West African Asystasia virus 2


Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_002824745.1
Release date 2018/8/25
Submitter Wyant,P., Strohmeier,S., Fischer,A., Schafer,B., Briddon,R.W., Krenz,B., Jeske,H., Wyant,P.S., Allinger,A.
Host
Vector
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Genomic Organization


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Genome

NC_038476
ACCGGATGGCCGCGCTTTTTGATAGTGACTTTTGGGCCCACGCGCTTTTATTGGGCCAATTAAAATGGCCCATTTGAGCTTAGATAAATATTTTGGGCCTATATACTTGGGCCCTAAGTTTCGTGGACTTCAAAATGTGGGATCCTTTGGTGAATGAGTTCCCTGACACTGTCCATGGTTTTCGGTGCATGTTAGCCTGCAAGTATTTGCAGGCCGTAGAGAAGGAGTACGAGCCCAATACATTGGGCCACGATCTGATACGTGATTTGATCTCAGTTTTACGGGCCAAGAAATATGTCGAAGCGACCCGCAGATACTTTGATTTCCTTACCCGCCTCAAAGGTACGTCGTCGTCTGAACTTCGACAGCCCTTATGCGAGCCGTGCTATTGTCCCTATTGCCCTCGGCACAAACAGACGTCGTGCATGGGTCAACCGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATGTACAGAATGTACAGAAGCCCTGATGTTCCACGTGGTTGTGAGGGCCCATGTAAGGTCCAGTCATACGAGCAGAGAGATGACGTGTCTCATATTGGGAAGGTTCGATGTATTTCCGATGTGACTAAGGGTGGAGGTTTGACTCATAGAACTGGTAAGAGGTTCTGCATCAAGTCTATATATATCTTGGGGAAGGTGTGGATGGATGATGACATCAAGAAACAGAACCACACGAATCATGCTATGTTCTTTGTTGTTCGTGATAGGCGTCCCTATGGTAGTCCTATGGATTTCGGTCAGGTATTTAATATGTTTGATAATGAGCCGAGCACGGCGACTGTGAAGAATGATCTACGTGATAGGTTCCAGGTGATGAGGAAATTCCATGCTGCAGTGACCGGAGGTCCTTCTGGTACGAAGGAACAGGCTCTGGTGAAGAAATTTATGAAATTAAATACGCACGTGATGTATAATCATCAAGAGGCTGGGAAATACGAAAATCATACGGAGAATGCTTTGTTGCTGTATATGGCATGTACTCATGCCAATAATCCTTTGTATGCAACCCTTAAAATTAGGGTTTATTTTTATGACTCTGTTTTGAATTAATAAATATTAAATTTTATATCATATGCTTCTGCTACATGTTATGTGCCATGTAATACATTATACAATACAAATTTAATTGCTCTAATTAAATTGTTAATTGAAAGCACACCTAAACTATTTAGATATCTAATTACATGTTTACTAAATACTCTTAAGAAATGAGAAGTCTGAGGGCGTAAGCTCGTCCAGGCCTGGAAGGTCAATAAACATCTGTGAATCCCCAATGCCTTCCTCAGGTTGTGGTTGAATCTCACTTGTATTTTGATTATGTCCCATGGTCGGGACATTGGTCGGACGTCGTGGTTGAGGATCTTGAAATACAGGGGATTTGATATTTCCCAGATATAGACGCCATTCTTGGCCTGAGCTGCAGTGATGTTCTCCTCTGTGCGTGAATCCATGGTTGGTGCAGTTGATATGTAGGAAGTATGTGCAGCCACAATTTAAATCAATCCTCTTCCTGCGGATTGGTTTGCGTTTCCCGAGTCTGTGGCTGACTTTGATTGGCACCTGAGTAGAGTGGGCCGACGAGGGTGATGAATGATGCATTCTTTATGGCCCAGGTTTTGAGGGATGAATTTTTTTCTTCCTCGAGGTACTCTTTATATGATGATGTCGGGCCTGGATTGCAGAGGAAGATAGTGGGAATGCCACCTTTAATTTGAACTGGCTTCCCGTACTTGACATTGCTATTCCAGTTCCTTTGGGCCCCCATGAATTCCTTAAAGTGTTTTAGATAGTGGGGGTCGACATCATCAATGACGTTGTACCATGCGTCATTGCTGTATACCTTTGGACTGAGGTCCAGGTGGCCACATAGATAGTTATGTGGTCCCAGAGACCTTGCCCACATGGTTTTCCCTGTCCTGCTATCACCCTCAATGACAATACTATTCGGCCTCCATGGACGCGCAGCGGGACCCATCACATTTTCGGACACCCAGACTTCGAGTTCCTCTGGAACTTGATCGAAGGAGGAAGAAAGAAAGGGTGAAACATATGCCTCTGGAGGAGACATGAAAATCCTATCTAAATTGGATTTTAAATTATGATATTGAAAAATAAAATCCTTTGGGAGTTTCTCCCTTATTATTGCTAAAGCTGCATCTGCAGAACCTGCGTTTAAAGCCTCTGCACATGCATCGTTAGCATTCTGGCAGCCTCCACGAGCAGATCGTCCGTCGATCTGGAATGTGCCCCATTCGAGTGTATCTCCATCCTTCTCGATGTAGGACTTGACATCGGAGCTTGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGATCTGGTTGGGGATACCAGATCGAAGAATCGTTTATTTTGGCACTTGAATTTGCCTTCGAATTGCACAAGCATGTGGAGATGAGGTTCCCCATTCTCGTGCAGTTCTCTGCAAATTTTGATGAACAGTTTATTTGTGGGTGTTGAGAGGTTTATAATTTGGGAAAGTGCCTCCTCTTTGGTGAGGGGGCACTGTGGATAAGTGAGAAAATAATTTTTGCAATTAATGAGAAATCGCTTGGGAGGAGCCATTGACTTGGTCAATTGGGTCTCAGACATTTATCCCTGGTATATCGGGTCTCAATATATAGTGAGACCCAAATGGCATTTTGGTAATTATGCAACTTTAATTTGAATTGCACATGGGTAAAGCGGCCATCCGTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_009506563.1
Location 135-485
Gene Name AV2
Protein Name pre-coat protein
Coding Region ATGTGGGATCCTTTGGTGAATGAGTTCCCTGACACTGTCCATGGTTTTCGGTGCATGTTAGCCTGCAAGTATTTGCAGGCCGTAGAGAAGGAGTACGAGCCCAATACATTGGGCCACGATCTGATACGTGATTTGATCTCAGTTTTACGGGCCAAGAAATATGTCGAAGCGACCCGCAGATACTTTGATTTCCTTACCCGCCTCAAAGGTACGTCGTCGTCTGAACTTCGACAGCCCTTATGCGAGCCGTGCTATTGTCCCTATTGCCCTCGGCACAAACAGACGTCGTGCATGGGTCAACCGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATGTACAGAATGTACAGAAGCCCTGA
Protein Sequence MWDPLVNEFPDTVHGFRCMLACKYLQAVEKEYEPNTLGHDLIRDLISVLRAKKYVEATRRYFDFLTRLKGTSSSELRQPLCEPCYCPYCPRHKQTSCMGQPAHVQEAQNVQNVQKP

