAACCCAATTACACCTAATTGGTCTAAATACATATTAACTAACTGCCTAAACCTAATTAAATAAGTCAGCCCAGAAGCTGTCAGACCACTGGTCCAGACTTGGAAGTTCAGGAAGGCTTTGTGAAGACCCAGCCTCTTCCTGAGGTTGTGGTTGAACCTTATCTGGACGTGGTAGATCCTTGTCCTGGAGTACATTGGATCCTCTATCCTGATGATCTTGAAATAGAGGGGATTTGGCACCTCCCAGATAAAAACGGAACTCTCTGCCTGATCCACAGTGATGTTGACCCCTGTGCGTGAATCCATGGCCCGCGCAACTGACGTGGAAGAATATGGAACAGCCGCAGTTCAGGTCTACTCGTCTTCGCCTGATTGGCCTACGCTTGGCTATCCTGTGCTGTGCTTTGATAGAGGGGGCCGTCGAGGAAGATGAATTTTGCATTTTGAAGTGTCCACGACTTCAGCCCTGCATTTTCCTCCTTTTCCAGGAAATCTTTATAACTGGCCCCCTCCCCTGGATTGCACAGCACGATTGATGGGATCCCGCCTTTAATTTGAACCGGCTTTCCATATTTACAGTTGGACTGCCAGTCCTTTTGGGCCCCAATCAATTCCTTCCAGTGCTTTAGCTTTAGATAGTTGGGGCTGACATCATCAATGACGTTATACTCAACGTCATTCGAGTAAACCCTAGAATTGAAATCGAGGTGTCCACTCAGATAATTGTGTCGCCCCAACGTCCTGGCCCACATTGTTTTGCCCGTCCGACTATCACCTTCTATGATGATACTAACAGGTCTGACAGGCCGCGCAGCGGCATCCATGGCAAAATAATCATCCGCCCACTCTTGCATTTCTTCCGGGACGTTCGTGAAGGAAGAAAGTCGGAACGGAGGGACCCATGGTTCCGGAGCCTTTTGAAAGATCCGCTGTGCATTTGCGATCAGGTTATGGTGTTGGAGGAAGAAATGTTGAGGCTGCTCCTCCTTAATTATTTGTAGAGCCTCTTCTGCAGATGAGGCATTCAACGCCTTGGCATAGGTGTCGTTAGCCGTCTGGCAGCCTCCCCTAGCAGATCTCCCGTCGATCTGGAATTCTCCCCATTCCAGTGTATCTCCGTCCTTATCGATATAGGACTTGACATCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGTATGTTTGGATGGAAATGTGCTGACCTGGATGGGGAGACCAGATCGAAGAATCTGTTATTCTGGCATTTGAACTTTCCCTCGAACTGTATAAGCACATGGAGATGCGGTTCCCCATTCTCGTGGAGCTCCCTGCAGATCTTGACGAACTTCTTGTTCACCGGAGTTTCTAGGTTTTGTATCTGTGAAAGTGCTTCTTCTTTGGTCAGGGAGCACTTTGGATAAGTTATGAAATAATTTTTGGCATTTACTAAGAAACGTTTAACTGATGGCATTTTGGTAATAATATGGGTGAGACCCGATTGCTCCCCTCTCAAACTTGCTCATGCAATCGGGGAATGGGTCTCAATTTATACTAGAACCCTCAATAGAACTTTCAATCGTGTTCGAACACGTGGCGGCCATCCGAATAATATT
ACTGGATGGCCGCGAAAATTTGGAGTCCTACTTTAGCTGGCCGCGCTATTTTGGTGTTCGGCCCAGGCCCATTGGCGCTGTTCTTGTTGCTATTTTTGGAGTCATTATTTCCATCCGTCTTTTCCCTGGTGCGTCGCCTGGGCCCCTCGCTCACTTTGTATTGTACCTCCCATTTAATTTAAAGGGGCTTTAAATTAAATCAGTCTCGTCTTTATCCAATTTCGAGATTTGGCCTGTCAGGTGTAGTTACAGTCGACGTGGTCGATTTTGGACCTTGTTGCAATGCTTAAGTCGAAATTGAACTACTGTTATACTATACATCTTACGTGGACCAGTGAGAATCAACCTGTCGAGCCAAACTAAACATTTGTTTAGTTGATGGACTTTTATATATTGGGATGTTAGTACTCGTTTGGTTATCCATATCTGAACATGTTCTCGTCCAGATATCGACGTGGTTCTTTTTATAATCAACCACGTGGTTATCCTCGTAACCACGTGTTTAGGAGACAACCCTTTGTTAGGCGTCATGAGGGCAAGCGTCGACATGTTCAGCATGGGAAAAAACCTGACGAGCCCAAGTTGACAAGCCAAACCATACATGAGAATCAGTATGGCCCAGAGTTATCCATGGCCCATAACACATCCGTTTCGACCTTCATTAGCTACCCTGATATGGGTAAGTCCTTGCCTAATCGATCCAGGTCATATATCAAGTTGAAACGGCTTCGTTTCAAGGGAACTGTCAAAGTCGAACGTGTTCATTCCGATGTGAACATGGTAGGTACAACACCTAAGACTGAAGGTGTTTTCTCCTTGGTTCTAGTGGTCGATCGTAAACCTCACATCGGTCCTTCTGGTGGTCTTCCCAGTTTTGACGAATTATTCGGCGCAAGGATCCATAGTCATGGTAACCTGGCTATAATTCCGGCTATGAAGGAGCGGTTCTACTTGTGCCACGTGTTGAAGCGTGTTTTATCTGTGGAGAAGGATAGTCTGATGGTCGACATTGAAGGAACCGCTATCTTATCTAACAGGCGTTTTAATTGTTGGTCCAGTTTTAAGGATCTCGAGGTCGAGACATGTAAGGGTGTCTATGCAAACATAAGTAAGAACGCCCTGTTAGTTTATTACTGTTGGATGTCCGATACCATGTCTAAAGCATCCACATATGTATCATATGACCTCGATTATATTGGCTGAATAAACATTTATTATTAATGCAAAATTTATACAAATTTTGTTTAGGGGACAATTCTAACTATTTATCGAGTGATTTGATTTGAGAGGAACTACAATTACTCTTAATACATTCTTGGACCGTTGACCTGACAAGCTCGTTTAATTGGGCTATAGACATTGTTATGTTGGATTGGGCCCTGCCTGCTCCCACTATGGAGGCTGATTCTCCTGGATCCAGGACGCTGGTTCCTAACCTGTTGATATCTTTATAAGGATGCATCTCGTTCTCGATCTCTGAGTCAGCGTCCGATGGACCTACTCCAATTGTGCTTCTGGAAGCCCATGACTCTCCGGGTTTGATTTCAATTGGGCCTCTGAGCCCAAGCCTTGACATTGATGCACATCTGATGGGCTTCCTCTCCCATCTCCCGTAGTCCACGTGCGAGAAGTCCACATCCTTCTCGGTGAATTGCTTGGATAATATCTTGACGGTCGGTGCCTTAAATGGGATATCCACCGAGTGTTTGGCCGTGGACAATTTCAGCTTCCCTTTGAACTTGGCGAAGTGGGTTCTCTGGTGGACGTTCGTATCAGAAACTCTGTAATAGAGTTTCCACGGGATTGGGTCTTTCAAGGAGAAGAAGGAAGCTGAGAAGTAGTGGAGATCTATGTTACATCTGATCGGGAAAGTCCATGACGCCTGTAATGACTCATTGTCCGTCATTCTTTGGTCGTGGATCTCCACTATCACAGTCCCGGCGGCGTTGATCGGAACCTGTTGCCTGTACTCGATTACGCAGTGATCGATCTTCATACAGCTCCGACTGAGTCTTGCCGTGAATTGAGCCGCCGTTGACGGGAACTGCAAGATAATCTCAGTTAGGTCATGAGAAAGCTGATATTCATCTCTTTGAGACTCTATGTAGTTGAAGGCATGCGGTGGATTTGCTAACTGAGAATTCATTTATGAAAATATGGTCGCGCTAGCGAGATCGGTGTAATTATTTGAAGACTATGTCAAGAGCTTGATCTAACACAGGGTGAATTTAAAATCTGGGAAAAACTCTTTTTGTGGAAAAGAAGAGTACCGAGGAAGGAGAAGATGAAAATCTAGCTCTGACAAGTTTTGAGCATCTTAGATGCCTGACAGGGTTTATATAGAGACCCACGTGGTCTGGTTTCAGTTTGAGAAGGGATTCTTATGGCATTCTTGTAATAATAGGACGAGACACCAGGGGGAGCTCTCAACTTCTGTCATATTTTTTGGTGTCTTGGTGTCATATATATACATAAAGGCTCTAGGAGGATCCTATAGACACCAGGGGCAAAAGCGGCCATCCTATAATATT
Gene Information
NCBI Accession
|
AXU39865.1
|
Location
|
151-906 |
Gene Name
|
AV1 |
Protein Name
|
coat protein |
Coding Region
|
