Telfairia golden mosaic virus


Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_001678335.4
Isolate Cameroon
Release date 2018/8/7
Submitter Leke,W.N., Khatabi,B., Fondong,V.N., Brown,J.K.
Host
Vector
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Genomic Organization


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Genome

NC_030403
ACCGGATGGCCGCCCGCCCATCTCAGCCGTACGGTCCCACGCACTACTTCCTGTCGGCCAATCATAATGCACGCTGAAAGCTACTCTGCGTATGTGTTGTCTTTATATACGTGGTCCCCATACTTCCATTATCGCAATATGTGGGACCCCCTTCTGAATGAGTTTCCCGAATCAGTTCACGGTTTCCGGTCTATGTTAGCCGTAAAGTATTTGCAGGCTGTGGAGCAGACGTACGAGCCCAACACGTTGGGCCACGATTTGATTCGGGATTTGATTTGTGTTATACGTGCCAAGGACTATGTCGAAGCGACCCGGAGATATAATTATTTCCACGCCCGTCTCGAAGGTGCGTCGAAGGCTGAACTTCGACAGCCCATATACCAACCGTGTTGCTGTCCCCATTGTCCAAGGCACAAGCAAACGACGATCATGGACGTATCGTCCCAGTTACCGAAAGCCCAGGATGTACAGGATGTACAGAAGTCCTGATGTCCCACGTGGCTGTGAAGGACCATGTAAGATCCAGTCGTTTGATCAGCGTGATTCAGTCGTCCATACCGGTAATGTTAGGTGTCTAAGCGATGTGACTCGCGGTGGTGGTTTAACACATCGCACTGGTAAACGGTTTTGTATTAAGTCAATTTACGTCTTAGGTAAGGTATGGATGGACGAGAATGTTAAAAAGTCCAACCACACTAACACATGTATGTTTTGGTTAGTTAGAGATAGACGTCCGTATGGTAACAGTCCTCAGGACTTTGGTCAGGTTTTTAACATGTTTGATAATGAGCCGAGTACCGCAACAGTTATGAACGACAAGCGTGATCGCTATCAGGTATTGCGGAGGTTCCAGGTAACTGTAACCGGAGGCCCGTCTGGATGTAAGGAGGCTGCTATTGTGAAGAGATTCTTTCGTCTCAATCACCATGTCACTTACAACCACCAGGAGGGCGCTAAGTACGAGAATCACACGGAGAATGCTTTGCTTTTGTATATGGCGTGTACTCACGCCTCTAACCCTGTGTATGCAAGTTTGAAGATACGGATGTATTTTTATGATTCCGTGTTAAATTAATAAAGCTTGAATTTTATATCATGTTTGTCAATTACATCAATCGTCCCGTCTAGGACGTCAAACAGTACATGAGCGACAGCTCTAACGACAAAATTAATGGAAATTACACCGACCATATCTAGGTATTTCACAACCTGAGTCCTAAAGACTTTTAAGAAAAGACCAGTCGGAGGACGTAAGGTCGTCCAGACTTTGAAGTTCAGAAAACACTTGTGAATCCCCAGTTCCTTCCTCAGGTTGTGGTTGAACCGGATTTGAATTGATATTATGTCGTGGGGGAACGAGAAGGGCCGTTCCGCGTGGTCTATTATTTTGAAGTACAGGGGATTGTGTATCGTCCAAAAGTAGACGGAATTCTGCGCTTGATCCGCAGTGATGAGTTCCCCGGTGCGCAAATCCATTCAGAGCGCAGTCTATGTGCAGGTAGAACGAGCAGCCGCAATCGAGATCAATGCGCTTCCGTCGTATCGCCTTCTTCTTGGCGATTTGGTGACTGACCTTGATCGGCACTTGAGAACAGTGGCTCTTGGATGGTGACGAAGCTCGCATTCTTTAATGCCCAAGCTTTCAAAGCTGCATTCTTTTCTTCGTCCAAGAAATCTTTATACGAGGACGTCGACCCAGGATTGCACAGGAAGATAGTGGGAATTCCGCCTTTAATTTGAATCGGCTTTCCGTACTTTGTGTTGCTTTGCCAGTCCCGCTGGGCCCCCATGAATTCCTTAAAGTGCTTTAGATAGTGCGGGTCGACGTCATCAATGACGTTATACCATGCTTCGTTACTGTACACCTTTGGGCTTAGGTCCAAATGACCGCACAGATAATTGTGCGGACCCAACGAACGGGCCCAACAAGTTTTGCCCGTCCTACTATCCCCCTCTATTACTATACTATTGGGCCTAAAAGGCCGCGCAGCTGCAGGCTTGACGTTTTCACTGACCCATTCTTCAAGTTCCTCCGGAACTCTCGTGAAAGAAGACGACCGGAAGGGAGATGTGTATGTTTCCGGCGGAGTCTGGAAAATACGATCTAAATTACTGTTTAAATTGTGAAAATGTAATAAATAATCCTTGGGGGCCAACTCTCGTATTACATTAAGAGCCTCCGATTTACTTCCTGTGTTAAGTGCCTTTGCATATGCGTCGTTAGCTGATTGTTGGCCCCCTCGTGCCGATCTCCCGTCGATCTGAAACTCTCCCCATTCGAGTGTATCTCCGTCCTTGTCCAAATACGACTTGACGTCGGAACTGGACTTAGCGCCCTGAATGTTGGGGTGGAAACTGGTGCTACAGCTTGGGTGTACACAATCGAAGAGACGATTGTTGGTGCACGTGAGTTTCCCCTCGAACTGGATAAGCACGTGGAGATGAGGCTCCCCATTCTGATGAAGCTCTCGACAGATTTTGATGTATTTAGGATTTGTGGGAAGCGACAGGTTTCGGAGAAACGCCAAGAGAGCCTCTTTTGCGATAGAGCATTTGGGATATGTGAGGAATATATTTTTACCCTGTACTCTAAAACGTGGGTGTCTCATTTTGACAATCGATTGGAGACACCCTCCCGCAACTCTATCCCTTATAATAGAGTCAATATATACTGTCTCTATATGGCATTATTGTAAATATGTAAAGGTATACAGACCTACTAGCGGCCATCCGTTTAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_009259492.1
Location 67-489
Protein Name AV2
Coding Region ATGCACGCTGAAAGCTACTCTGCGTATGTGTTGTCTTTATATACGTGGTCCCCATACTTCCATTATCGCAATATGTGGGACCCCCTTCTGAATGAGTTTCCCGAATCAGTTCACGGTTTCCGGTCTATGTTAGCCGTAAAGTATTTGCAGGCTGTGGAGCAGACGTACGAGCCCAACACGTTGGGCCACGATTTGATTCGGGATTTGATTTGTGTTATACGTGCCAAGGACTATGTCGAAGCGACCCGGAGATATAATTATTTCCACGCCCGTCTCGAAGGTGCGTCGAAGGCTGAACTTCGACAGCCCATATACCAACCGTGTTGCTGTCCCCATTGTCCAAGGCACAAGCAAACGACGATCATGGACGTATCGTCCCAGTTACCGAAAGCCCAGGATGTACAGGATGTACAGAAGTCCTGA
Protein Sequence MHAESYSAYVLSLYTWSPYFHYRNMWDPLLNEFPESVHGFRSMLAVKYLQAVEQTYEPNTLGHDLIRDLICVIRAKDYVEATRRYNYFHARLEGASKAELRQPIYQPCCCPHCPRHKQTTIMDVSSQLPKAQDVQDVQKS

