Paper mulberry leaf curl virus 2


Basic Information

Genus Citlodavirus
Isolate Sweden
Host
Vector
Download Genome |GFF3 |PEP |CDS

Genomic Organization


JBrowse


Genome

MN595127
ACCTAGCTGGGAGCGGTGGGAGTGGTAGTAGGACACGTGTAAGGCTGAGATTTAACGAGAGCGAATAAAGCAAGCCAATAATGGAAGATGGACGGTGTAGATTGAAAGTTGAGTTAAACTTTGATCCAACGGTTAAAAAGTATGGTGGGAGCGTACGGGACCGTTGGATTGGAATCTACTTTAAGTTAGTGGACGCGGAATTATTGTTGAAATAATTGCGTGTGGGTCCCATATGTCTATTGAAGCTTAATGACGAAGCTTCTGCCGACAGTCCTCATAAGTAAATTTGAATTTCGAAATTACGTATTTGCCGCTTAATTGTCGTGGTGAACACGAAATTAATTATTATATAAAGGCAGTTAGAGTATATTTCGAAGCCATGGAGAGTTGTAAACTATCAGCAGAAGAATTTAGAGAGGTACTTTTCTTTGCTTGTGTAGCAGTAATTTTTTTTTCATTAGTATTAAATGTCTCAGTTTTTGTTAAAACGGCGGGATTTGCCCGAACGTTTAATGGGCACAATATACATGTGTGCCGTGAAGTATGTACAACTTCAGGAGGAAAAAAATATGAAAGTAGGAAATTTCCAGGGGATGGATGAGTGTAGATATTTGATCCGTTTAATACGCAGACATAGCAGAGTTCGGAATAGGCGAGAAGTAAATGGTGACTACGAGGGCTGGATCAAGAGTTATTGCGAAGGTACTCCCTGTATGGGGTGCCCGAGGGAAACGGAGCATAAGGCCCAAGGGGGGCAGGAAGAAAGGTGGCTCGAAGGGCCCAACTAAAGCCCGTGTTCGTATGGGCCGTGGATCTATTCCTTCTGGATTTAAAGGTCCATGTAAAACCCATACGTTAGATATAATAAAGACCATTCATAGGGATGGTCGTGGTTCTGGACAGCTGTCAAATATTGATAGGGGGGAAGATTTGGGTAATAGAGAAGGTCGACGTGTACGTGTCAGTAGGATGTTAATTAGAGGCAAATTATGGTTAGATGCGAATAACAGTAAGGCACCTGGGAGTAATCTGACGAAATTATGGTTTATTAAGGACAGGAGGCCTGGCAATGAGGTGGTGTCATTTTCTTCTTTGATGGATATGACTGATAGTGAACCACTATCAGCTGTTGTGAAGATGGACTACAGAGACAGATTCATTGTCCTTAAGGACATGGTGGTTGATCTGCATGGAGGCGAAAATTTTCGCATTAATGCTATTGATATAGATGAGATGATAGAATGTAATTGTGATGTATTGTTTAATCATGAAGATCAAGGCAGTTTGACGAACACCTTAGAGAATGCTATAATGGTGTACTATGCATGTAGTGATAGTATTCATCAGACCCAAATTACAGCTCAATGTAGATTATATTTCTTTGATAGTGTATCTAATTAAATATTAATAAGATTATAAATTTTTTCAGAATGGAGCGGAGTCATGACGTAGCTTTAAAAAATTACCACAGTTCGAAAAGCATTGAGTATCCATTATCAAATGATTTAGTTCAAATATCATTGGCCTTTCCTGGATTAGCCGAGATTAGTTGGTCTCGGGTGAAAGGACAATGTATGAAAATTGACCATTGTCAAATTGTGTATACGCCACAAGTTCCGGCAAATGCGGAAGGGACAGTTATAGTCGTTATACATGATAAGCGTATGGAGATGGATAAAAGCCTTCAGGCTGAGTATACATTCCCTATACGATGTCCTGTGACATTGAATTATTTCTCAACGAGTTTTTTTTCGTTGAGGGACGAGGTGCCATGGGCTGTTTATTACAAAGTAATAGATAGTACTATGTTAAGCGGTACGCATTTCTGCCAGTTTAAGGCGAGGATTAAGCTGAGTTCTGCAAAGCATTCACAATATATAATGTTTAGAGCTCCAACTATGGAGATTAACTCTAAGGAATTCACTAAAGATCAAGTGGATTTTATGCATGTGGCGATACCAAAACCCAATAGGGTTTTGTGTAGGAGTAGTTCTGTAATTCAAAGCAAGCCCAGATTTGAGTTGGGCCCTGGCGAGAATTGGGCTACTAAGAGTATGCTGGCAGGTGAAGAAGGAGATAATATGTCGGAGTCTGGTGCTGGCCCATATCAATCATTAAACAGATTGGGCCTCGACGCAATTGATCCAGGCCCTTCGGCAAGTCAATTGGGCCGTAATGAAACCCATTCTGATTTGGGTCGGATACAGTTGAATGCAAACGATTTAGCTGGTATAGTCAGCGAGGCGTTGATTAGAGGTAGCCAATTAGGTGTTGATAAGAGTGAAGAGGGTGATTCACAGAAAGATAATTCTGGAATCAAGAAAAAAAATGTAATGTAAAACATACGTTGTAAATATTGATTTTATTGAATATGAATAAAATTATAAATTTTTAAAATTGCCATGAATGAAAATAAGGTCGCAAACAGGTTTTCTATGCGCGACAAATTCCGTTAGTACAAGACACTAAAAAAAGCAATATATTTATATTAATGTTTTTAAACCGAAGGTTTAAAAGAAAGTGTCACTTTCATTCATATAATAAGTGATTACATTCTTGTGCCACCATGTCTTAATTTCCGTGGACATGGTTGAGAGCCAGTCCATATCAGGATTACAGAGAATAATGGTGGGTATCCCCCCTTTGATAGTACGATCTGGTTTATATTTAATATTAACCGTTACATTATGTTGACAACCTACTAATGATTTCATTATTTCAGACGAGATTCTAGTATAGTGAATGTCGTCTATTACATTGTATAATGCATAGTCATTGTAATCGTGGAATTTTAACTGGCCCGTGAAGTAGTTGTGTAGGCCCAATGATCTGGCCCAGCATGTCTTGCCTGATCTGCTCGGTCCGCAGATGTAGAGGGAGATTGGCCTGTTGGGCTTGTTCTCGGGGTCCTGCAATCAGCGGCATCGCAGTAGTAGTGGTGTAGGAGTGAAATGGTGTTTTCAGACTCGAACCGAGCCTTAGTTGAGCAATTGAAGCACAAATCATAATGAATGAAGGGTTTACTTACGAAAAGGATGTTGTCGTTTGCCCATTGCTGTATGTGTTGAGGGAGGTTTTGAAATTCTGTGAAAACCGGCATGAATGGCTCAACGACACGTTTGTAGTGGTCGTTGGCAAAGGATGATATGGCTGGCCAACGAAGGACGAAGTCCTGTGGTCGTTGGTCCTTGACTTTTGCCAGAAAGTCGTTTATGTCGGAGGCTGTGTCCAGAATGTCTTTCCAAATGGCGTTGGGATTTTTGGATGGGGATCTCTTCTTGTTGTTGAAAACCCCATCCTCATAAAAATTACCTGATTTTTTCAGGTATTTTTGACTAGCAGTGGGAGAGTGTAGTGGTTCAATATTTGGATGGTACCTTACGGTTGGCCCTTGTACAGGGTGTAATGGACCCATGTAGATGTCGAAGAAGCGACAGTTCCTTGTTTCGAACTGTTTGTCAAGTTGAACCATGGCGTGGACATGGGGTTCACCAGAAGCGTGAGTTTCCTCACACACAAGGATGTAGGTGATGTTGTGATGATGGAGAATGACCTTCAATTGTGTGGATACGTCATTCTTATGCAGTGGGCAGTTTGGGTATGTTAAGAAAATGTTTTTGGCTTTGAATCGGAATGATGTGGGAGGAGTGTTCGACATGTTGACAGTAGGGATTTGTAGTGGGCAATTGGGATAAGCAAATACTCTGGTTGATTGCATGTTGTTTGGAGGATGGGGTTCGCTCCCAGCTAGATTTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession QJX74424.1
Location 380-601
Protein Name V3
Coding Region ATGGAGAGTTGTAAACTATCAGCAGAAGAATTTAGAGAGGTACTTTTCTTTGCTTGTGTAGCAGTAATTTTTTTTTCATTAGTATTAAATGTCTCAGTTTTTGTTAAAACGGCGGGATTTGCCCGAACGTTTAATGGGCACAATATACATGTGTGCCGTGAAGTATGTACAACTTCAGGAGGAAAAAAATATGAAAGTAGGAAATTTCCAGGGGATGGATGA
Protein Sequence MESCKLSAEEFREVLFFACVAVIFFSLVLNVSVFVKTAGFARTFNGHNIHVCREVCTTSGGKKYESRKFPGDG

