Passion fruit chlorotic mottle virus


Basic Information

Genus Citlodavirus
NCBI Assembly GCF_004132865.1
Isolate Brazil
Release date 2019/2/12
Submitter Fontenele,R.S., Abreu,R.A., Lamas,N.S., Alves-Freitas,D.M.T., Vidal,A.H., Poppiel,R.R., Melo,F.L., Lacorte,C., Martin,D.P., Campos,M.A., Varsani,A., Ribeiro,S.G.
Host
Download Genome |GFF3 |PEP |CDS

Genomic Organization


JBrowse


Genome

NC_040706
TAATATTACAAGCGCCCTCGTCGGTCACACGTGGCAGGATCTGGACCATTGAATGTGATGTACAGATGGACGGTTGAGATTCACGTATTATGGAGGAGAATAAATGCGATGTCAGTAAAGACATCAGAAAGGACATTTATTGATAGTGGAGAGAGAAAAGGTAAGGTTTTTTGAATTATTGTAGATAACACAGCACGTGGTGGGGTCGGTGAGACATTAAAGGTAGATTTTTATAGCGGGAAAGTGGTTAGCACTTTCACATCTTCAAAAATCGTACCGATGTGACTGGGGGTGTATAAAAGAGCAATAATTGCAGCTCTTTTGTACCTAGAAATGAGCATATCTTCTGAAATATTTGAGGAGATAAAAGAAAATAAGGTGAGTATCACCGTTTTTTTTATTATTTTCTTTTGCGTATCTGTTATAAATGTCGTGTGCTGTGCCTTTGGATTTTGGCAATCTGCCGGACCACGTGGTGGGGCTGTTGTGTATGTTGGCGGTGAGGCTATTAATGATGGAGGAGAAGAGATATGTTCTGGAAAAAAGGCACAGCCTGGCTAACAGGCATAGGATTCTGATAAGAATTATTCGCAAATGGGGCAGGAAAAATCGCGTAAAGGCGAATGGTGACTACGCGGAGTGGAAGAACTTATGGGCCTCCTACGGCCCAGACAAGGAGAAGATTTCCGCCCATGAGAAGGAGGCCAGCTATGGACCGAGTGATTGGGCCGTCAAAAAAAACTGTGAAGCGGATGAAAAAGGGAAAGTCCGGCGGGATTCCGGTTGGATGTAAGGGGCCTTGTAAAACCCATACAGTCGACGTTATTGCGACTGTAACTCATGATGGCAAGGGGCCAGGTTTAGTATCAAATATCAGCAAAGGTGATGACTTTGGTCAGCGTGAGGGTAGACGTATTCGGGTGACGAAATTATTACTGAGGGGTAAAGTATGGCTCCCTCAGGATAAGGCGACCATCGCTGGATCGAATATAATGAGACTGTGGGTTATGAAGGATAGGCGCCCTGGCAGTCAGCATGTTGCATTTGAGGCATTGTTTGACATGGCTGACAAAGAGCCCTCTACGGCATTAGTGAAGATGGATTATAGAGACAGATTTATTGTTATTAAGGATATGGAAATCGACCTGCATGGAGGGAGAGATTTCCGTGTGGACGAGGAAACATTTGATATAATGGTTCCGATAAATTGTGACGTGTTATTTGATCACAATGACGAGGGGTCTTTGACCACCACGTTAGAGAACGGGATTATCGTTTATTATGCTGTTACGGATCCCGCTCAAGTGATGCAACTCACAGCACAGTGTAGATTGTACTTTTTTGACTCTACGTCCAATTAATGCAAATGTTGTTTTTTTTAATCAGGATGTCGGATTCACAAATTAAGGTGTTTAATGAGTATCACAGCAGTAAGCGTGTTGAGTATCCTCTGACAAATGAGAAGACAATGATAAAGCTGGAATTCCCCTCTATGGGAGATATAAGTTGGTCAAGACTTAAGGGTCATTGTTTAAAAATTGACCATTGTCAGATAAGTTACACCCCTCAGGTGCCAGCAAATGCTAGTGGCAATGTATGCTTTGAGATACATGATATGCGAATGGAAGCGGATAAAACGTTACAGGCAGAGTACACGGTGCCCATCAGGTGTGCGGTGGAGTTGAATTTTTTTTCAACTTCTTTTTTCAGTATGAAAGACGATGTGCCATGGGAAGTGTTTTATTCCGTAGAGAATAGTGATGTACGTTCTGGTACGAGATTCTGTAAGATGAAAGCAAGGGTTAAGCTGTCTAGTGCTAAGCACAGCACCCATATTAACTTTAGATCCCCGACGATAAAAATAATATCGAGGGGGTTTAGCGAACGTGATGTTGATTTTCATCACGTGGCAATACCTAAGGCAGAGAGGTTACTCTGCAGGGGTAGTTCTGTAATAACGAGCAGGCCTCGTTTTGAGATCGAGGCTGGTGATAGTTGGGCCAGTAAGTCCAGCATTGGTGGTAGCGACGTGGACTATCCGTATAAGGAACTGGGCCGATTAAACGCGGATGCATTAGAGATTGGGCCCAGTGCAAGCCAAGTTGGTATTGGGCCAGGTAATGAGCCCAATAAAGGAAAGGTTGTAATGGATGCAGTTGAATTTGCTGAGGTGGTGGCGGATGCAGTACGGCATGGAAGTGTAATAAACAATAATATTATTAATGATAATAAGAAAAAGGCTCCGGCATAATGTGGGTCGGAGCATAGGAGCGAACTTGAGAGCGATACTTGCGGAGCGAAATACAACGCGAGAAAAGGATTATGTTTATTAATATATGCTGCGCAGCACAGGCGAAATGTAATGAGCCGTTTTTAATATGGGTGTTGCAACTTCATTTCAAATGTTATAAAATGTTCAGAAAACAACAGATAGTACTTTTTATTGAGATGGTAAAAGTAGAGTACATAATAATTTGGATAATGAATCCAAATTAGTCGAACCACTTTTCCTCTGGGGATAGGGTGTACTCATCGACGTTTGTTTCCCACCAAAGTCTGATGTCAGGTGACATCATGTCCCTCCAATCCATGTCTGGATTGCAGAGAACTATTGTTGGAATACCTCCGTTGATGGTCCTATCCGGTTTATACTTAATGTTAACTGTGAAATCTTTTTGGCATCCCAATAAAGATTTCATTATTTCTGTTGTGATTTTGCTATAACTTATGTCGTCTATTACATTATACAGAGCAAAATCATTATAATTATGAAACTTCAACGATCCGGTGGAGTAGTTATGTAATCCCATAGATCTGGCCCAGCAAGTCTTTCCCGTGCGAGAAGGTCCACAGATGAAGATGGACTTGGGCCTGTTGGGCTTTGCGTCGGGCTCCTGCAAGCATCACAGTAGTAGTAATGCATTGAGCGTATGGGAATTTCAGACTCTGTTAGCAGATGTGCTCTGCAGTCAAAGCATAAATTAATGCGTACAAATTCTGTACTCACGCATAATATGTTGCGATTAGCCCATGCCCTGACATGATGTGGTAGATTTGGGAAGTCGATGAACTGGGGAGTGTAAGGGACAAATCTACGTTGGAAGTGATCCCTTGCGAATGATTGAATTGCTGGCCAGCGTAGAACATAGTCCATGGGACGATGTTCCTTCACCATGCGGTAGAAGGTATCTTCGTCCGTAGAGATTTGGAGTATGTCTCTCCAGATTGTCTGTAAGTCTCTAGAAGGTGGTCTCCTGCTGGTGGAGAAATCACCTTCCTCAATGAAGTCGTTATCCTTGCGGATATATCGGTATGAAGCTGCTGGTGATCTAAGTGGTTCGAACGGCGGATGAAATATTCTGTTATCGTGCAATTCGTCTTTTATGTCGAAGAACCTTGGGTTAGTCGTATCAAGACGACGTCGCATTTGGACCATAGCATGTATATGGGGGTCTCCGTTTTGATGAGTTTCAAAACAGACGCAAATAAAAAAAATATCGAAGCTGCTGGGCTTTGATTTTAGGAAATTAAGGATATATTCCTTTGGGAGGAAGCATTGAGCGAAGGTTAGGAAAATGTTTTTTGCACTGAAGCGGAAGTTGGATGTTGAAGGCATTTTTTGTTTTCTGAAGTGAATCGAGGAGTCAACGCAAAGCGTACGGCGGATGAAAAGTCAACGGTGTGAGTAAACTCTATGGGATAACTAAGAGTGTGAGTGTGACCGTATACGAGGGCGCTACTTA

Gene Information

NCBI Accession YP_009553192.1
Location 334-561
Protein Name hypothetical protein
Coding Region ATGAGCATATCTTCTGAAATATTTGAGGAGATAAAAGAAAATAAGGTGAGTATCACCGTTTTTTTTATTATTTTCTTTTGCGTATCTGTTATAAATGTCGTGTGCTGTGCCTTTGGATTTTGGCAATCTGCCGGACCACGTGGTGGGGCTGTTGTGTATGTTGGCGGTGAGGCTATTAATGATGGAGGAGAAGAGATATGTTCTGGAAAAAAGGCACAGCCTGGCTAA
Protein Sequence MSISSEIFEEIKENKVSITVFFIIFFCVSVINVVCCAFGFWQSAGPRGGAVVYVGGEAINDGGEEICSGKKAQPG

NCBI Accession YP_009553193.1
Location 428-793
Protein Name hypothetical v2 protein
Coding Region ATGTCGTGTGCTGTGCCTTTGGATTTTGGCAATCTGCCGGACCACGTGGTGGGGCTGTTGTGTATGTTGGCGGTGAGGCTATTAATGATGGAGGAGAAGAGATATGTTCTGGAAAAAAGGCACAGCCTGGCTAACAGGCATAGGATTCTGATAAGAATTATTCGCAAATGGGGCAGGAAAAATCGCGTAAAGGCGAATGGTGACTACGCGGAGTGGAAGAACTTATGGGCCTCCTACGGCCCAGACAAGGAGAAGATTTCCGCCCATGAGAAGGAGGCCAGCTATGGACCGAGTGATTGGGCCGTCAAAAAAAACTGTGAAGCGGATGAAAAAGGGAAAGTCCGGCGGGATTCCGGTTGGATGTAA
Protein Sequence MSCAVPLDFGNLPDHVVGLLCMLAVRLLMMEEKRYVLEKRHSLANRHRILIRIIRKWGRKNRVKANGDYAEWKNLWASYGPDKEKISAHEKEASYGPSDWAVKKNCEADEKGKVRRDSGWM

NCBI Accession YP_009553194.1
Location 624-1361
Protein Name capsid protein
Coding Region ATGGTGACTACGCGGAGTGGAAGAACTTATGGGCCTCCTACGGCCCAGACAAGGAGAAGATTTCCGCCCATGAGAAGGAGGCCAGCTATGGACCGAGTGATTGGGCCGTCAAAAAAAACTGTGAAGCGGATGAAAAAGGGAAAGTCCGGCGGGATTCCGGTTGGATGTAAGGGGCCTTGTAAAACCCATACAGTCGACGTTATTGCGACTGTAACTCATGATGGCAAGGGGCCAGGTTTAGTATCAAATATCAGCAAAGGTGATGACTTTGGTCAGCGTGAGGGTAGACGTATTCGGGTGACGAAATTATTACTGAGGGGTAAAGTATGGCTCCCTCAGGATAAGGCGACCATCGCTGGATCGAATATAATGAGACTGTGGGTTATGAAGGATAGGCGCCCTGGCAGTCAGCATGTTGCATTTGAGGCATTGTTTGACATGGCTGACAAAGAGCCCTCTACGGCATTAGTGAAGATGGATTATAGAGACAGATTTATTGTTATTAAGGATATGGAAATCGACCTGCATGGAGGGAGAGATTTCCGTGTGGACGAGGAAACATTTGATATAATGGTTCCGATAAATTGTGACGTGTTATTTGATCACAATGACGAGGGGTCTTTGACCACCACGTTAGAGAACGGGATTATCGTTTATTATGCTGTTACGGATCCCGCTCAAGTGATGCAACTCACAGCACAGTGTAGATTGTACTTTTTTGACTCTACGTCCAATTAA
Protein Sequence MVTTRSGRTYGPPTAQTRRRFPPMRRRPAMDRVIGPSKKTVKRMKKGKSGGIPVGCKGPCKTHTVDVIATVTHDGKGPGLVSNISKGDDFGQREGRRIRVTKLLLRGKVWLPQDKATIAGSNIMRLWVMKDRRPGSQHVAFEALFDMADKEPSTALVKMDYRDRFIVIKDMEIDLHGGRDFRVDEETFDIMVPINCDVLFDHNDEGSLTTTLENGIIVYYAVTDPAQVMQLTAQCRLYFFDSTSN