NCBI Accession YP_009506564.1
Location 295-1068
Gene Name AV1
Protein Name coat protein
Coding Region ATGTCGAAGCGACCCGCAGATACTTTGATTTCCTTACCCGCCTCAAAGGTACGTCGTCGTCTGAACTTCGACAGCCCTTATGCGAGCCGTGCTATTGTCCCTATTGCCCTCGGCACAAACAGACGTCGTGCATGGGTCAACCGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATGTACAGAATGTACAGAAGCCCTGATGTTCCACGTGGTTGTGAGGGCCCATGTAAGGTCCAGTCATACGAGCAGAGAGATGACGTGTCTCATATTGGGAAGGTTCGATGTATTTCCGATGTGACTAAGGGTGGAGGTTTGACTCATAGAACTGGTAAGAGGTTCTGCATCAAGTCTATATATATCTTGGGGAAGGTGTGGATGGATGATGACATCAAGAAACAGAACCACACGAATCATGCTATGTTCTTTGTTGTTCGTGATAGGCGTCCCTATGGTAGTCCTATGGATTTCGGTCAGGTATTTAATATGTTTGATAATGAGCCGAGCACGGCGACTGTGAAGAATGATCTACGTGATAGGTTCCAGGTGATGAGGAAATTCCATGCTGCAGTGACCGGAGGTCCTTCTGGTACGAAGGAACAGGCTCTGGTGAAGAAATTTATGAAATTAAATACGCACGTGATGTATAATCATCAAGAGGCTGGGAAATACGAAAATCATACGGAGAATGCTTTGTTGCTGTATATGGCATGTACTCATGCCAATAATCCTTTGTATGCAACCCTTAAAATTAGGGTTTATTTTTATGACTCTGTTTTGAATTAA
Protein Sequence MSKRPADTLISLPASKVRRRLNFDSPYASRAIVPIALGTNRRRAWVNRPMYRKPRMYRMYRSPDVPRGCEGPCKVQSYEQRDDVSHIGKVRCISDVTKGGGLTHRTGKRFCIKSIYILGKVWMDDDIKKQNHTNHAMFFVVRDRRPYGSPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRFQVMRKFHAAVTGGPSGTKEQALVKKFMKLNTHVMYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTHANNPLYATLKIRVYFYDSVLN