ATGCCTAAGCGCGATGCCCCGTGGCGCGCTATGGCTGGGACCTCAAAGGTTAGCCGGGCTGCTAATTATTCTCCCCGTGCAGGTAATGGCCCGAAATTGAACAGGGCCTCAGAGTGGGTTAATAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGGATTTATCGCACTTTGAGGTCCCCTGATGTGCCCAGAGGCTGTGAAGGCCCGTGTAAGGTCCAGTCCTATGAACAGCGCCACGATATCTCACATGTAGGTAAGGTAATGTGTATTTCTGATGTGACACGTGGTAACGGCATTACCCACCGTGTGGGTAAGCGTTTCTGTGTTAAGTCTGTTTACATTTTAGGGAAGGTCTGGATGGACGACAACATCAAGCTCAAGAACCACACTAACAGCGTCATGTTCTGGTTGGTCCGTGATCGGAGACCGTATGGAACTCCCATGGACTTTGGCCAAGTGTTCAACATGTTTGACAACGAGCCTAGCACTGCCACCGTTAAGAACGATCTCCGTGATCGTTATCAGGTCATGCACAGGTTCTATGCCAAAGTCACGGGTGGACAGTATGCCAGCAACGAGCAGTCTATAGTCAGGCGATTCTGGAAAGTCAACAACCACGTGGTGTATAACCACCAGGAAGCTGGCAAGTACGAGAATCATACGGAGAACGCCTTGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTATATGCAACGCTTAAGATCCGGATCTATTTTTATGATTCGATCAGCAATTAA |
Protein Sequence
|
MPKRDAPWRAMAGTSKVSRAANYSPRAGNGPKLNRASEWVNRPMYRKPRIYRTLRSPDVPRGCEGPCKVQSYEQRHDISHVGKVMCISDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKVWMDDNIKLKNHTNSVMFWLVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRYQVMHRFYAKVTGGQYASNEQSIVRRFWKVNNHVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSISN |
NCBI Accession
|
AXU39868.1
|
Location
|
903-1301 |
Gene Name
|
AC3 |
Protein Name
|
replication enhancer protein |
Coding Region
|
ATGGATTCACGCACAGGGGTCAACATCACTGTGGATCAGGCAGAGAGTTCCGTTTTTATCTGGGAGGTGCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATCATCAGGATAGAGGATCCAATGTACTCCAGGACAAGGATCTACCACGTCCAGATAAGGTTCAACCACAACCTCAGGAAGAGGCTGGGTCTTCACAAAGCCTTCCTGAACTTCCAAGTCTGGACCAGTGGTCTGACAGCTTCTGGGCTGACTTATTTAATTAGGTTTAGGCAGTTAGTTAATATGTATTTAGACCAATTAGGTGTAATTGGGTTAAATAATGTAATTAGGGCTGTTCGTTTCGCAACAGCTAAATCATATGTCAATTATGTACTTGAGGATCATGAAATAAAATTCAAATTTTATTAA |
Protein Sequence
|
MDSRTGVNITVDQAESSVFIWEVPNPLYFKIIRIEDPMYSRTRIYHVQIRFNHNLRKRLGLHKAFLNFQVWTSGLTASGLTYLIRFRQLVNMYLDQLGVIGLNNVIRAVRFATAKSYVNYVLEDHEIKFKFY |
NCBI Accession
|
AXU39867.1
|
Location
|
1048-1437 |
Gene Name
|
AC2 |
Protein Name
|
transcriptional activator protein |
Coding Region
|
ATGCAAAATTCATCTTCCTCGACGGCCCCCTCTATCAAAGCACAGCACAGGATAGCCAAGCGTAGGCCAATCAGGCGAAGACGAGTAGACCTGAACTGCGGCTGTTCCATATTCTTCCACGTCAGTTGCGCGGGCCATGGATTCACGCACAGGGGTCAACATCACTGTGGATCAGGCAGAGAGTTCCGTTTTTATCTGGGAGGTGCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATCATCAGGATAGAGGATCCAATGTACTCCAGGACAAGGATCTACCACGTCCAGATAAGGTTCAACCACAACCTCAGGAAGAGGCTGGGTCTTCACAAAGCCTTCCTGAACTTCCAAGTCTGGACCAGTGGTCTGACAGCTTCTGGGCTGACTTATTTAATTAG |
