Tomato bright yellow mosaic virus
Basic Information
Genomic Organization
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Genome
ACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTCCCCCCCTTCTTTTATTTGAATTAAAGTTAACTTTGATTTGGACCAATGATATTGCGTCTGACGAGGTTAGATATTGTTGAACAACTTGGCGACCAAGTTTTAACGGCTATAAATAGAACGTACGACTGAGATTATCTTTAATTCAAATGTCTAAGCGAGGGGCCACATGGCGCTCTCTGGAGGGGATCTCAAAGGCCCGTCGTTCTATCAATTTTTCTCCTCGTGGAGGTAATGGGCCTAGGTCCAATAAGGCCGCTGAATGGGTTAACAGGCCTATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGGATGTATAGAACCCCCGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGCCCATGTAAAGTCCAGTCGTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCCCATSTTGGTAAGGTGATATGTGTCTCGGACGTGACAAGGGGTAATGGTATTACCCACCGTGTAGGAAAACGTTTTTGTGTTAAGTCTGTGTATATTTTAGGCAAGGTATGGATGGACGAGAATATTAAGTTGAAGAACCACACCAACAGTGTTATGTTCTGGCTGGTCAGAGACCGTAGACCGTATGGTACACCTATGGACTTTGGCCAAGTTTTTAACATGTTTGACAACGAGCCTAGTACCGCAACTGTTAAGAACGATCTTCGTGACCGTTACCAAGTTATGCACAAGTTTTATGCCAAGGTGACTGGTGGACAGTATGCAAGCAACGAGCAGGCTATTGTTAAGCGTTTTTGGAGGGTGAACATTCATGTGGTATACAACCATCAAGAGGCTGGGAAGTACGAGAATCATACGGAGAACGCGTTATTATTGTATATGGCATGTACATATGCGTCGAATCCTGTGTATGCAACCTTAAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAATAAAGTTTGAATTTTATTTCATGATTCTCAAGTACATTGTGAATATAGTGTTTGTCCGTTGCGAAACGAACTGCTCTAATTACATTGTTAATTGAAATGACGCCTATATTGTCTAAATAAGCTAAAACTAACAATCTAAACCTATTTAAATATCTCGTCCCAGAAGCTGTAATCGATGTCGTCCAGATGTGGAAATTAAGGTAGGCCTTGTGGAGACCCAACGCTTTCCTGGTGTTGTGGTTGAACCGTATCTGGAGGTGATATATCCGGGTCGTTGTGTATGGTGGATCCTCCACGTCGATGATCTTGAAATAAAGGGGATTTGGAATTTCCCAGATATGTACGCCATTCTGTGCCTGAGGTGCAGTGATGTGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATATCCCGTGCATTAATGTGAAGATAAATTGAACAGCCGCACTCAAAGTCAATGCGTCGTCTTCGGATTGCTCGCCTTTTGGATACTTGAGCTTTTCTTTTAGCAGCTCTGTGTTGGACTTTGATAGAGGGGGGAGTTGATAAAGACGAATTTCGCTATGTGGAGCGTCCAATTTTTGAGAGCTGCGTTTTCCTCTTTGTCGAGGAAACATTTATAGCTGGATCCCTCTCCTGGATTGCAGAGCACGATTGAGGGGATCCCTCCTTTAATTTGAACTGGACGACCATATTTGCAATTGGATTGCCAGTCTTTTTGGGCCCCAATGAGTTCTTTCCAGTGTTTAATTTTAAAATATTTGGGGTCCACGTCGTCAATAATGTTGTACTGGGCCTCATTTGAATAGCATTTTGAATTAAAGTCGAGATGACCACTAAGATAATTGTGGACCCCCAAAGCACGTGCCCACATCGTCTTTCCCGTTCTGGAATCACCCTCAATGATAATACTGATAGGTCTCTCCGGCCGCGCAGCGGAACTTCTTCCGAAATATTCATCTGCCCACTGTTGCATCTCCTGTGGAACGTTAGTGAATGAGGAGAGTTGAAACGGAGGAACCCATGGTTCTGGAGCCTTAACGAAGATCCGTTCAAAATTTGAGCGGATGTTATGATGTTGAACGACGAAATCTTTGGGTTGTTCCTCCCTAAATATATTGAGGGCCTCCATGACTGATCCTGCGTTGAGGACCTTGGCATACGTGTCGTTGGCAGACTGCTGACCTCCTCTAGCTGATCTGCCATCGATTTGGAACACTCCATGATCAATGAAATCTCCGTCTTTTTCCACGTATGTTTTAACATCTGAGCTGCTCTTAGCTGCCTGTATGTTAGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGAGATGTAAGGTCGAACAATCTCTGGTTGGTACATTGGAATTTCCCTTCGAATTGGATGAGGACATGCAGATGAGGTTGCCCATCTTCGTGTAATTCCCTGGCAACACGAACGAATAATTTATTGACTGGTATTGTAAAGGCAAATAGTTGGGAAAGTGCTTCTTCCTTCGATAGAGAGCACTTAGGATAAGTGAGGAAATAGTTTTTGGCATTTAAACGAAATCGTTTTGGGAGTGGCATATTTGTAAATAAGAGCTTGTACACCGATTGGGAGCTCTCAAAACTTGCTGAATGAATCGGTGTATTGGTGTACAATTTATACTAGAACCCCCAATAGAACTCCCATTGTGGTCCCCAACACGTGGCGGCCATCCGTTATAATATT
Gene Information
NCBI Accession
|
YP_009506513.1
|
Location
|
171-926 |
Protein Name
|
capsid protein |
Coding Region
|
ATGTCTAAGCGAGGGGCCACATGGCGCTCTCTGGAGGGGATCTCAAAGGCCCGTCGTTCTATCAATTTTTCTCCTCGTGGAGGTAATGGGCCTAGGTCCAATAAGGCCGCTGAATGGGTTAACAGGCCTATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGGATGTATAGAACCCCCGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGCCCATGTAAAGTCCAGTCGTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCCCATSTTGGTAAGGTGATATGTGTCTCGGACGTGACAAGGGGTAATGGTATTACCCACCGTGTAGGAAAACGTTTTTGTGTTAAGTCTGTGTATATTTTAGGCAAGGTATGGATGGACGAGAATATTAAGTTGAAGAACCACACCAACAGTGTTATGTTCTGGCTGGTCAGAGACCGTAGACCGTATGGTACACCTATGGACTTTGGCCAAGTTTTTAACATGTTTGACAACGAGCCTAGTACCGCAACTGTTAAGAACGATCTTCGTGACCGTTACCAAGTTATGCACAAGTTTTATGCCAAGGTGACTGGTGGACAGTATGCAAGCAACGAGCAGGCTATTGTTAAGCGTTTTTGGAGGGTGAACATTCATGTGGTATACAACCATCAAGAGGCTGGGAAGTACGAGAATCATACGGAGAACGCGTTATTATTGTATATGGCATGTACATATGCGTCGAATCCTGTGTATGCAACCTTAAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAA |
Protein Sequence
|
MSKRGATWRSLEGISKARRSINFSPRGGNGPRSNKAAEWVNRPMYRKPRIYRMYRTPDVPRGCEGPCKVQSFEQRHDISHXGKVICVSDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKVWMDENIKLKNHTNSVMFWLVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRYQVMHKFYAKVTGGQYASNEQAIVKRFWRVNIHVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTYASNPVYATLKIRIYFYDSITN |
NCBI Accession
|
YP_009506514.1
|
Location
|
923-1321 |
Protein Name
|
AL3 |
Coding Region
|
ATGGATTCACGCACAGGGGAACACATCACTGCACCTCAGGCACAGAATGGCGTACATATCTGGGAAATTCCAAATCCCCTTTATTTCAAGATCATCGACGTGGAGGATCCACCATACACAACGACCCGGATATATCACCTCCAGATACGGTTCAACCACAACACCAGGAAAGCGTTGGGTCTCCACAAGGCCTACCTTAATTTCCACATCTGGACGACATCGATTACAGCTTCTGGGACGAGATATTTAAATAGGTTTAGATTGTTAGTTTTAGCTTATTTAGACAATATAGGCGTCATTTCAATTAACAATGTAATTAGAGCAGTTCGTTTCGCAACGGACAAACACTATATTCACAATGTACTTGAGAATCATGAAATAAAATTCAAACTTTATTAA |
