Tomato mild yellow leaf curl Aragua virus


Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_000870725.1
Isolate Venezuela
Release date 2015/2/13
Submitter Zambrano,K.A., Carrillo,J., Carballo,O., Rivera-Bustamante,R., Marys,E.E., Rivera-Bustamante,R.F.
Host
Download Genome |GFF3 |PEP |CDS

Genomic Organization


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Genome

NC_009490
ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTGGAGTCCTCCGTTCTCGGCCCAGGCCCAAACGCATTTCTTTTGATATGGGACCACTTTAACAAAGCTGACCAATCATATTGCGTCTGACGAGTCTAGATATTTTAACTTATTCGTTAAGTTGTGGTCCCTATATATTTAGGACCATTATTGACAGAGTTATAACTTTAATTTGAAATGGTTAAGAGAGATGCCCCATGGCGATTAATGGCGGGGACCCCCAAGGTTTCGCGCTCTGTCAATTATTCCCCCCGTGGTGGTCCTAAATTAGACAAGGCCGCTGCGTGGGTTAATAGGCCCATGTACAGAAAGCCCAGGATATATCGAACAGTGAGAGGGCCCGATGTTCCGAAGGGCTGTGAAGGCCCATGCAAAGTCCAGTCTTATGAGCAGCGGCACGACGTTTCCCATGTTGGTAAGGTGATGTGTATATCCGACGTGACTCGTGGTAACGGTATAACCCATCGTGTGGGGAAACGTTTTTGCGTCAAATCTGTGTACATATTAGGGAAGATTTGGATGGACGAAAACATCAAGCTGAAGAACCACACGAACAGTGTCATGTTCTGGTTGGTCCGAGACCGTAGACCGTATGGGACGCCTATGGATTTTGGGCAGGTGTTCAACATGTTCGACAACGAGCCTAGTACAGCTACTGTCAAGAACGATCTCCGCGATCGTTTTCAAGTCATGCACAAGTTCTATGCTAAGGTCACGGGTGGACAGTACGCCAGCAACGAGCAGGCATTGGTCAAGCGATTTTGGAAGGTCAACAACCATGTAGTGTACAACCATCAGGAAGCAGGGAAATACGAGAATCATACGGAGAACGCGTTGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCTTCTAATCCTGTATATGCGACATTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAATAAAAATTGAATTTTATTTCATGAGATTCGAGTACATCAGTTACATAGCATTTGTCTGTTGCATAACGAACAGCTCTAATTACATTATTAAGACCAACTACGCCTAACCTATCTAAGTACAATAAGACCAAATGCCTGAATCTACTTAAATAAGTCGTCCCAGAAGCTCGAACTGATGTCGTCCAAACTTGGAAGTTCAGGAATGCTTTGCGTAGATTCAGCGCCTTCCTGATGTTGTAATTGAACCGGATTTGTATGTGATAGACCCTGCTCGTTGTGTATAATGGGTCCTCTACTCGGCACATCTTGAAATAGAGGGGATTTGGAACCTCCCAAATAAAAACGGAATTCTCTGCCTGAGACGCAGTGATGTTCTCCCCTGTGAGTGAATCCATGATCGGCGCAGTTGATGTGAAGGAATATGGAACAGCCGCAGTTCAAGTCGATCCGCCTACGACGAATAGCTCTCTTCTTGGCTAGCCTGTGCTGTGGTTTTATAGAGGGGGGCGTCGAGGAAGACGAATTTAGCATTTTTTAATGTCCAAGCTCTCAGTGCAGCATTTTCCTCTTTGTCGAGGAAATCTTTATAGCTGCCCCCCTCTCCTGGATTGCACAGCACGATTGATGGGATACCACCTTTAATTTGAACCGGCTTTCCATATTTACAGTTGGACTGCCAATCCTTTTGGGCCCCAATCAATTCTTTCCAGTGCTTTAGCTTTAGGTAGTGCGGTGCGACATCATCAATGACGTTATACTCCACATGATTGGAGTAAACCCTAGAATTGAAATCTAAATGACCGCTCAAGTAGTTATGTGGGCCTAAAGCACGAGCCCACATTGTCTTGCCCGTTCGTGATTCCCCTTCGACGATAATACTAATAGGTCTCTCTGGCCGCGCAGCGGAACCCCTCCCGAAATAATGATCAGCCCACTCTTGCAAATCAACCGGGACGTTAACAAACGACGAGAGTCTGAACGGCGGAACCCAAGGTTCGGGAGGCTTTTGAAAGAGGCGATCGATGTTAGCCTTTACGTTATGGTAACTGACGATGAACGTTCTAGGATCGCCAGCTTTTATAATGTCGAGAGCCTCTCCCGCACTTCCTGCATTGACGGCGTTATGGTAGACGTCGTCTTTATTTGATTTTGACCCCCCAAACACCTTATATTTCCCGGATTCACAATAATCACCCTCTTTGGTGATGTAATTCTTGACGGCGTTGGTGTCTTTGGCAGCCTGAATGTTTGGGTGAAAACAGGCTGACCGTCTGGGGTGAGTAATGTCGAAAAATCTAGCATCCTTGATGTTGGACTTGCCAGATAATTGTATGAGGCAGTGTAAGTGCGGGAACCCATCGCGATGTTCCTCTCTGGCGACTCGGATGTACGACGGTTTAACGATCGACCACGGTAGGTTGTGAAGCAACTGAAGAAATTCATCTTTGGGAACATCGCATTGAGGATATGTCAAGAAAATATTTTTAGCCTGTAAACGAAAGGAATTAGGGTTCCGTGGCATATTTGTAAATATGAGCCAGGACTCCAGGAGAGCTCTCTCAAAAAGTCTATTGTTGCTGGAGTCCTGGAGTCCCATTTATACTAAAAGCCTCTAGGACTCCAAGGGACACGTGGTGCACATCGGCCATCCGCAATAATATT

