French bean severe leaf curl virus


Basic Information

Genus Capulavirus
NCBI Assembly GCF_000899975.1
Isolate India
Release date 2015/2/22
Submitter Akram,M., Naimuddin
Host
Download Genome |GFF3 |PEP |CDS

Genomic Organization


JBrowse


Genome

NC_018453
ACGGTTGCGCGTGTGGGCCCCACAGCCTTATCGTGGGGCCCACGTTTTGGCTTTTAGTCGAAGCGTAAGCAAGACGTCATGTCGGCCCCACAGCAATATAAAAGGAACCACAGTTGAGGATCTGAATGTTCTCGTAGAGGTCATTGGGACAACGTGTGGTGTATGGAATATTGCTCAGAATTTATATTCTGGTGGGAAGCCGCTGTTATTGTAATTGTTTTAGGTTTATTGATTTATATCAATGGAAAGTCGCTTATACTTAATCGAGGAATTGCCAGAGACGTACGGTCGTTTACAGGGATTTTGCACAGACTTATTCCTGGGCCGGATGATACAGAAGGCCCAAGACGAAGGACTTACGGGAGAAGTAACTCGTTACAGACTACTCAGACAGTGTTACCGCCAATCCCAGAGACGGAAAGAGAAATGGGCCATCAAAGTGGCCCAATTCAATGAAGACCTTGCCACTATTATAAATAGGGGTAGATGGGCCTCTGAAGAGGCCCAGAAACTCCTAGCGTACAAAAAAAAAATAGAAGATGGCTCGCACAAGATCGGGGAGACAGTATTCGGCCCAGGCCCCATCTTGGGGCCGGAAGAAGACAAGAACACCCCGTTCGAGACCTACACTGATTGGGCCGATTCGAAGGCCCAATTACCAAATCAAGACCCGCTATGCCCCCCACAGACCTCAGACTAAGATACACTCCTTGTCTGCGGCAAGGGTTGTATCTGGGTCGGATAATGGTTATGGATGGCACATCTCGGACGTTCCTATTGGATCGGGCTTTGAAGATAGGCATAGTGATAAAATTAGAATTTTAAATTTTAATTTTAAGTTACAGATGAGGACTTCTCAACAGGGACAGAACACGTCATGCTGGCATAACGTGTATTTGTTTTTAGTTAGAGACAATAGTGGAGGAACAGCTGTTCCGAAATTTAATTCAATATGTATGATGGATAATTCCAACCCTTCCACTGCTGAGATTGACCATGATTCGAAGGATCGTTTCACGATTATGAGAAGATGGAGATTCCAGTTCAAAGGAAACAGCACATCTGGATCCGTTGCTTATGACTGTGCTAGGAATACTTATGATTTTAGGAAATTTGTTAAATTAAGTTCAATTACTGAATTTAAGAGTGCTACAAGTGGATCTTATGCTAATACGCAAAAGAACGCTTGGGTATTGTATTTTGTTCCTCAGACGTACGATATGACTGTTGACGGTCATTGTACGATCAAATATGTATCAATTGTGTAATCAATTAATAAAAAATAATTGAATTATGATATCGCTATCAATCATCACACGCTATAATACCAGATAATCAGAAAAACGATACGATAATAGTAATATAATCAAAGTCGAAGACTTTTAATTAATTAAAAGAAAGGATCTTTTATTTCCACATGAATTACATTGGATAAGGACCATTCGTACATTTCACTGCCCATTAATGCAGCTTTGTATGATTGATCTGGATTACACAGTACAATGGTTGGAATTCTACATTTTTTTCTATATTTTTCGTTGACTGTAAAATCCTTTTGACATCCTAGTAATTCTTTTTTACATGGAAGAAATTGAAAAGGAATATCATCTATGACGGTGTAAGTAGCAAAATTATTCCACACACTAAAATCAACACCCCCACAAAAATAATTATGTAGACCCATGCTCCTGGCCCATGCTGTTTTGCCTGTTTTTGTTGGGCCAAACAATTATTAGAGTCACTGGGCGGTCCGGTCTCTGATCCTGAAAATGATTGTACAACAGGATCTTCAGAATTACCAATCCATTCATCAGTAATAAAGTCTTCTGTTAAATTATGAGCCCATTGCATATCTGTTACTGATATTTCTGGTTGAACTAATTGCATGGATTGAAGACTTACTGTGAATAAGTTGGTGTCTGCCCATTCTCTAATGGGCTCGGGTACATTATTGAACACTGTCCATTTGGGAATGTACACACTAGGTTGCTCTGGCCACTTACTATTTGCTGCATATTCGAGATTTCGTAATTGAGTTGCCCAGACATATGGTTGCTCAATCTGGACTCTACCGAGAAACTCGGACTTGGAGGTGGATTCATTGATGATGTTTGTCCATATTGAATCCCTGCTCTTCTTAGGGCTTCTTCTACTTGCCCTAAGTATTCCTCGTTCCTCAAATTGTCCTCCCTTGGCAATATAGTCTGCCACATCAGCATCTCTTCTTGGGACCTGGCAATTGGGGTGGTAAACCCCAGTTCTGTTTGGGTCTGAGATGTCAAAATATCTCTGTGATGTGGTGTTGAACCTCTTGTCCAGTTGGACAAGACAGTGAAGGTGTGGCTCACCGTCCTGGTGATTCTCCGTACAGACCCTAGCATATATAGGATTAAAATTCTTTAATAATTGATATAAGTAATCAATTACGAAAAGTGGAGTTAAGGGGCATTTTGGGTAAGTCAAAAAAATAGACTTACCCTGGAGACGGAAGGAGTTGTTGTTGCGTCGAGGCATGATGCGTATAAAAATAATGGTAATAGAAGGGAGCTCAAGATTCGATTTGGCAATTCTTTATTCTACAAGGTTTTGCGTGAGAAGTGAGCTCCCTCCTGTTGCGTTATATAATACAAATGGACGGCTGTGATTTATCCACGTGTCTTTCATCTTGCGAGCCGACAAAAGTGAGTGGGTACTTTTACTTTATTAAATAAAGTTGTTTGAATGCGGACCGAAGGTCCGTAGTGCGGTTCTCACGCGCAACCTTTAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_006590004.1
Location 540-1268
Gene Name CP
Protein Name coat protein
Coding Region ATGGCTCGCACAAGATCGGGGAGACAGTATTCGGCCCAGGCCCCATCTTGGGGCCGGAAGAAGACAAGAACACCCCGTTCGAGACCTACACTGATTGGGCCGATTCGAAGGCCCAATTACCAAATCAAGACCCGCTATGCCCCCCACAGACCTCAGACTAAGATACACTCCTTGTCTGCGGCAAGGGTTGTATCTGGGTCGGATAATGGTTATGGATGGCACATCTCGGACGTTCCTATTGGATCGGGCTTTGAAGATAGGCATAGTGATAAAATTAGAATTTTAAATTTTAATTTTAAGTTACAGATGAGGACTTCTCAACAGGGACAGAACACGTCATGCTGGCATAACGTGTATTTGTTTTTAGTTAGAGACAATAGTGGAGGAACAGCTGTTCCGAAATTTAATTCAATATGTATGATGGATAATTCCAACCCTTCCACTGCTGAGATTGACCATGATTCGAAGGATCGTTTCACGATTATGAGAAGATGGAGATTCCAGTTCAAAGGAAACAGCACATCTGGATCCGTTGCTTATGACTGTGCTAGGAATACTTATGATTTTAGGAAATTTGTTAAATTAAGTTCAATTACTGAATTTAAGAGTGCTACAAGTGGATCTTATGCTAATACGCAAAAGAACGCTTGGGTATTGTATTTTGTTCCTCAGACGTACGATATGACTGTTGACGGTCATTGTACGATCAAATATGTATCAATTGTGTAA
Protein Sequence MARTRSGRQYSAQAPSWGRKKTRTPRSRPTLIGPIRRPNYQIKTRYAPHRPQTKIHSLSAARVVSGSDNGYGWHISDVPIGSGFEDRHSDKIRILNFNFKLQMRTSQQGQNTSCWHNVYLFLVRDNSGGTAVPKFNSICMMDNSNPSTAEIDHDSKDRFTIMRRWRFQFKGNSTSGSVAYDCARNTYDFRKFVKLSSITEFKSATSGSYANTQKNAWVLYFVPQTYDMTVDGHCTIKYVSIV

