Tomato leaf curl Moheli virus


Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_002987035.1
Isolate Comoros:Moheli, Fomboni
Release date 2018/8/26
Submitter Lefeuvre,P., Martin,D.P., Hoareau,M., Naze,F., Becker,N., Delatte,H., Reynaud,B., Lett,J.M.
Host
Download Genome |GFF3 |PEP |CDS

Genomic Organization


JBrowse


Genome

NC_038897
ACCGGATGGCCGCGCCCGAAAAAGAAAAGTGGACCCTCCCCATGATTTATTGTCCGCCAATGAGAATCGCGCGTCAAAGCTTAGATAATTGTTTTTGTCTTTATATACTTGCTCGCCAAGGAGTTGTCCCACAAAATGTGGGATCCGGATCCACTCTTAAATGAGTTCCCAGACTCTGTTCACGGTTTTCGTTGTATGCTAGCTATCAAATATTTGCAGGCCATTGAGCAAACCTACGAGCCCAATACTTTGGGCCACGAATTGATTCGTGATCTCATATCCGTTATCAGAGCTCGTGACTATGTCGAAGCGACCCGCCGATATAATCATTTCCACGCCCGCTTCGAAGGTGCGTCGAAGGTTGAACTTCGACAGCCCGTTTACCAGCCGTGCTGTTGTCCCCATTGTCCCAGGCACAAGCAGACGTCGGTCATGGACGTACAGGCCCATGTATCGAAAGCCCAGGATGTACAGAATGTACAGAAGCCCTGATGTTCCAAAGGGTTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCTTATGAGCAGAGGGATGATGTTAAACATACTGGTATTGTTCGTTGTGTTAGTGATGTTACGCGTGGTCCGGGAATTACTCATAGAGTTGGCAAGAGGTTCTGTGTTAAGTCCATTTACATTTTAGGTAAGATATGGATGGATGAAAATATCAAGAAGCAGAATCACACTAATCAGGTTATGTTTTTTTTAGTCCGTGATAGAAGGCCCTATGGTGCAGCCCCAATGGATTTTGGGCAGGTGTTTAACATGTTTGATAATGAGCCCAGCACAGCTACGGTGAAGAATGATTTGAGAGACAGGTATCAGGTTTTGCGGAAGTTTCATGCAACTGTTGTAGGTGGGCCCTCTGGGATGAAGGAACAGGCGTTAGTTAAGAGATTTTTTAAGATTAATAGTCATGTAACATATAATCATCAGGAAGCAGCTAAGTATGAGAACCATACGGAGAATGCTTTGTTGTTGTATATGGCGTGTACTCATGCCTCTAATCCAGTGTATGCTACTCTTAAGATACGAATCTACTTCTACGATTCGATCGGTAATTAATAAATATTAAATTTTATTTCATGATTTTCTGATACTTGCAGAGTATTTTTCAATACATTATACAATACATGATAAACTGCTCTAATTACATCGTTAATTGAAATAACCCCTAATCTATCTAAATACTTGAGAACCTGAGTCCTAAATACCCTTAAGAAAAGACCAGTCTGAGGCTGTGAGCTCGTCCAGACCCTGAAGTTGAGAAAACATTTGTGAATCCCCAGTTCCTTCCTCAAGTTGTGGTTGAATCTTATCTGGACTGATATGATGTCGTGGGGCATGTTGAATGGTCGGTTCTCGTGGTCGATAATCTTGAAATACAGGGGATTTTGTATCTCCCAGATAAACACGCCACTCTGTGCTTGAGCTGCAGTGATGAGTTCCCCTGTGCGAAAATCCATGGTCGATGCAGTTGATGTGGAGATAGTATGAGCAGCCGCAGTCGAGATCAATCCTTCTACGCCTCACTGCCCTCTTCTTGGCTATTCTGTGCTGGACTTTGATTGGTATTTGAGAACAGTGGCTCGTGGAGGGTGACGAAGGTCGCATTCTTTAGTGCCCAGTCTTTTAGTGGTGCATTCTTTTCCTCGTCTAGGAACTCTTTATACGAGGAAGTTGGTCCTGGATTGCAAAGGAAGATAGTGGGAATTCCGCCTTTAATTTGAATTGGCTTCCCGTATTTCGTGTTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATGAATTCCTTGAAGTGCTTCAAATAATGCGGGTCCACGTCATCAATGACGTTGTACCACGCATCATTACTGTACACCTTTGGGCTGAGATCAAGATGACCACACAAGTAATTATGTGGACCCAATGATCTGGCCCACATTGTCTTCCCCGTCCGACTATCACCCTCAATCACAATGCTAATCGGTCTCCAAGGCCGCGCAGCGGAACCCATTACGTTCTCAGACACCCAGACTTCAAGTTCTTCCGGAACTTGATTAAAAGAAGAAGAAAGAAAAGGAGAAACATAAGGAGCCGGAGGCTCTTGAAAATCCTATCTAAATTACTATTTAAATTATGATACTGTAAAACAAAATCCTTTGGAGCTAACTCCCTAATGACTCTAAGAGCCTCTGACTTACTGCCTGAGTTAATAGCTTTGGCGTAAGCGTCATTGGCTGATTGTTGTCCCCCTCTTGCAGATCGTCCATCGATCTGAAACTCTCCCCACTCAAGGGTGTCTCCGTCCTTGTCCAGATAGGACTTGACGTCAGAGCTGGACTTAGCTCCTTGTATGTTGGGGTGGAAACAGGTGCTACTGCTTGGGTGTACGCAATCGAAGAGGCGATTGTTGGTGCACGTGAGTTTTCCCTCGAATTGAATAAGGGCATGCAGATGAGGTTCCCCATTCTGGTGGTGTTCAAGGCAGATTTTAATATATTTAGGGTTAGTTGGAAGTGAGAGGTTTTGTAAGAATGATAGAAGGTGTTCTTTGCTAAGAGAACACTTTGGATAAGTGAGGAAAATGTTTTTGGCTTGAATTTTAAAACGTGGAGTTCTCATGTTGACTTGGTCAATTGGAGACACTCGGCTGTAACTCTCTCTAATGAATTGGAGACAATATATAGTGTCTCCAAATGGCATTTCTGTAATAAGCCTCATTGTAATTTGAATTTTGAAATCCAAAAGCGGCCATCCGTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_009508191.1
Location 136-492
Gene Name v2
Protein Name V2 protein
Coding Region ATGTGGGATCCGGATCCACTCTTAAATGAGTTCCCAGACTCTGTTCACGGTTTTCGTTGTATGCTAGCTATCAAATATTTGCAGGCCATTGAGCAAACCTACGAGCCCAATACTTTGGGCCACGAATTGATTCGTGATCTCATATCCGTTATCAGAGCTCGTGACTATGTCGAAGCGACCCGCCGATATAATCATTTCCACGCCCGCTTCGAAGGTGCGTCGAAGGTTGAACTTCGACAGCCCGTTTACCAGCCGTGCTGTTGTCCCCATTGTCCCAGGCACAAGCAGACGTCGGTCATGGACGTACAGGCCCATGTATCGAAAGCCCAGGATGTACAGAATGTACAGAAGCCCTGA
Protein Sequence MWDPDPLLNEFPDSVHGFRCMLAIKYLQAIEQTYEPNTLGHELIRDLISVIRARDYVEATRRYNHFHARFEGASKVELRQPVYQPCCCPHCPRHKQTSVMDVQAHVSKAQDVQNVQKP