Protein Sequence
|
MDSRTGEHITAPQAQNGVHIWEIPNPLYFKIIDVEDPPYTTTRIYHLQIRFNHNTRKALGLHKAYLNFHIWTTSITASGTRYLNRFRLLVLAYLDNIGVISINNVIRAVRFATDKHYIHNVLENHEIKFKLY |
NCBI Accession
|
YP_009506515.1
|
Location
|
1072-1530 |
Protein Name
|
AL2 |
Coding Region
|
ATGTTTCCTCGACAAAGAGGAAAACGCAGCTCTCAAAAATTGGACGCTCCACATAGCGAAATTCGTCTTTATCAACTCCCCCCTCTATCAAAGTCCAACACAGAGCTGCTAAAAGAAAAGCTCAAGTATCCAAAAGGCGAGCAATCCGAAGACGACGCATTGACTTTGAGTGCGGCTGTTCAATTTATCTTCACATTAATGCACGGGATATGGATTCACGCACAGGGGAACACATCACTGCACCTCAGGCACAGAATGGCGTACATATCTGGGAAATTCCAAATCCCCTTTATTTCAAGATCATCGACGTGGAGGATCCACCATACACAACGACCCGGATATATCACCTCCAGATACGGTTCAACCACAACACCAGGAAAGCGTTGGGTCTCCACAAGGCCTACCTTAATTTCCACATCTGGACGACATCGATTACAGCTTCTGGGACGAGATATTTAA |
Protein Sequence
|
MFPRQRGKRSSQKLDAPHSEIRLYQLPPLSKSNTELLKEKLKYPKGEQSEDDALTLSAAVQFIFTLMHGIWIHAQGNTSLHLRHRMAYISGKFQIPFISRSSTWRIHHTQRPGYITSRYGSTTTPGKRWVSTRPTLISTSGRHRLQLLGRDI |
NCBI Accession
|
YP_009506516.1
|
Location
|
1475-2446 |
Protein Name
|
AL1 |
Coding Region
|
ATGCCAAAAACTATTTCCTCACTTATCCTAAGTGCTCTCTATCGAAGGAAGAAGCACTTTCCCAACTATTTGCCTTTACAATACCAGTCAATAAATTATTCGTTCGTGTTGCCAGGGAATTACACGAAGATGGGCAACCTCATCTGCATGTCCTCATCCAATTCGAAGGGAAATTCCAATGTACCAACCAGAGATTGTTCGACCTTACATCTCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCTAACATACAGGCAGCTAAGAGCAGCTCAGATGTTAAAACATACGTGGAAAAAGACGGAGATTTCATTGATCATGGAGTGTTCCAAATCGATGGCAGATCAGCTAGAGGAGGTCAGCAGTCTGCCAACGACACGTATGCCAAGGTCCTCAACGCAGGATCAGTCATGGAGGCCCTCAATATATTTAGGGAGGAACAACCCAAAGATTTCGTCGTTCAACATCATAACATCCGCTCAAATTTTGAACGGATCTTCGTTAAGGCTCCAGAACCATGGGTTCCTCCGTTTCAACTCTCCTCATTCACTAACGTTCCACAGGAGATGCAACAGTGGGCAGATGAATATTTCGGAAGAAGTTCCGCTGCGCGGCCGGAGAGACCTATCAGTATTATCATTGAGGGTGATTCCAGAACGGGAAAGACGATGTGGGCACGTGCTTTGGGGGTCCACAATTATCTTAGTGGTCATCTCGACTTTAATTCAAAATGCTATTCAAATGAGGCCCAGTACAACATTATTGACGACGTGGACCCCAAATATTTTAAAATTAAACACTGGAAAGAACTCATTGGGGCCCAAAAAGACTGGCAATCCAATTGCAAATATGGTCGTCCAGTTCAAATTAAAGGAGGGATCCCCTCAATCGTGCTCTGCAATCCAGGAGAGGGATCCAGCTATAAATGTTTCCTCGACAAAGAGGAAAACGCAGCTCTCAAAAATTGGACGCTCCACATAG |
Protein Sequence
|
MPKTISSLILSALYRRKKHFPNYLPLQYQSINYSFVLPGNYTKMGNLICMSSSNSKGNSNVPTRDCSTLHLQPGQHISILTYRQLRAAQMLKHTWKKTEISLIMECSKSMADQLEEVSSLPTTRMPRSSTQDQSWRPSIYLGRNNPKISSFNIITSAQILNGSSLRLQNHGFLRFNSPHSLTFHRRCNSGQMNISEEVPLRGRRDLSVLSLRVIPERERRCGHVLWGSTIILVVISTLIQNAIQMRPSTTLLTTWTPNILKLNTGKNSLGPKKTGNPIANMVVQFKLKEGSPQSCSAIQERDPAINVSSTKRKTQLSKIGRST |