NCBI Accession YP_006590005.1
Location 1609-2514
Gene Name C1:C2
Protein Name replication associated protein
Coding Region ATGCCTCGACGCAACAACAACTCCTTCCGTCTCCAGGGTAAGTCTATTTTTTTGACTTACCCAAAATGCCCCTTAACTCCACTTTTCGTAATTGATTACTTATATCAATTATTAAAGAATTTTAATCCTATATATGCTAGGGTCTGTACGGAGAATCACCAGGACGGTGAGCCACACCTTCACTGTCTTGTCCAACTGGACAAGAGGTTCAACACCACATCACAGAGATATTTTGACATCTCAGACCCAAACAGAACTGGGGTTTACCACCCCAATTGCCAGGTCCCAAGAAGAGATGCTGATGTGGCAGACTATATTGCCAAGGGAGGACAATTTGAGGAACGAGGAATACTTAGGGCAAGTAGAAGAAGCCCTAAGAAGAGCAGGGATTCAATATGGACAAACATCATCAATGAATCCACCTCCAAGTCCGAGTTTCTCGGTAGAGTCCAGATTGAGCAACCATATGTCTGGGCAACTCAATTACGAAATCTCGAATATGCAGCAAATAGTAAGTGGCCAGAGCAACCTAGTGTGTACATTCCCAAATGGACAGTGTTCAATAATGTACCCGAGCCCATTAGAGAATGGGCAGACACCAACTTATTCACAGTAAGTCTTCAATCCATGCAATTAGTTCAACCAGAAATATCAGTAACAGATATGCAATGGGCTCATAATTTAACAGAAGACTTTATTACTGATGAATGGATTGGTAATTCTGAAGATCCTGTTGTACAATCATTTTCAGGATCAGAGACCGGACCGCCCAGTGACTCTAATAATTGTTTGGCCCAACAAAAACAGGCAAAACAGCATGGGCCAGGAGCATGGGTCTACATAATTATTTTTGTGGGGGTGTTGATTTTAGTGTGTGGAATAATTTTGCTACTTACACCGTCATAG
Protein Sequence MPRRNNNSFRLQGKSIFLTYPKCPLTPLFVIDYLYQLLKNFNPIYARVCTENHQDGEPHLHCLVQLDKRFNTTSQRYFDISDPNRTGVYHPNCQVPRRDADVADYIAKGGQFEERGILRASRRSPKKSRDSIWTNIINESTSKSEFLGRVQIEQPYVWATQLRNLEYAANSKWPEQPSVYIPKWTVFNNVPEPIREWADTNLFTVSLQSMQLVQPEISVTDMQWAHNLTEDFITDEWIGNSEDPVVQSFSGSETGPPSDSNNCLAQQKQAKQHGPGAWVYIIIFVGVLILVCGIILLLTPS