NCBI Accession QJX74423.1
Location 468-788
Protein Name V2
Coding Region ATGTCTCAGTTTTTGTTAAAACGGCGGGATTTGCCCGAACGTTTAATGGGCACAATATACATGTGTGCCGTGAAGTATGTACAACTTCAGGAGGAAAAAAATATGAAAGTAGGAAATTTCCAGGGGATGGATGAGTGTAGATATTTGATCCGTTTAATACGCAGACATAGCAGAGTTCGGAATAGGCGAGAAGTAAATGGTGACTACGAGGGCTGGATCAAGAGTTATTGCGAAGGTACTCCCTGTATGGGGTGCCCGAGGGAAACGGAGCATAAGGCCCAAGGGGGGCAGGAAGAAAGGTGGCTCGAAGGGCCCAACTAA
Protein Sequence MSQFLLKRRDLPERLMGTIYMCAVKYVQLQEEKNMKVGNFQGMDECRYLIRLIRRHSRVRNRREVNGDYEGWIKSYCEGTPCMGCPRETEHKAQGGQEERWLEGPN

NCBI Accession QJX74422.1
Location 664-1401
Protein Name V1
Coding Region ATGGTGACTACGAGGGCTGGATCAAGAGTTATTGCGAAGGTACTCCCTGTATGGGGTGCCCGAGGGAAACGGAGCATAAGGCCCAAGGGGGGCAGGAAGAAAGGTGGCTCGAAGGGCCCAACTAAAGCCCGTGTTCGTATGGGCCGTGGATCTATTCCTTCTGGATTTAAAGGTCCATGTAAAACCCATACGTTAGATATAATAAAGACCATTCATAGGGATGGTCGTGGTTCTGGACAGCTGTCAAATATTGATAGGGGGGAAGATTTGGGTAATAGAGAAGGTCGACGTGTACGTGTCAGTAGGATGTTAATTAGAGGCAAATTATGGTTAGATGCGAATAACAGTAAGGCACCTGGGAGTAATCTGACGAAATTATGGTTTATTAAGGACAGGAGGCCTGGCAATGAGGTGGTGTCATTTTCTTCTTTGATGGATATGACTGATAGTGAACCACTATCAGCTGTTGTGAAGATGGACTACAGAGACAGATTCATTGTCCTTAAGGACATGGTGGTTGATCTGCATGGAGGCGAAAATTTTCGCATTAATGCTATTGATATAGATGAGATGATAGAATGTAATTGTGATGTATTGTTTAATCATGAAGATCAAGGCAGTTTGACGAACACCTTAGAGAATGCTATAATGGTGTACTATGCATGTAGTGATAGTATTCATCAGACCCAAATTACAGCTCAATGTAGATTATATTTCTTTGATAGTGTATCTAATTAA
Protein Sequence MVTTRAGSRVIAKVLPVWGARGKRSIRPKGGRKKGGSKGPTKARVRMGRGSIPSGFKGPCKTHTLDIIKTIHRDGRGSGQLSNIDRGEDLGNREGRRVRVSRMLIRGKLWLDANNSKAPGSNLTKLWFIKDRRPGNEVVSFSSLMDMTDSEPLSAVVKMDYRDRFIVLKDMVVDLHGGENFRINAIDIDEMIECNCDVLFNHEDQGSLTNTLENAIMVYYACSDSIHQTQITAQCRLYFFDSVSN

