Tomato leaf deformation virus


Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_000888595.1
Isolate Peru: Carabayllo
Release date 2015/2/22
Submitter Marquez-Martin,B., Aragon-Caballero,L., Fiallo-Olive,E., Navas-Castillo,J., Moriones,E.
Host
Download Genome |GFF3 |PEP |CDS

Genomic Organization


JBrowse


Genome

NC_014510
ACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTTACCCCCTTGTTAAGTTTGGGACCACACATATACGGACAAAACCTTTTGTCCAATCATAGAGCGTCTGACGAGCTTAATTATTAAATTCCTTTAGACTGAGTGGTCTATAAAGACCCAGACAAACTGTAATAATTGATATCTTTAACTCAAAATGCCTAAGCGGGATGCCCCATGGCGCTTAATGGCGGGGACCTCAAAGATTAGCCGTACCTCCAATTATTCACCCAGAGGAGGTATGGGCCCTAAATTCGACAAGAATGCGGCCTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAGTATACCGGGTTTTAAGAGGCCCAGATGTTCCCAAGGGCTGTGAGGGGCCCTGTAAGGTCCAGTCTTTCGAGCAGCGTCACGATATCTCCCGTATTGGCAAGGTCATGTGTATATCCGATGTCACCCGTGGTAACGGTATTACCCACCGAGTCGGTAAGCGTTTCTGTGTGAAGTCCGTCTATATTTTAGGTAAAATATGGATGGACGAGAACATCAAGTTGAAGAACCACACTAACAGCGTCATGTTCTGGTTGGTCAGAGACCGGAGACCCTATAGCTCTCCCATGGACTTTGGCCAGGTGTTCAACATGTTCGACAATGAGCCCAGTACTGCCACCGTGAAGAACGATCTTCGAGATCGTTTTCAGGTTATGCATAGGTTCTATGCTAAGGTCACGGGAGGTCAGTATGCCAGTAACGAGCAGGCTCTGGTGAGGCGCTTTTGGAAGGTCAACAATCATGTGGTCTATAACCATCAGGAAGCTGGGAAATACGAGAACCATACGGAGAACGCCCTATTATTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTGTATGCTACGTTGAAAATACGTAGCTATTTTTATGATTCAATAACAAATTAATAAAGTTTAATTTTTATTGAATGATTCTCAAGTACATGATTTACATATGGTTTATCTGTTGCAAATCGAACAGATCTAATTACATTGTTAATAGAAATAACTCCTAAATTATCTAAATAAAATAAAACTAAATGTCTAAATCTATTTAAATATGTCGTCCCAGAAGCTTGAACTGATGTCGTCCAGACTTGGAAGTTCAAGAAGGCTTTGTGTAGTTGAAGCGACTTCCTCAGGTTGTGGTTGAACCGTATTTGGATGTGGTATACTCTCGTCGTTGTGGACGGTATGTCTTCCACGTTCTGTATCTTGAAATAAAGGGGATTTGGTACCTCCCAGATAAAAACGGAATTCTCTGCCTGATGCACAGTGATGTTCTCCCCGGTGCGTGAATCCATTATTAACACAGTTAATATGCAGGAAGAATGAGCAGCCACAGTCTAGGTCTATGCGTTTCCTTCTGATGGGCTTTGCCTTGGCAATCTTATGCCTCGTTTTGATAGAGGGAGGAGTTGAGGAAGATGAATTTTGCATTGTGGAGTGTCCACGCTCTTAGAGCTGCATTTTCCTCTTTCTCAAGGAAGTCTTTATAGCTCTGTCCCTCTCCTGGATTGCAGAGCACGATAGAGGGTATGCCACCTTTAATTTGAATTGGCTTTCCGTATTTACAGTTTGATTGCCAATCTTTCTGGGCCCCTATCAGCTCTTTCCAATGTTTCATCTTTAAATATTGCGGACTGACGTCATCAATGACGTTATAGTCCGCTCCATTTGAATAAACTTTGGAATTAAAATCCAGGTGTCCACTCAGATAATTATGTGGGCCTAGTGCACGAGCCCACATAGTCTTACCTGTCCTTGAACATCCCTCTATTATTATACTGATAGGTCTTTCTGGCCGCGCAGCGGCACCCCTACCAAAATAATCATCAGCCCATTCTTGCATCTCCTCCGGGACGTTAGTGAAGGAGGAGAGTGGAAACGGAGGAGACCATGGCTCCGGAGCCTTCGAAAAAATTTTATCTAAATTACAATTTAAATTATGAAATTGAAATAAATATTTTTCAGGGAGTTTCTCCCTTATTATTTGGAGGGCTGCCTCTTTGCTACCGCTATTTAAGGCTTCTGCGGCAGCGTCGTTAGCAGTTTGGCTGCCTCCTCTAGCACTTCTGCCGTCGACTTGGAATTCTCCCCATTCAAGTGTATCTCCGTCCTTGTCGACGTAGGCGTTGACGTCGGTGCTGGATTTAGCTCCCTGAACGTTCGGATGGAAATGTGTTGACCTGGTTGGGGATACCAGGTCGAAGAATCTGTTATTCTTACATTGGAATTTGCCTTGGAACTGGAGTAGCACGTGGAGATGATGTTGCCCATCTTCGTGAAGTTCCCTTGCAATTTTGATATATTTCTTATTTGTGGGTGTCTCTAGATTTTGCAATTGGGAAAGTGCTTCTTCTTTGGTTAAATTGCAGTGGGGATATGTAAGAAAATAATTTTTTGCATTTATCTTAAAGGCCTTAGGTGGGGGCATTTTGGTAATAAATATTTTGGACACCGATTGGTTTGGCTTCTAAAACTTATAGCAATCGGTGTACTGGAGTCTTATTTATAGTAGGAGTTCCTAAAGGATCTAGCAACACGTGGCGGCCATCCGTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_003896041.2
Location 176-931
Gene Name AV1
Protein Name AV1
Coding Region ATGCCTAAGCGGGATGCCCCATGGCGCTTAATGGCGGGGACCTCAAAGATTAGCCGTACCTCCAATTATTCACCCAGAGGAGGTATGGGCCCTAAATTCGACAAGAATGCGGCCTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAGTATACCGGGTTTTAAGAGGCCCAGATGTTCCCAAGGGCTGTGAGGGGCCCTGTAAGGTCCAGTCTTTCGAGCAGCGTCACGATATCTCCCGTATTGGCAAGGTCATGTGTATATCCGATGTCACCCGTGGTAACGGTATTACCCACCGAGTCGGTAAGCGTTTCTGTGTGAAGTCCGTCTATATTTTAGGTAAAATATGGATGGACGAGAACATCAAGTTGAAGAACCACACTAACAGCGTCATGTTCTGGTTGGTCAGAGACCGGAGACCCTATAGCTCTCCCATGGACTTTGGCCAGGTGTTCAACATGTTCGACAATGAGCCCAGTACTGCCACCGTGAAGAACGATCTTCGAGATCGTTTTCAGGTTATGCATAGGTTCTATGCTAAGGTCACGGGAGGTCAGTATGCCAGTAACGAGCAGGCTCTGGTGAGGCGCTTTTGGAAGGTCAACAATCATGTGGTCTATAACCATCAGGAAGCTGGGAAATACGAGAACCATACGGAGAACGCCCTATTATTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTGTATGCTACGTTGAAAATACGTAGCTATTTTTATGATTCAATAACAAATTAA
Protein Sequence MPKRDAPWRLMAGTSKISRTSNYSPRGGMGPKFDKNAAWVNRPMYRKPRVYRVLRGPDVPKGCEGPCKVQSFEQRHDISRIGKVMCISDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVMFWLVRDRRPYSSPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRFQVMHRFYAKVTGGQYASNEQALVRRFWKVNNHVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRSYFYDSITN

NCBI Accession YP_003896042.1
Location 928-1326
Gene Name AC3
Protein Name AC3
Coding Region ATGGATTCACGCACCGGGGAGAACATCACTGTGCATCAGGCAGAGAATTCCGTTTTTATCTGGGAGGTACCAAATCCCCTTTATTTCAAGATACAGAACGTGGAAGACATACCGTCCACAACGACGAGAGTATACCACATCCAAATACGGTTCAACCACAACCTGAGGAAGTCGCTTCAACTACACAAAGCCTTCTTGAACTTCCAAGTCTGGACGACATCAGTTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAGATTTAGACATTTAGTTTTATTTTATTTAGATAATTTAGGAGTTATTTCTATTAACAATGTAATTAGATCTGTTCGATTTGCAACAGATAAACCATATGTAAATCATGTACTTGAGAATCATTCAATAAAAATTAAACTTTATTAA
Protein Sequence MDSRTGENITVHQAENSVFIWEVPNPLYFKIQNVEDIPSTTTRVYHIQIRFNHNLRKSLQLHKAFLNFQVWTTSVQASGTTYLNRFRHLVLFYLDNLGVISINNVIRSVRFATDKPYVNHVLENHSIKIKLY

NCBI Accession YP_003896043.1
Location 1073-1462
Gene Name AC2
Protein Name AC2
Coding Region ATGCAAAATTCATCTTCCTCAACTCCTCCCTCTATCAAAACGAGGCATAAGATTGCCAAGGCAAAGCCCATCAGAAGGAAACGCATAGACCTAGACTGTGGCTGCTCATTCTTCCTGCATATTAACTGTGTTAATAATGGATTCACGCACCGGGGAGAACATCACTGTGCATCAGGCAGAGAATTCCGTTTTTATCTGGGAGGTACCAAATCCCCTTTATTTCAAGATACAGAACGTGGAAGACATACCGTCCACAACGACGAGAGTATACCACATCCAAATACGGTTCAACCACAACCTGAGGAAGTCGCTTCAACTACACAAAGCCTTCTTGAACTTCCAAGTCTGGACGACATCAGTTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAG
Protein Sequence MQNSSSSTPPSIKTRHKIAKAKPIRRKRIDLDCGCSFFLHINCVNNGFTHRGEHHCASGREFRFYLGGTKSPLFQDTERGRHTVHNDESIPHPNTVQPQPEEVASTTQSLLELPSLDDISSSFWDDIFK

NCBI Accession YP_003896044.1
Location 1413-2459
Gene Name AC1
Protein Name AC1
Coding Region ATGCCCCCACCTAAGGCCTTTAAGATAAATGCAAAAAATTATTTTCTTACATATCCCCACTGCAATTTAACCAAAGAAGAAGCACTTTCCCAATTGCAAAATCTAGAGACACCCACAAATAAGAAATATATCAAAATTGCAAGGGAACTTCACGAAGATGGGCAACATCATCTCCACGTGCTACTCCAGTTCCAAGGCAAATTCCAATGTAAGAATAACAGATTCTTCGACCTGGTATCCCCAACCAGGTCAACACATTTCCATCCGAACGTTCAGGGAGCTAAATCCAGCACCGACGTCAACGCCTACGTCGACAAGGACGGAGATACACTTGAATGGGGAGAATTCCAAGTCGACGGCAGAAGTGCTAGAGGAGGCAGCCAAACTGCTAACGACGCTGCCGCAGAAGCCTTAAATAGCGGTAGCAAAGAGGCAGCCCTCCAAATAATAAGGGAGAAACTCCCTGAAAAATATTTATTTCAATTTCATAATTTAAATTGTAATTTAGATAAAATTTTTTCGAAGGCTCCGGAGCCATGGTCTCCTCCGTTTCCACTCTCCTCCTTCACTAACGTCCCGGAGGAGATGCAAGAATGGGCTGATGATTATTTTGGTAGGGGTGCCGCTGCGCGGCCAGAAAGACCTATCAGTATAATAATAGAGGGATGTTCAAGGACAGGTAAGACTATGTGGGCTCGTGCACTAGGCCCACATAATTATCTGAGTGGACACCTGGATTTTAATTCCAAAGTTTATTCAAATGGAGCGGACTATAACGTCATTGATGACGTCAGTCCGCAATATTTAAAGATGAAACATTGGAAAGAGCTGATAGGGGCCCAGAAAGATTGGCAATCAAACTGTAAATACGGAAAGCCAATTCAAATTAAAGGTGGCATACCCTCTATCGTGCTCTGCAATCCAGGAGAGGGACAGAGCTATAAAGACTTCCTTGAGAAAGAGGAAAATGCAGCTCTAAGAGCGTGGACACTCCACAATGCAAAATTCATCTTCCTCAACTCCTCCCTCTATCAAAACGAGGCATAA
Protein Sequence MPPPKAFKINAKNYFLTYPHCNLTKEEALSQLQNLETPTNKKYIKIARELHEDGQHHLHVLLQFQGKFQCKNNRFFDLVSPTRSTHFHPNVQGAKSSTDVNAYVDKDGDTLEWGEFQVDGRSARGGSQTANDAAAEALNSGSKEAALQIIREKLPEKYLFQFHNLNCNLDKIFSKAPEPWSPPFPLSSFTNVPEEMQEWADDYFGRGAAARPERPISIIIEGCSRTGKTMWARALGPHNYLSGHLDFNSKVYSNGADYNVIDDVSPQYLKMKHWKELIGAQKDWQSNCKYGKPIQIKGGIPSIVLCNPGEGQSYKDFLEKEENAALRAWTLHNAKFIFLNSSLYQNEA

NCBI Accession YP_003896045.1
Location 2045-2302
Gene Name AC4
Protein Name AC4
Coding Region ATGGGCAACATCATCTCCACGTGCTACTCCAGTTCCAAGGCAAATTCCAATGTAAGAATAACAGATTCTTCGACCTGGTATCCCCAACCAGGTCAACACATTTCCATCCGAACGTTCAGGGAGCTAAATCCAGCACCGACGTCAACGCCTACGTCGACAAGGACGGAGATACACTTGAATGGGGAGAATTCCAAGTCGACGGCAGAAGTGCTAGAGGAGGCAGCCAAACTGCTAACGACGCTGCCGCAGAAGCCTTAA
Protein Sequence MGNIISTCYSSSKANSNVRITDSSTWYPQPGQHISIRTFRELNPAPTSTPTSTRTEIHLNGENSKSTAEVLEEAAKLLTTLPQKP