Tomato bright yellow mosaic virus


Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_002823845.1
Isolate Brazil
Release date 2018/8/25
Host
Download Genome |GFF3 |PEP |CDS

Genomic Organization


JBrowse


Genome

NC_038467
ACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTCCCCCCCTTCTTTTATTTGAATTAAAGTTAACTTTGATTTGGACCAATGATATTGCGTCTGACGAGGTTAGATATTGTTGAACAACTTGGCGACCAAGTTTTAACGGCTATAAATAGAACGTACGACTGAGATTATCTTTAATTCAAATGTCTAAGCGAGGGGCCACATGGCGCTCTCTGGAGGGGATCTCAAAGGCCCGTCGTTCTATCAATTTTTCTCCTCGTGGAGGTAATGGGCCTAGGTCCAATAAGGCCGCTGAATGGGTTAACAGGCCTATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGGATGTATAGAACCCCCGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGCCCATGTAAAGTCCAGTCGTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCCCATSTTGGTAAGGTGATATGTGTCTCGGACGTGACAAGGGGTAATGGTATTACCCACCGTGTAGGAAAACGTTTTTGTGTTAAGTCTGTGTATATTTTAGGCAAGGTATGGATGGACGAGAATATTAAGTTGAAGAACCACACCAACAGTGTTATGTTCTGGCTGGTCAGAGACCGTAGACCGTATGGTACACCTATGGACTTTGGCCAAGTTTTTAACATGTTTGACAACGAGCCTAGTACCGCAACTGTTAAGAACGATCTTCGTGACCGTTACCAAGTTATGCACAAGTTTTATGCCAAGGTGACTGGTGGACAGTATGCAAGCAACGAGCAGGCTATTGTTAAGCGTTTTTGGAGGGTGAACATTCATGTGGTATACAACCATCAAGAGGCTGGGAAGTACGAGAATCATACGGAGAACGCGTTATTATTGTATATGGCATGTACATATGCGTCGAATCCTGTGTATGCAACCTTAAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAATAAAGTTTGAATTTTATTTCATGATTCTCAAGTACATTGTGAATATAGTGTTTGTCCGTTGCGAAACGAACTGCTCTAATTACATTGTTAATTGAAATGACGCCTATATTGTCTAAATAAGCTAAAACTAACAATCTAAACCTATTTAAATATCTCGTCCCAGAAGCTGTAATCGATGTCGTCCAGATGTGGAAATTAAGGTAGGCCTTGTGGAGACCCAACGCTTTCCTGGTGTTGTGGTTGAACCGTATCTGGAGGTGATATATCCGGGTCGTTGTGTATGGTGGATCCTCCACGTCGATGATCTTGAAATAAAGGGGATTTGGAATTTCCCAGATATGTACGCCATTCTGTGCCTGAGGTGCAGTGATGTGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATATCCCGTGCATTAATGTGAAGATAAATTGAACAGCCGCACTCAAAGTCAATGCGTCGTCTTCGGATTGCTCGCCTTTTGGATACTTGAGCTTTTCTTTTAGCAGCTCTGTGTTGGACTTTGATAGAGGGGGGAGTTGATAAAGACGAATTTCGCTATGTGGAGCGTCCAATTTTTGAGAGCTGCGTTTTCCTCTTTGTCGAGGAAACATTTATAGCTGGATCCCTCTCCTGGATTGCAGAGCACGATTGAGGGGATCCCTCCTTTAATTTGAACTGGACGACCATATTTGCAATTGGATTGCCAGTCTTTTTGGGCCCCAATGAGTTCTTTCCAGTGTTTAATTTTAAAATATTTGGGGTCCACGTCGTCAATAATGTTGTACTGGGCCTCATTTGAATAGCATTTTGAATTAAAGTCGAGATGACCACTAAGATAATTGTGGACCCCCAAAGCACGTGCCCACATCGTCTTTCCCGTTCTGGAATCACCCTCAATGATAATACTGATAGGTCTCTCCGGCCGCGCAGCGGAACTTCTTCCGAAATATTCATCTGCCCACTGTTGCATCTCCTGTGGAACGTTAGTGAATGAGGAGAGTTGAAACGGAGGAACCCATGGTTCTGGAGCCTTAACGAAGATCCGTTCAAAATTTGAGCGGATGTTATGATGTTGAACGACGAAATCTTTGGGTTGTTCCTCCCTAAATATATTGAGGGCCTCCATGACTGATCCTGCGTTGAGGACCTTGGCATACGTGTCGTTGGCAGACTGCTGACCTCCTCTAGCTGATCTGCCATCGATTTGGAACACTCCATGATCAATGAAATCTCCGTCTTTTTCCACGTATGTTTTAACATCTGAGCTGCTCTTAGCTGCCTGTATGTTAGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGAGATGTAAGGTCGAACAATCTCTGGTTGGTACATTGGAATTTCCCTTCGAATTGGATGAGGACATGCAGATGAGGTTGCCCATCTTCGTGTAATTCCCTGGCAACACGAACGAATAATTTATTGACTGGTATTGTAAAGGCAAATAGTTGGGAAAGTGCTTCTTCCTTCGATAGAGAGCACTTAGGATAAGTGAGGAAATAGTTTTTGGCATTTAAACGAAATCGTTTTGGGAGTGGCATATTTGTAAATAAGAGCTTGTACACCGATTGGGAGCTCTCAAAACTTGCTGAATGAATCGGTGTATTGGTGTACAATTTATACTAGAACCCCCAATAGAACTCCCATTGTGGTCCCCAACACGTGGCGGCCATCCGTTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_009506513.1
Location 171-926
Protein Name capsid protein
Coding Region ATGTCTAAGCGAGGGGCCACATGGCGCTCTCTGGAGGGGATCTCAAAGGCCCGTCGTTCTATCAATTTTTCTCCTCGTGGAGGTAATGGGCCTAGGTCCAATAAGGCCGCTGAATGGGTTAACAGGCCTATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGGATGTATAGAACCCCCGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGCCCATGTAAAGTCCAGTCGTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCCCATSTTGGTAAGGTGATATGTGTCTCGGACGTGACAAGGGGTAATGGTATTACCCACCGTGTAGGAAAACGTTTTTGTGTTAAGTCTGTGTATATTTTAGGCAAGGTATGGATGGACGAGAATATTAAGTTGAAGAACCACACCAACAGTGTTATGTTCTGGCTGGTCAGAGACCGTAGACCGTATGGTACACCTATGGACTTTGGCCAAGTTTTTAACATGTTTGACAACGAGCCTAGTACCGCAACTGTTAAGAACGATCTTCGTGACCGTTACCAAGTTATGCACAAGTTTTATGCCAAGGTGACTGGTGGACAGTATGCAAGCAACGAGCAGGCTATTGTTAAGCGTTTTTGGAGGGTGAACATTCATGTGGTATACAACCATCAAGAGGCTGGGAAGTACGAGAATCATACGGAGAACGCGTTATTATTGTATATGGCATGTACATATGCGTCGAATCCTGTGTATGCAACCTTAAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAA
Protein Sequence MSKRGATWRSLEGISKARRSINFSPRGGNGPRSNKAAEWVNRPMYRKPRIYRMYRTPDVPRGCEGPCKVQSFEQRHDISHXGKVICVSDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKVWMDENIKLKNHTNSVMFWLVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRYQVMHKFYAKVTGGQYASNEQAIVKRFWRVNIHVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTYASNPVYATLKIRIYFYDSITN

NCBI Accession YP_009506514.1
Location 923-1321
Protein Name AL3
Coding Region ATGGATTCACGCACAGGGGAACACATCACTGCACCTCAGGCACAGAATGGCGTACATATCTGGGAAATTCCAAATCCCCTTTATTTCAAGATCATCGACGTGGAGGATCCACCATACACAACGACCCGGATATATCACCTCCAGATACGGTTCAACCACAACACCAGGAAAGCGTTGGGTCTCCACAAGGCCTACCTTAATTTCCACATCTGGACGACATCGATTACAGCTTCTGGGACGAGATATTTAAATAGGTTTAGATTGTTAGTTTTAGCTTATTTAGACAATATAGGCGTCATTTCAATTAACAATGTAATTAGAGCAGTTCGTTTCGCAACGGACAAACACTATATTCACAATGTACTTGAGAATCATGAAATAAAATTCAAACTTTATTAA
Protein Sequence MDSRTGEHITAPQAQNGVHIWEIPNPLYFKIIDVEDPPYTTTRIYHLQIRFNHNTRKALGLHKAYLNFHIWTTSITASGTRYLNRFRLLVLAYLDNIGVISINNVIRAVRFATDKHYIHNVLENHEIKFKLY

NCBI Accession YP_009506515.1
Location 1072-1530
Protein Name AL2
Coding Region ATGTTTCCTCGACAAAGAGGAAAACGCAGCTCTCAAAAATTGGACGCTCCACATAGCGAAATTCGTCTTTATCAACTCCCCCCTCTATCAAAGTCCAACACAGAGCTGCTAAAAGAAAAGCTCAAGTATCCAAAAGGCGAGCAATCCGAAGACGACGCATTGACTTTGAGTGCGGCTGTTCAATTTATCTTCACATTAATGCACGGGATATGGATTCACGCACAGGGGAACACATCACTGCACCTCAGGCACAGAATGGCGTACATATCTGGGAAATTCCAAATCCCCTTTATTTCAAGATCATCGACGTGGAGGATCCACCATACACAACGACCCGGATATATCACCTCCAGATACGGTTCAACCACAACACCAGGAAAGCGTTGGGTCTCCACAAGGCCTACCTTAATTTCCACATCTGGACGACATCGATTACAGCTTCTGGGACGAGATATTTAA
Protein Sequence MFPRQRGKRSSQKLDAPHSEIRLYQLPPLSKSNTELLKEKLKYPKGEQSEDDALTLSAAVQFIFTLMHGIWIHAQGNTSLHLRHRMAYISGKFQIPFISRSSTWRIHHTQRPGYITSRYGSTTTPGKRWVSTRPTLISTSGRHRLQLLGRDI

NCBI Accession YP_009506516.1
Location 1475-2446
Protein Name AL1
Coding Region ATGCCAAAAACTATTTCCTCACTTATCCTAAGTGCTCTCTATCGAAGGAAGAAGCACTTTCCCAACTATTTGCCTTTACAATACCAGTCAATAAATTATTCGTTCGTGTTGCCAGGGAATTACACGAAGATGGGCAACCTCATCTGCATGTCCTCATCCAATTCGAAGGGAAATTCCAATGTACCAACCAGAGATTGTTCGACCTTACATCTCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCTAACATACAGGCAGCTAAGAGCAGCTCAGATGTTAAAACATACGTGGAAAAAGACGGAGATTTCATTGATCATGGAGTGTTCCAAATCGATGGCAGATCAGCTAGAGGAGGTCAGCAGTCTGCCAACGACACGTATGCCAAGGTCCTCAACGCAGGATCAGTCATGGAGGCCCTCAATATATTTAGGGAGGAACAACCCAAAGATTTCGTCGTTCAACATCATAACATCCGCTCAAATTTTGAACGGATCTTCGTTAAGGCTCCAGAACCATGGGTTCCTCCGTTTCAACTCTCCTCATTCACTAACGTTCCACAGGAGATGCAACAGTGGGCAGATGAATATTTCGGAAGAAGTTCCGCTGCGCGGCCGGAGAGACCTATCAGTATTATCATTGAGGGTGATTCCAGAACGGGAAAGACGATGTGGGCACGTGCTTTGGGGGTCCACAATTATCTTAGTGGTCATCTCGACTTTAATTCAAAATGCTATTCAAATGAGGCCCAGTACAACATTATTGACGACGTGGACCCCAAATATTTTAAAATTAAACACTGGAAAGAACTCATTGGGGCCCAAAAAGACTGGCAATCCAATTGCAAATATGGTCGTCCAGTTCAAATTAAAGGAGGGATCCCCTCAATCGTGCTCTGCAATCCAGGAGAGGGATCCAGCTATAAATGTTTCCTCGACAAAGAGGAAAACGCAGCTCTCAAAAATTGGACGCTCCACATAG
Protein Sequence MPKTISSLILSALYRRKKHFPNYLPLQYQSINYSFVLPGNYTKMGNLICMSSSNSKGNSNVPTRDCSTLHLQPGQHISILTYRQLRAAQMLKHTWKKTEISLIMECSKSMADQLEEVSSLPTTRMPRSSTQDQSWRPSIYLGRNNPKISSFNIITSAQILNGSSLRLQNHGFLRFNSPHSLTFHRRCNSGQMNISEEVPLRGRRDLSVLSLRVIPERERRCGHVLWGSTIILVVISTLIQNAIQMRPSTTLLTTWTPNILKLNTGKNSLGPKKTGNPIANMVVQFKLKEGSPQSCSAIQERDPAINVSSTKRKTQLSKIGRST