NCBI Accession YP_009553195.1
Location 1361-2251
Protein Name movement protein
Coding Region ATGCAAATGTTGTTTTTTTTAATCAGGATGTCGGATTCACAAATTAAGGTGTTTAATGAGTATCACAGCAGTAAGCGTGTTGAGTATCCTCTGACAAATGAGAAGACAATGATAAAGCTGGAATTCCCCTCTATGGGAGATATAAGTTGGTCAAGACTTAAGGGTCATTGTTTAAAAATTGACCATTGTCAGATAAGTTACACCCCTCAGGTGCCAGCAAATGCTAGTGGCAATGTATGCTTTGAGATACATGATATGCGAATGGAAGCGGATAAAACGTTACAGGCAGAGTACACGGTGCCCATCAGGTGTGCGGTGGAGTTGAATTTTTTTTCAACTTCTTTTTTCAGTATGAAAGACGATGTGCCATGGGAAGTGTTTTATTCCGTAGAGAATAGTGATGTACGTTCTGGTACGAGATTCTGTAAGATGAAAGCAAGGGTTAAGCTGTCTAGTGCTAAGCACAGCACCCATATTAACTTTAGATCCCCGACGATAAAAATAATATCGAGGGGGTTTAGCGAACGTGATGTTGATTTTCATCACGTGGCAATACCTAAGGCAGAGAGGTTACTCTGCAGGGGTAGTTCTGTAATAACGAGCAGGCCTCGTTTTGAGATCGAGGCTGGTGATAGTTGGGCCAGTAAGTCCAGCATTGGTGGTAGCGACGTGGACTATCCGTATAAGGAACTGGGCCGATTAAACGCGGATGCATTAGAGATTGGGCCCAGTGCAAGCCAAGTTGGTATTGGGCCAGGTAATGAGCCCAATAAAGGAAAGGTTGTAATGGATGCAGTTGAATTTGCTGAGGTGGTGGCGGATGCAGTACGGCATGGAAGTGTAATAAACAATAATATTATTAATGATAATAAGAAAAAGGCTCCGGCATAA
Protein Sequence MQMLFFLIRMSDSQIKVFNEYHSSKRVEYPLTNEKTMIKLEFPSMGDISWSRLKGHCLKIDHCQISYTPQVPANASGNVCFEIHDMRMEADKTLQAEYTVPIRCAVELNFFSTSFFSMKDDVPWEVFYSVENSDVRSGTRFCKMKARVKLSSAKHSTHINFRSPTIKIISRGFSERDVDFHHVAIPKAERLLCRGSSVITSRPRFEIEAGDSWASKSSIGGSDVDYPYKELGRLNADALEIGPSASQVGIGPGNEPNKGKVVMDAVEFAEVVADAVRHGSVINNNIINDNKKKAPA