NCBI Accession QJX74425.1
Location 1431-2339
Protein Name V4
Coding Region ATGGAGCGGAGTCATGACGTAGCTTTAAAAAATTACCACAGTTCGAAAAGCATTGAGTATCCATTATCAAATGATTTAGTTCAAATATCATTGGCCTTTCCTGGATTAGCCGAGATTAGTTGGTCTCGGGTGAAAGGACAATGTATGAAAATTGACCATTGTCAAATTGTGTATACGCCACAAGTTCCGGCAAATGCGGAAGGGACAGTTATAGTCGTTATACATGATAAGCGTATGGAGATGGATAAAAGCCTTCAGGCTGAGTATACATTCCCTATACGATGTCCTGTGACATTGAATTATTTCTCAACGAGTTTTTTTTCGTTGAGGGACGAGGTGCCATGGGCTGTTTATTACAAAGTAATAGATAGTACTATGTTAAGCGGTACGCATTTCTGCCAGTTTAAGGCGAGGATTAAGCTGAGTTCTGCAAAGCATTCACAATATATAATGTTTAGAGCTCCAACTATGGAGATTAACTCTAAGGAATTCACTAAAGATCAAGTGGATTTTATGCATGTGGCGATACCAAAACCCAATAGGGTTTTGTGTAGGAGTAGTTCTGTAATTCAAAGCAAGCCCAGATTTGAGTTGGGCCCTGGCGAGAATTGGGCTACTAAGAGTATGCTGGCAGGTGAAGAAGGAGATAATATGTCGGAGTCTGGTGCTGGCCCATATCAATCATTAAACAGATTGGGCCTCGACGCAATTGATCCAGGCCCTTCGGCAAGTCAATTGGGCCGTAATGAAACCCATTCTGATTTGGGTCGGATACAGTTGAATGCAAACGATTTAGCTGGTATAGTCAGCGAGGCGTTGATTAGAGGTAGCCAATTAGGTGTTGATAAGAGTGAAGAGGGTGATTCACAGAAAGATAATTCTGGAATCAAGAAAAAAAATGTAATGTAA
Protein Sequence MERSHDVALKNYHSSKSIEYPLSNDLVQISLAFPGLAEISWSRVKGQCMKIDHCQIVYTPQVPANAEGTVIVVIHDKRMEMDKSLQAEYTFPIRCPVTLNYFSTSFFSLRDEVPWAVYYKVIDSTMLSGTHFCQFKARIKLSSAKHSQYIMFRAPTMEINSKEFTKDQVDFMHVAIPKPNRVLCRSSSVIQSKPRFELGPGENWATKSMLAGEEGDNMSESGAGPYQSLNRLGLDAIDPGPSASQLGRNETHSDLGRIQLNANDLAGIVSEALIRGSQLGVDKSEEGDSQKDNSGIKKKNVM

NCBI Accession QJX74427.1
Location NA
Protein Name C1:C2
Coding Region ATGCAATCAACCAGAGTATTTGCTTATCCCAATTGCCCACTACAAATCCCTACTGTCAACATGTCGAACACTCCTCCCACATCATTCCGATTCAAAGCCAAAAACATTTTCTTAACATACCCAAACTGCCCACTGCATAAGAATGACGTATCCACACAATTGAAGGTCATTCTCCATCATCACAACATCACCTACATCCTTGTGTGTGAGGAAACTCACGCTTCTGGTGAACCCCATGTCCACGCCATGGTTCAACTTGACAAACAGTTCGAAACAAGGAACTGTCGCTTCTTCGACATCTACATGGGTCCATTACACCCTGTACAAGGGCCAACCGTAAGGTACCATCCAAATATTGAACCACTACACTCTCCCACTGCTAGTCAAAAATACCTGAAAAAATCAGGTAATTTTTATGAGGATGGGGTTTTCAACAACAAGAAGAGATCCCCATCCAAAAATCCCAACGCCATTTGGAAAGACATTCTGGACACAGCCTCCGACATAAACGACTTTCTGGCAAAAGTCAAGGACCAACGACCACAGGACTTCGTCCTTCGTTGGCCAGCCATATCATCCTTTGCCAACGACCACTACAAACGTGTCGTTGAGCCATTCATGCCGGTTTTCACAGAATTTCAAAACCTCCCTCAACACATACAGCAATGGGCAAACGACAACATCCTTTTCGACCCCGAGAACAAGCCCAACAGGCCAATCTCCCTCTACATCTGCGGACCGAGCAGATCAGGCAAGACATGCTGGGCCAGATCATTGGGCCTACACAACTACTTCACGGGCCAGTTAAAATTCCACGATTACAATGACTATGCATTATACAATGTAATAGACGACATTCACTATACTAGAATCTCGTCTGAAATAATGAAATCATTAGTAGGTTGTCAACATAATGTAACGGTTAATATTAAATATAAACCAGATCGTACTATCAAAGGGGGGATACCCACCATTATTCTCTGTAATCCTGATATGGACTGGCTCTCAACCATGTCCACGGAAATTAAGACATGGTGGCACAAGAATGTAATCACTTATTATATGAATGAAAGTGACACTTTCTTTTAA
Protein Sequence MQSTRVFAYPNCPLQIPTVNMSNTPPTSFRFKAKNIFLTYPNCPLHKNDVSTQLKVILHHHNITYILVCEETHASGEPHVHAMVQLDKQFETRNCRFFDIYMGPLHPVQGPTVRYHPNIEPLHSPTASQKYLKKSGNFYEDGVFNNKKRSPSKNPNAIWKDILDTASDINDFLAKVKDQRPQDFVLRWPAISSFANDHYKRVVEPFMPVFTEFQNLPQHIQQWANDNILFDPENKPNRPISLYICGPSRSGKTCWARSLGLHNYFTGQLKFHDYNDYALYNVIDDIHYTRISSEIMKSLVGCQHNVTVNIKYKPDRTIKGGIPTIILCNPDMDWLSTMSTEIKTWWHKNVITYYMNESDTFF