Protein Sequence
|
MQNSSSSTAPSIKAQHRIAKRRPIRRRRVDLNCGCSIFFHVSCAGHGFTHRGQHHCGSGREFRFYLGGAKSPLFQDHQDRGSNVLQDKDLPRPDKVQPQPQEEAGSSQSLPELPSLDQWSDSFWADLFN |
NCBI Accession
|
AXU39866.1
|
Location
|
1373-2434 |
Gene Name
|
AC1 |
Protein Name
|
replication-associated protein |
Coding Region
|
ATGCCATCAGTTAAACGTTTCTTAGTAAATGCCAAAAATTATTTCATAACTTATCCAAAGTGCTCCCTGACCAAAGAAGAAGCACTTTCACAGATACAAAACCTAGAAACTCCGGTGAACAAGAAGTTCGTCAAGATCTGCAGGGAGCTCCACGAGAATGGGGAACCGCATCTCCATGTGCTTATACAGTTCGAGGGAAAGTTCAAATGCCAGAATAACAGATTCTTCGATCTGGTCTCCCCATCCAGGTCAGCACATTTCCATCCAAACATACAGGGAGCTAAATCCAGCTCCGATGTCAAGTCCTATATCGATAAGGACGGAGATACACTGGAATGGGGAGAATTCCAGATCGACGGGAGATCTGCTAGGGGAGGCTGCCAGACGGCTAACGACACCTATGCCAAGGCGTTGAATGCCTCATCTGCAGAAGAGGCTCTACAAATAATTAAGGAGGAGCAGCCTCAACATTTCTTCCTCCAACACCATAACCTGATCGCAAATGCACAGCGGATCTTTCAAAAGGCTCCGGAACCATGGGTCCCTCCGTTCCGACTTTCTTCCTTCACGAACGTCCCGGAAGAAATGCAAGAGTGGGCGGATGATTATTTTGCCATGGATGCCGCTGCGCGGCCTGTCAGACCTGTTAGTATCATCATAGAAGGTGATAGTCGGACGGGCAAAACAATGTGGGCCAGGACGTTGGGGCGACACAATTATCTGAGTGGACACCTCGATTTCAATTCTAGGGTTTACTCGAATGACGTTGAGTATAACGTCATTGATGATGTCAGCCCCAACTATCTAAAGCTAAAGCACTGGAAGGAATTGATTGGGGCCCAAAAGGACTGGCAGTCCAACTGTAAATATGGAAAGCCGGTTCAAATTAAAGGCGGGATCCCATCAATCGTGCTGTGCAATCCAGGGGAGGGGGCCAGTTATAAAGATTTCCTGGAAAAGGAGGAAAATGCAGGGCTGAAGTCGTGGACACTTCAAAATGCAAAATTCATCTTCCTCGACGGCCCCCTCTATCAAAGCACAGCACAGGATAGCCAAGCGTAG |
Protein Sequence
|
MPSVKRFLVNAKNYFITYPKCSLTKEEALSQIQNLETPVNKKFVKICRELHENGEPHLHVLIQFEGKFKCQNNRFFDLVSPSRSAHFHPNIQGAKSSSDVKSYIDKDGDTLEWGEFQIDGRSARGGCQTANDTYAKALNASSAEEALQIIKEEQPQHFFLQHHNLIANAQRIFQKAPEPWVPPFRLSSFTNVPEEMQEWADDYFAMDAAARPVRPVSIIIEGDSRTGKTMWARTLGRHNYLSGHLDFNSRVYSNDVEYNVIDDVSPNYLKLKHWKELIGAQKDWQSNCKYGKPVQIKGGIPSIVLCNPGEGASYKDFLEKEENAGLKSWTLQNAKFIFLDGPLYQSTAQDSQA |
NCBI Accession
|
AXU39869.1
|
Location
|
2020-2277 |
Gene Name
|
AC4 |
Protein Name
|
AC4 protein |
Coding Region
|
ATGGGGAACCGCATCTCCATGTGCTTATACAGTTCGAGGGAAAGTTCAAATGCCAGAATAACAGATTCTTCGATCTGGTCTCCCCATCCAGGTCAGCACATTTCCATCCAAACATACAGGGAGCTAAATCCAGCTCCGATGTCAAGTCCTATATCGATAAGGACGGAGATACACTGGAATGGGGAGAATTCCAGATCGACGGGAGATCTGCTAGGGGAGGCTGCCAGACGGCTAACGACACCTATGCCAAGGCGTTGA |
Protein Sequence
|
MGNRISMCLYSSRESSNARITDSSIWSPHPGQHISIQTYRELNPAPMSSPISIRTEIHWNGENSRSTGDLLGEAARRLTTPMPRR |