NCBI Accession YP_009506565.1
Location 1107-1469
Gene Name AC3
Protein Name replication enhancer
Coding Region ATGGATTCACGCACAGAGGAGAACATCACTGCAGCTCAGGCCAAGAATGGCGTCTATATCTGGGAAATATCAAATCCCCTGTATTTCAAGATCCTCAACCACGACGTCCGACCAATGTCCCGACCATGGGACATAATCAAAATACAAGTGAGATTCAACCACAACCTGAGGAAGGCATTGGGGATTCACAGATGTTTATTGACCTTCCAGGCCTGGACGAGCTTACGCCCTCAGACTTCTCATTTCTTAAGAGTATTTAGTAAACATGTAATTAGATATCTAAATAGTTTAGGTGTGCTTTCAATTAACAATTTAATTAGAGCAATTAAATTTGTATTGTATAATGTATTACATGGCACATAA
Protein Sequence MDSRTEENITAAQAKNGVYIWEISNPLYFKILNHDVRPMSRPWDIIKIQVRFNHNLRKALGIHRCLLTFQAWTSLRPQTSHFLRVFSKHVIRYLNSLGVLSINNLIRAIKFVLYNVLHGT

NCBI Accession YP_009506566.1
Location 1210-1617
Gene Name AC2
Protein Name transcriptional regulator
Coding Region ATGCATCATTCATCACCCTCGTCGGCCCACTCTACTCAGGTGCCAATCAAAGTCAGCCACAGACTCGGGAAACGCAAACCAATCCGCAGGAAGAGGATTGATTTAAATTGTGGCTGCACATACTTCCTACATATCAACTGCACCAACCATGGATTCACGCACAGAGGAGAACATCACTGCAGCTCAGGCCAAGAATGGCGTCTATATCTGGGAAATATCAAATCCCCTGTATTTCAAGATCCTCAACCACGACGTCCGACCAATGTCCCGACCATGGGACATAATCAAAATACAAGTGAGATTCAACCACAACCTGAGGAAGGCATTGGGGATTCACAGATGTTTATTGACCTTCCAGGCCTGGACGAGCTTACGCCCTCAGACTTCTCATTTCTTAAGAGTATTTAG
Protein Sequence MHHSSPSSAHSTQVPIKVSHRLGKRKPIRRKRIDLNCGCTYFLHINCTNHGFTHRGEHHCSSGQEWRLYLGNIKSPVFQDPQPRRPTNVPTMGHNQNTSEIQPQPEEGIGDSQMFIDLPGLDELTPSDFSFLKSI