NCBI Accession QJX74426.1
Location 2792-3718
Protein Name C1
Coding Region ATGCAATCAACCAGAGTATTTGCTTATCCCAATTGCCCACTACAAATCCCTACTGTCAACATGTCGAACACTCCTCCCACATCATTCCGATTCAAAGCCAAAAACATTTTCTTAACATACCCAAACTGCCCACTGCATAAGAATGACGTATCCACACAATTGAAGGTCATTCTCCATCATCACAACATCACCTACATCCTTGTGTGTGAGGAAACTCACGCTTCTGGTGAACCCCATGTCCACGCCATGGTTCAACTTGACAAACAGTTCGAAACAAGGAACTGTCGCTTCTTCGACATCTACATGGGTCCATTACACCCTGTACAAGGGCCAACCGTAAGGTACCATCCAAATATTGAACCACTACACTCTCCCACTGCTAGTCAAAAATACCTGAAAAAATCAGGTAATTTTTATGAGGATGGGGTTTTCAACAACAAGAAGAGATCCCCATCCAAAAATCCCAACGCCATTTGGAAAGACATTCTGGACACAGCCTCCGACATAAACGACTTTCTGGCAAAAGTCAAGGACCAACGACCACAGGACTTCGTCCTTCGTTGGCCAGCCATATCATCCTTTGCCAACGACCACTACAAACGTGTCGTTGAGCCATTCATGCCGGTTTTCACAGAATTTCAAAACCTCCCTCAACACATACAGCAATGGGCAAACGACAACATCCTTTTCGTAAGTAAACCCTTCATTCATTATGATTTGTGCTTCAATTGCTCAACTAAGGCTCGGTTCGAGTCTGAAAACACCATTTCACTCCTACACCACTACTACTGCGATGCCGCTGATTGCAGGACCCCGAGAACAAGCCCAACAGGCCAATCTCCCTCTACATCTGCGGACCGAGCAGATCAGGCAAGACATGCTGGGCCAGATCATTGGGCCTACACAACTACTTCACGGGCCAGTTAA
Protein Sequence MQSTRVFAYPNCPLQIPTVNMSNTPPTSFRFKAKNIFLTYPNCPLHKNDVSTQLKVILHHHNITYILVCEETHASGEPHVHAMVQLDKQFETRNCRFFDIYMGPLHPVQGPTVRYHPNIEPLHSPTASQKYLKKSGNFYEDGVFNNKKRSPSKNPNAIWKDILDTASDINDFLAKVKDQRPQDFVLRWPAISSFANDHYKRVVEPFMPVFTEFQNLPQHIQQWANDNILFVSKPFIHYDLCFNCSTKARFESENTISLLHHYYCDAADCRTPRTSPTGQSPSTSADRADQARHAGPDHWAYTTTSRAS