NC_009491
ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTGGAGTCCTCCGTTCTCGGCCCAGGCCCAAGCGCCCTCTCTTGATGGTGGAAGGGACCACATACAAAAGACAAATACAGCTGGCCAATCATATTGCGTCTGACGAGTCTGCATATTAACGACTTCCTCGATAAGTTGTGGTCCTGTAACTGTAATATGTTGACGGCACTTTCCGCTTTAATTCAAAACTTAGACGCGGAGTGCCCTAATTGTCTAACGAGTTTATCTCACAACCTCTGTGGTAATGGACCACAATCGACAACATCTTGACATATCCTCAATGCGATGTTCCCAAAGATGTGTTCGACCAATGGTTGTTCAGCTACATAGATTAGGTAATATGTATAGGACACATGACCTGTGTAGTTAAATACGTTAGTGACTGGATTGGAGAACACATCTCTTCATTATAGTCATATTGGTCAATATGTATTCTTCTAAAAACAGACGTGGTGGGTCTTCTAGGCAACGACGAAGTTATTCTCGATCAATATGGTTGAAGCGCCAATATGACATGCGACGTCCCGCTGTTACGCGTTTAACGAATAGTCATAACAAGACCGACGAGGATGCTAAGCTATCGACACAGCGGATTCACGAAGACCAGTTCGGTCCGGAGTTTGTACTTGCCCATAATACAGCCATTTCGACATACATTACTTACCCTAGTATTGTTAAGACCGAACCCAATCGGACCAGGTCTTATATCAAGTTAAAACGCCTACGTTATAAAGGTACTCTGAAGGTCGAGCGTGTACATGCCGATGTGAATATGGACGGTGCAAGTTCAAGGATCGAGGGCGTTTTTTCTATGGTTATTGTTGTCGACCGTAAACCCCATTTGAATCCTTCGGGGTGTTTACATACATTTGATGAGCTATTCGGTGCAAGGATCCACAGTCATGGTAATTTGGCAATCACTTCTTCACTGAAGGATCGCTTCTACATTCGACATGTATTCAAGCGTGTGATATCAGTCGAGAAGGATAGTCTTATGGTTGATCTAGAAGGGACGACGTACATGTCGAACAAGCGGATTAACTGTTGGGCATCGTTTAGGGATTTAGAGCGTGATTCATGTAACGGGGTTTACGCTAATATAAGCAAGAACGCCCTACTAATTTATTATTGCTGGATGTCCGATGCTATGTCTAAGGCATCGACTTTTGTATCATTTGATTTGGACTATATTGGATGAACAGGTTTATATTGAACGACATAATAAATTACATGTTATACATTACATGCTCAAAATCAACACTCAAATAAATAAATGTCCGACATTTATCCCAACGTCTTAGGATGTGAAGGGACACAGTTGGTGTTAATGCACTCTTGCACAGTCGATCTGACTAGCTCGTTCAACTGCGACATGGACATGGTTATATTGGACTGTGTCCTTTGGGCTCCCACTATTGAGGCCGACTCACCGGGGTCCAAGATAGGCGTCGATAACCGGTTGAGTTCTCGATAGGGATGCAACGCGTCTGTTGTGTCCGAGCCCGCATTTGTATGGCCCATTCCTATAGCACTTCTTGTGGCCCAGGATTCTCCTGGGTTTATTTCAATTGGGCTTGGAAGCCCATACCTGTGAGAGGATGCGGATCGGACCATTCTTCTCTCCCATTTCCCATACCCAACATGGTTGAAGTCTATGTCCTTATCGGTAAACTGTTTCGACAATATTTTGACTGTTGGCGCACGGAAAGGGATATCGACCGAGTGTTTAGCCGTTGACAGCTTCAGTTTACCCTTGAATTTAGCGAAATGGGTTCTCTGATGAACATTCGAGTCGCTAACTCTATAGTACAGCTTCCAAGGGATTGGGTCTTTGAGTGAGAAGAATGAAGATGAAAAGTAGTGGAGATCTATATTACATCTGATCGGAAAAGTCCACGATGCTTGTAAGGACTCATTGTCTGTCATACGTTTGTCATGGATCTCCACTATCACCGTACCAGACGCGTTGATCGGTACTTGTTGCCTATATTCTATCACACAATGGTCAATTTTCATGCAGCTACGACTCAACCGCGCACCTAATTGCGACGCCGTTGATGGGAATTGTAGGATAATCTCGGTTAGGTCATGGGAAAGCTGATATTCATCCCGGTGAGACTCTATGTAATTAAACGCATTTGGAGGTATAACCAATTGGGACTCCATCTATGGAAACTTGCCCGCGCAGCGGCACTGCTAAATCAATTTACAAGACGACGACAACTTACACCGACCGACGGGAATTTGATGAACAAGTAAATAAATAAGGATGATTTAGCTTATCGGAGTTTGCGAAAGGAAGAGAGCGATTAAGGGATAATGAAGAACAACCTAAGCGATAGTCAGATATATATAGGCAGTTCAACCTGGGAAGTGAAGTAATTAATTCGTAGTGGCATATTTGTAAATATGATGCAGGACTCCAGGGGAGCTCTCTCATAAAACCTATTGTTGCTGGAGTCCTGGAGTCCCATTTATACTAAAAGCCTCTAGGACTCCAAGGGACACGTGTTGCACATCGGCCATCCGCAATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_001249279.1
Location 198-947
Gene Name cp
Protein Name coat protein
Coding Region ATGGTTAAGAGAGATGCCCCATGGCGATTAATGGCGGGGACCCCCAAGGTTTCGCGCTCTGTCAATTATTCCCCCCGTGGTGGTCCTAAATTAGACAAGGCCGCTGCGTGGGTTAATAGGCCCATGTACAGAAAGCCCAGGATATATCGAACAGTGAGAGGGCCCGATGTTCCGAAGGGCTGTGAAGGCCCATGCAAAGTCCAGTCTTATGAGCAGCGGCACGACGTTTCCCATGTTGGTAAGGTGATGTGTATATCCGACGTGACTCGTGGTAACGGTATAACCCATCGTGTGGGGAAACGTTTTTGCGTCAAATCTGTGTACATATTAGGGAAGATTTGGATGGACGAAAACATCAAGCTGAAGAACCACACGAACAGTGTCATGTTCTGGTTGGTCCGAGACCGTAGACCGTATGGGACGCCTATGGATTTTGGGCAGGTGTTCAACATGTTCGACAACGAGCCTAGTACAGCTACTGTCAAGAACGATCTCCGCGATCGTTTTCAAGTCATGCACAAGTTCTATGCTAAGGTCACGGGTGGACAGTACGCCAGCAACGAGCAGGCATTGGTCAAGCGATTTTGGAAGGTCAACAACCATGTAGTGTACAACCATCAGGAAGCAGGGAAATACGAGAATCATACGGAGAACGCGTTGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCTTCTAATCCTGTATATGCGACATTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAA
Protein Sequence MVKRDAPWRLMAGTPKVSRSVNYSPRGGPKLDKAAAWVNRPMYRKPRIYRTVRGPDVPKGCEGPCKVQSYEQRHDVSHVGKVMCISDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVMFWLVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRFQVMHKFYAKVTGGQYASNEQALVKRFWKVNNHVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSITN

NCBI Accession YP_001249280.1
Location 944-1342
Gene Name AC3
Protein Name replication enhancer protein
Coding Region ATGGATTCACTCACAGGGGAGAACATCACTGCGTCTCAGGCAGAGAATTCCGTTTTTATTTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATGTGCCGAGTAGAGGACCCATTATACACAACGAGCAGGGTCTATCACATACAAATCCGGTTCAATTACAACATCAGGAAGGCGCTGAATCTACGCAAAGCATTCCTGAACTTCCAAGTTTGGACGACATCAGTTCGAGCTTCTGGGACGACTTATTTAAGTAGATTCAGGCATTTGGTCTTATTGTACTTAGATAGGTTAGGCGTAGTTGGTCTTAATAATGTAATTAGAGCTGTTCGTTATGCAACAGACAAATGCTATGTAACTGATGTACTCGAATCTCATGAAATAAAATTCAATTTTTATTAA
Protein Sequence MDSLTGENITASQAENSVFIWEVPNPLYFKMCRVEDPLYTTSRVYHIQIRFNYNIRKALNLRKAFLNFQVWTTSVRASGTTYLSRFRHLVLLYLDRLGVVGLNNVIRAVRYATDKCYVTDVLESHEIKFNFY

NCBI Accession YP_001249281.1
Location 1399-2469
Gene Name AC1
Protein Name replication initiator protein
Coding Region ATGCCACGGAACCCTAATTCCTTTCGTTTACAGGCTAAAAATATTTTCTTGACATATCCTCAATGCGATGTTCCCAAAGATGAATTTCTTCAGTTGCTTCACAACCTACCGTGGTCGATCGTTAAACCGTCGTACATCCGAGTCGCCAGAGAGGAACATCGCGATGGGTTCCCGCACTTACACTGCCTCATACAATTATCTGGCAAGTCCAACATCAAGGATGCTAGATTTTTCGACATTACTCACCCCAGACGGTCAGCCTGTTTTCACCCAAACATTCAGGCTGCCAAAGACACCAACGCCGTCAAGAATTACATCACCAAAGAGGGTGATTATTGTGAATCCGGGAAATATAAGGTGTTTGGGGGGTCAAAATCAAATAAAGACGACGTCTACCATAACGCCGTCAATGCAGGAAGTGCGGGAGAGGCTCTCGACATTATAAAAGCTGGCGATCCTAGAACGTTCATCGTCAGTTACCATAACGTAAAGGCTAACATCGATCGCCTCTTTCAAAAGCCTCCCGAACCTTGGGTTCCGCCGTTCAGACTCTCGTCGTTTGTTAACGTCCCGGTTGATTTGCAAGAGTGGGCTGATCATTATTTCGGGAGGGGTTCCGCTGCGCGGCCAGAGAGACCTATTAGTATTATCGTCGAAGGGGAATCACGAACGGGCAAGACAATGTGGGCTCGTGCTTTAGGCCCACATAACTACTTGAGCGGTCATTTAGATTTCAATTCTAGGGTTTACTCCAATCATGTGGAGTATAACGTCATTGATGATGTCGCACCGCACTACCTAAAGCTAAAGCACTGGAAAGAATTGATTGGGGCCCAAAAGGATTGGCAGTCCAACTGTAAATATGGAAAGCCGGTTCAAATTAAAGGTGGTATCCCATCAATCGTGCTGTGCAATCCAGGAGAGGGGGGCAGCTATAAAGATTTCCTCGACAAAGAGGAAAATGCTGCACTGAGAGCTTGGACATTAAAAAATGCTAAATTCGTCTTCCTCGACGCCCCCCTCTATAAAACCACAGCACAGGCTAGCCAAGAAGAGAGCTATTCGTCGTAG
Protein Sequence MPRNPNSFRLQAKNIFLTYPQCDVPKDEFLQLLHNLPWSIVKPSYIRVAREEHRDGFPHLHCLIQLSGKSNIKDARFFDITHPRRSACFHPNIQAAKDTNAVKNYITKEGDYCESGKYKVFGGSKSNKDDVYHNAVNAGSAGEALDIIKAGDPRTFIVSYHNVKANIDRLFQKPPEPWVPPFRLSSFVNVPVDLQEWADHYFGRGSAARPERPISIIVEGESRTGKTMWARALGPHNYLSGHLDFNSRVYSNHVEYNVIDDVAPHYLKLKHWKELIGAQKDWQSNCKYGKPVQIKGGIPSIVLCNPGEGGSYKDFLDKEENAALRAWTLKNAKFVFLDAPLYKTTAQASQEESYSS