NCBI Accession YP_009506567.1
Location 1517-2605
Gene Name AC1
Protein Name replication associated protein
Coding Region ATGGCTCCTCCCAAGCGATTTCTCATTAATTGCAAAAATTATTTTCTCACTTATCCACAGTGCCCCCTCACCAAAGAGGAGGCACTTTCCCAAATTATAAACCTCTCAACACCCACAAATAAACTGTTCATCAAAATTTGCAGAGAACTGCACGAGAATGGGGAACCTCATCTCCACATGCTTGTGCAATTCGAAGGCAAATTCAAGTGCCAAAATAAACGATTCTTCGATCTGGTATCCCCAACCAGATCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAATCAAGCTCCGATGTCAAGTCCTACATCGAGAAGGATGGAGATACACTCGAATGGGGCACATTCCAGATCGACGGACGATCTGCTCGTGGAGGCTGCCAGAATGCTAACGATGCATGTGCAGAGGCTTTAAACGCAGGTTCTGCAGATGCAGCTTTAGCAATAATAAGGGAGAAACTCCCAAAGGATTTTATTTTTCAATATCATAATTTAAAATCCAATTTAGATAGGATTTTCATGTCTCCTCCAGAGGCATATGTTTCACCCTTTCTTTCTTCCTCCTTCGATCAAGTTCCAGAGGAACTCGAAGTCTGGGTGTCCGAAAATGTGATGGGTCCCGCTGCGCGTCCATGGAGGCCGAATAGTATTGTCATTGAGGGTGATAGCAGGACAGGGAAAACCATGTGGGCAAGGTCTCTGGGACCACATAACTATCTATGTGGCCACCTGGACCTCAGTCCAAAGGTATACAGCAATGACGCATGGTACAACGTCATTGATGATGTCGACCCCCACTATCTAAAACACTTTAAGGAATTCATGGGGGCCCAAAGGAACTGGAATAGCAATGTCAAGTACGGGAAGCCAGTTCAAATTAAAGGTGGCATTCCCACTATCTTCCTCTGCAATCCAGGCCCGACATCATCATATAAAGAGTACCTCGAGGAAGAAAAAAATTCATCCCTCAAAACCTGGGCCATAAAGAATGCATCATTCATCACCCTCGTCGGCCCACTCTACTCAGGTGCCAATCAAAGTCAGCCACAGACTCGGGAAACGCAAACCAATCCGCAGGAAGAGGATTGA
Protein Sequence MAPPKRFLINCKNYFLTYPQCPLTKEEALSQIINLSTPTNKLFIKICRELHENGEPHLHMLVQFEGKFKCQNKRFFDLVSPTRSAHFHPNIQGAKSSSDVKSYIEKDGDTLEWGTFQIDGRSARGGCQNANDACAEALNAGSADAALAIIREKLPKDFIFQYHNLKSNLDRIFMSPPEAYVSPFLSSSFDQVPEELEVWVSENVMGPAARPWRPNSIVIEGDSRTGKTMWARSLGPHNYLCGHLDLSPKVYSNDAWYNVIDDVDPHYLKHFKEFMGAQRNWNSNVKYGKPVQIKGGIPTIFLCNPGPTSSYKEYLEEEKNSSLKTWAIKNASFITLVGPLYSGANQSQPQTRETQTNPQEED

NCBI Accession YP_009506568.1
Location 2191-2448
Gene Name AC4
Protein Name AC4 protein
Coding Region ATGGGGAACCTCATCTCCACATGCTTGTGCAATTCGAAGGCAAATTCAAGTGCCAAAATAAACGATTCTTCGATCTGGTATCCCCAACCAGATCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAATCAAGCTCCGATGTCAAGTCCTACATCGAGAAGGATGGAGATACACTCGAATGGGGCACATTCCAGATCGACGGACGATCTGCTCGTGGAGGCTGCCAGAATGCTAACGATGCATGTGCAGAGGCTTTAA
Protein Sequence MGNLISTCLCNSKANSSAKINDSSIWYPQPDQHISIRTFRELNQAPMSSPTSRRMEIHSNGAHSRSTDDLLVEAARMLTMHVQRL