NCBI Accession YP_009553196.1
Location 2493-2828,2993-3616
Protein Name replication associated protein
Coding Region ATGCCTTCAACATCCAACTTCCGCTTCAGTGCAAAAAACATTTTCCTAACCTTCGCTCAATGCTTCCTCCCAAAGGAATATATCCTTAATTTCCTAAAATCAAAGCCCAGCAGCTTCGATATTTTTTTTATTTGCGTCTGTTTTGAAACTCATCAAAACGGAGACCCCCATATACATGCTATGGTCCAAATGCGACGTCGTCTTGATACGACTAACCCAAGGTTCTTCGACATAAAAGACGAATTGCACGATAACAGAATATTTCATCCGCCGTTCGAACCACTTAGATCACCAGCAGCTTCATACCGATATATCCGCAAGGATAACGACTTCATTGAGGAAGGTGATTTCTCCACCAGCAGGAGACCACCTTCTAGAGACTTACAGACAATCTGGAGAGACATACTCCAAATCTCTACGGACGAAGATACCTTCTACCGCATGGTGAAGGAACATCGTCCCATGGACTATGTTCTACGCTGGCCAGCAATTCAATCATTCGCAAGGGATCACTTCCAACGTAGATTTGTCCCTTACACTCCCCAGTTCATCGACTTCCCAAATCTACCACATCATGTCAGGGCATGGGCTAATCGCAACATATTATGCGTGAGTACAGAATTTACTTGCTGGGCCAGATCTATGGGATTACATAACTACTCCACCGGATCGTTGAAGTTTCATAATTATAATGATTTTGCTCTGTATAATGTAATAGACGACATAAGTTATAGCAAAATCACAACAGAAATAATGAAATCTTTATTGGGATGCCAAAAAGATTTCACAGTTAACATTAAGTATAAACCGGATAGGACCATCAACGGAGGTATTCCAACAATAGTTCTCTGCAATCCAGACATGGATTGGAGGGACATGATGTCACCTGACATCAGACTTTGGTGGGAAACAAACGTCGATGAGTACACCCTATCCCCAGAGGAAAAGTGGTTCGACTAA
Protein Sequence MPSTSNFRFSAKNIFLTFAQCFLPKEYILNFLKSKPSSFDIFFICVCFETHQNGDPHIHAMVQMRRRLDTTNPRFFDIKDELHDNRIFHPPFEPLRSPAASYRYIRKDNDFIEEGDFSTSRRPPSRDLQTIWRDILQISTDEDTFYRMVKEHRPMDYVLRWPAIQSFARDHFQRRFVPYTPQFIDFPNLPHHVRAWANRNILCVSTEFTCWARSMGLHNYSTGSLKFHNYNDFALYNVIDDISYSKITTEIMKSLLGCQKDFTVNIKYKPDRTINGGIPTIVLCNPDMDWRDMMSPDIRLWWETNVDEYTLSPEEKWFD

NCBI Accession YP_009553197.1
Location 2777-3616
Protein Name RepA
Coding Region ATGCCTTCAACATCCAACTTCCGCTTCAGTGCAAAAAACATTTTCCTAACCTTCGCTCAATGCTTCCTCCCAAAGGAATATATCCTTAATTTCCTAAAATCAAAGCCCAGCAGCTTCGATATTTTTTTTATTTGCGTCTGTTTTGAAACTCATCAAAACGGAGACCCCCATATACATGCTATGGTCCAAATGCGACGTCGTCTTGATACGACTAACCCAAGGTTCTTCGACATAAAAGACGAATTGCACGATAACAGAATATTTCATCCGCCGTTCGAACCACTTAGATCACCAGCAGCTTCATACCGATATATCCGCAAGGATAACGACTTCATTGAGGAAGGTGATTTCTCCACCAGCAGGAGACCACCTTCTAGAGACTTACAGACAATCTGGAGAGACATACTCCAAATCTCTACGGACGAAGATACCTTCTACCGCATGGTGAAGGAACATCGTCCCATGGACTATGTTCTACGCTGGCCAGCAATTCAATCATTCGCAAGGGATCACTTCCAACGTAGATTTGTCCCTTACACTCCCCAGTTCATCGACTTCCCAAATCTACCACATCATGTCAGGGCATGGGCTAATCGCAACATATTATGCGTGAGTACAGAATTTGTACGCATTAATTTATGCTTTGACTGCAGAGCACATCTGCTAACAGAGTCTGAAATTCCCATACGCTCAATGCATTACTACTACTGTGATGCTTGCAGGAGCCCGACGCAAAGCCCAACAGGCCCAAGTCCATCTTCATCTGTGGACCTTCTCGCACGGGAAAGACTTGCTGGGCCAGATCTATGGGATTACATAACTACTCCACCGGATCGTTGA
Protein Sequence MPSTSNFRFSAKNIFLTFAQCFLPKEYILNFLKSKPSSFDIFFICVCFETHQNGDPHIHAMVQMRRRLDTTNPRFFDIKDELHDNRIFHPPFEPLRSPAASYRYIRKDNDFIEEGDFSTSRRPPSRDLQTIWRDILQISTDEDTFYRMVKEHRPMDYVLRWPAIQSFARDHFQRRFVPYTPQFIDFPNLPHHVRAWANRNILCVSTEFVRINLCFDCRAHLLTESEIPIRSMHYYYCDACRSPTQSPTGPSPSSSVDLLARERLAGPDLWDYITTPPDR