NCBI Accession YP_009508192.1
Location 302-1078
Gene Name cp
Protein Name coat protein
Coding Region ATGTCGAAGCGACCCGCCGATATAATCATTTCCACGCCCGCTTCGAAGGTGCGTCGAAGGTTGAACTTCGACAGCCCGTTTACCAGCCGTGCTGTTGTCCCCATTGTCCCAGGCACAAGCAGACGTCGGTCATGGACGTACAGGCCCATGTATCGAAAGCCCAGGATGTACAGAATGTACAGAAGCCCTGATGTTCCAAAGGGTTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCTTATGAGCAGAGGGATGATGTTAAACATACTGGTATTGTTCGTTGTGTTAGTGATGTTACGCGTGGTCCGGGAATTACTCATAGAGTTGGCAAGAGGTTCTGTGTTAAGTCCATTTACATTTTAGGTAAGATATGGATGGATGAAAATATCAAGAAGCAGAATCACACTAATCAGGTTATGTTTTTTTTAGTCCGTGATAGAAGGCCCTATGGTGCAGCCCCAATGGATTTTGGGCAGGTGTTTAACATGTTTGATAATGAGCCCAGCACAGCTACGGTGAAGAATGATTTGAGAGACAGGTATCAGGTTTTGCGGAAGTTTCATGCAACTGTTGTAGGTGGGCCCTCTGGGATGAAGGAACAGGCGTTAGTTAAGAGATTTTTTAAGATTAATAGTCATGTAACATATAATCATCAGGAAGCAGCTAAGTATGAGAACCATACGGAGAATGCTTTGTTGTTGTATATGGCGTGTACTCATGCCTCTAATCCAGTGTATGCTACTCTTAAGATACGAATCTACTTCTACGATTCGATCGGTAATTAA
Protein Sequence MSKRPADIIISTPASKVRRRLNFDSPFTSRAVVPIVPGTSRRRSWTYRPMYRKPRMYRMYRSPDVPKGCEGPCKVQSYEQRDDVKHTGIVRCVSDVTRGPGITHRVGKRFCVKSIYILGKIWMDENIKKQNHTNQVMFFLVRDRRPYGAAPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRYQVLRKFHATVVGGPSGMKEQALVKRFFKINSHVTYNHQEAAKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSIGN

NCBI Accession YP_009508193.1
Location 1075-1479
Gene Name c3
Protein Name C3 protein
Coding Region ATGGATTTTCGCACAGGGGAACTCATCACTGCAGCTCAAGCACAGAGTGGCGTGTTTATCTGGGAGATACAAAATCCCCTGTATTTCAAGATTATCGACCACGAGAACCGACCATTCAACATGCCCCACGACATCATATCAGTCCAGATAAGATTCAACCACAACTTGAGGAAGGAACTGGGGATTCACAAATGTTTTCTCAACTTCAGGGTCTGGACGAGCTCACAGCCTCAGACTGGTCTTTTCTTAAGGGTATTTAGGACTCAGGTTCTCAAGTATTTAGATAGATTAGGGGTTATTTCAATTAACGATGTAATTAGAGCAGTTTATCATGTATTGTATAATGTATTGAAAAATACTCTGCAAGTATCAGAAAATCATGAAATAAAATTTAATATTTATTAA
Protein Sequence MDFRTGELITAAQAQSGVFIWEIQNPLYFKIIDHENRPFNMPHDIISVQIRFNHNLRKELGIHKCFLNFRVWTSSQPQTGLFLRVFRTQVLKYLDRLGVISINDVIRAVYHVLYNVLKNTLQVSENHEIKFNIY

NCBI Accession YP_009508194.1
Location 1220-1627
Gene Name c2
Protein Name C2 protein
Coding Region ATGCGACCTTCGTCACCCTCCACGAGCCACTGTTCTCAAATACCAATCAAAGTCCAGCACAGAATAGCCAAGAAGAGGGCAGTGAGGCGTAGAAGGATTGATCTCGACTGCGGCTGCTCATACTATCTCCACATCAACTGCATCGACCATGGATTTTCGCACAGGGGAACTCATCACTGCAGCTCAAGCACAGAGTGGCGTGTTTATCTGGGAGATACAAAATCCCCTGTATTTCAAGATTATCGACCACGAGAACCGACCATTCAACATGCCCCACGACATCATATCAGTCCAGATAAGATTCAACCACAACTTGAGGAAGGAACTGGGGATTCACAAATGTTTTCTCAACTTCAGGGTCTGGACGAGCTCACAGCCTCAGACTGGTCTTTTCTTAAGGGTATTTAG
Protein Sequence MRPSSPSTSHCSQIPIKVQHRIAKKRAVRRRRIDLDCGCSYYLHINCIDHGFSHRGTHHCSSSTEWRVYLGDTKSPVFQDYRPREPTIQHAPRHHISPDKIQPQLEEGTGDSQMFSQLQGLDELTASDWSFLKGI

NCBI Accession YP_009508195.1
Location 2155-2457
Gene Name c4
Protein Name C4 protein
Coding Region ATGGGGAACCTCATCTGCATGCCCTTATTCAATTCGAGGGAAAACTCACGTGCACCAACAATCGCCTCTTCGATTGCGTACACCCAAGCAGTAGCACCTGTTTCCACCCCAACATACAAGGAGCTAAGTCCAGCTCTGACGTCAAGTCCTATCTGGACAAGGACGGAGACACCCTTGAGTGGGGAGAGTTTCAGATCGATGGACGATCTGCAAGAGGGGGACAACAATCAGCCAATGACGCTTACGCCAAAGCTATTAACTCAGGCAGTAAGTCAGAGGCTCTTAGAGTCATTAGGGAGTTAG
Protein Sequence MGNLICMPLFNSRENSRAPTIASSIAYTQAVAPVSTPTYKELSPALTSSPIWTRTETPLSGESFRSMDDLQEGDNNQPMTLTPKLLTQAVSQRLLESLGS