NCBI Accession YP_001249282.1
Location 448-1218
Gene Name BV1
Protein Name nuclear-shuttle protein
Coding Region ATGTATTCTTCTAAAAACAGACGTGGTGGGTCTTCTAGGCAACGACGAAGTTATTCTCGATCAATATGGTTGAAGCGCCAATATGACATGCGACGTCCCGCTGTTACGCGTTTAACGAATAGTCATAACAAGACCGACGAGGATGCTAAGCTATCGACACAGCGGATTCACGAAGACCAGTTCGGTCCGGAGTTTGTACTTGCCCATAATACAGCCATTTCGACATACATTACTTACCCTAGTATTGTTAAGACCGAACCCAATCGGACCAGGTCTTATATCAAGTTAAAACGCCTACGTTATAAAGGTACTCTGAAGGTCGAGCGTGTACATGCCGATGTGAATATGGACGGTGCAAGTTCAAGGATCGAGGGCGTTTTTTCTATGGTTATTGTTGTCGACCGTAAACCCCATTTGAATCCTTCGGGGTGTTTACATACATTTGATGAGCTATTCGGTGCAAGGATCCACAGTCATGGTAATTTGGCAATCACTTCTTCACTGAAGGATCGCTTCTACATTCGACATGTATTCAAGCGTGTGATATCAGTCGAGAAGGATAGTCTTATGGTTGATCTAGAAGGGACGACGTACATGTCGAACAAGCGGATTAACTGTTGGGCATCGTTTAGGGATTTAGAGCGTGATTCATGTAACGGGGTTTACGCTAATATAAGCAAGAACGCCCTACTAATTTATTATTGCTGGATGTCCGATGCTATGTCTAAGGCATCGACTTTTGTATCATTTGATTTGGACTATATTGGATGA
Protein Sequence MYSSKNRRGGSSRQRRSYSRSIWLKRQYDMRRPAVTRLTNSHNKTDEDAKLSTQRIHEDQFGPEFVLAHNTAISTYITYPSIVKTEPNRTRSYIKLKRLRYKGTLKVERVHADVNMDGASSRIEGVFSMVIVVDRKPHLNPSGCLHTFDELFGARIHSHGNLAITSSLKDRFYIRHVFKRVISVEKDSLMVDLEGTTYMSNKRINCWASFRDLERDSCNGVYANISKNALLIYYCWMSDAMSKASTFVSFDLDYIG

NCBI Accession YP_001249283.1
Location 1305-2186
Gene Name BC1
Protein Name movement protein
Coding Region ATGGAGTCCCAATTGGTTATACCTCCAAATGCGTTTAATTACATAGAGTCTCACCGGGATGAATATCAGCTTTCCCATGACCTAACCGAGATTATCCTACAATTCCCATCAACGGCGTCGCAATTAGGTGCGCGGTTGAGTCGTAGCTGCATGAAAATTGACCATTGTGTGATAGAATATAGGCAACAAGTACCGATCAACGCGTCTGGTACGGTGATAGTGGAGATCCATGACAAACGTATGACAGACAATGAGTCCTTACAAGCATCGTGGACTTTTCCGATCAGATGTAATATAGATCTCCACTACTTTTCATCTTCATTCTTCTCACTCAAAGACCCAATCCCTTGGAAGCTGTACTATAGAGTTAGCGACTCGAATGTTCATCAGAGAACCCATTTCGCTAAATTCAAGGGTAAACTGAAGCTGTCAACGGCTAAACACTCGGTCGATATCCCTTTCCGTGCGCCAACAGTCAAAATATTGTCGAAACAGTTTACCGATAAGGACATAGACTTCAACCATGTTGGGTATGGGAAATGGGAGAGAAGAATGGTCCGATCCGCATCCTCTCACAGGTATGGGCTTCCAAGCCCAATTGAAATAAACCCAGGAGAATCCTGGGCCACAAGAAGTGCTATAGGAATGGGCCATACAAATGCGGGCTCGGACACAACAGACGCGTTGCATCCCTATCGAGAACTCAACCGGTTATCGACGCCTATCTTGGACCCCGGTGAGTCGGCCTCAATAGTGGGAGCCCAAAGGACACAGTCCAATATAACCATGTCCATGTCGCAGTTGAACGAGCTAGTCAGATCGACTGTGCAAGAGTGCATTAACACCAACTGTGTCCCTTCACATCCTAAGACGTTGGGATAA
Protein Sequence MESQLVIPPNAFNYIESHRDEYQLSHDLTEIILQFPSTASQLGARLSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINASGTVIVEIHDKRMTDNESLQASWTFPIRCNIDLHYFSSSFFSLKDPIPWKLYYRVSDSNVHQRTHFAKFKGKLKLSTAKHSVDIPFRAPTVKILSKQFTDKDIDFNHVGYGKWERRMVRSASSHRYGLPSPIEINPGESWATRSAIGMGHTNAGSDTTDALHPYRELNRLSTPILDPGESASIVGAQRTQSNITMSMSQLNELVRSTVQECINTNCVPSHPKTLG