NCBI Accession YP_009259493.1
Location 299-1075
Protein Name AV1
Coding Region ATGTCGAAGCGACCCGGAGATATAATTATTTCCACGCCCGTCTCGAAGGTGCGTCGAAGGCTGAACTTCGACAGCCCATATACCAACCGTGTTGCTGTCCCCATTGTCCAAGGCACAAGCAAACGACGATCATGGACGTATCGTCCCAGTTACCGAAAGCCCAGGATGTACAGGATGTACAGAAGTCCTGATGTCCCACGTGGCTGTGAAGGACCATGTAAGATCCAGTCGTTTGATCAGCGTGATTCAGTCGTCCATACCGGTAATGTTAGGTGTCTAAGCGATGTGACTCGCGGTGGTGGTTTAACACATCGCACTGGTAAACGGTTTTGTATTAAGTCAATTTACGTCTTAGGTAAGGTATGGATGGACGAGAATGTTAAAAAGTCCAACCACACTAACACATGTATGTTTTGGTTAGTTAGAGATAGACGTCCGTATGGTAACAGTCCTCAGGACTTTGGTCAGGTTTTTAACATGTTTGATAATGAGCCGAGTACCGCAACAGTTATGAACGACAAGCGTGATCGCTATCAGGTATTGCGGAGGTTCCAGGTAACTGTAACCGGAGGCCCGTCTGGATGTAAGGAGGCTGCTATTGTGAAGAGATTCTTTCGTCTCAATCACCATGTCACTTACAACCACCAGGAGGGCGCTAAGTACGAGAATCACACGGAGAATGCTTTGCTTTTGTATATGGCGTGTACTCACGCCTCTAACCCTGTGTATGCAAGTTTGAAGATACGGATGTATTTTTATGATTCCGTGTTAAATTAA
Protein Sequence MSKRPGDIIISTPVSKVRRRLNFDSPYTNRVAVPIVQGTSKRRSWTYRPSYRKPRMYRMYRSPDVPRGCEGPCKIQSFDQRDSVVHTGNVRCLSDVTRGGGLTHRTGKRFCIKSIYVLGKVWMDENVKKSNHTNTCMFWLVRDRRPYGNSPQDFGQVFNMFDNEPSTATVMNDKRDRYQVLRRFQVTVTGGPSGCKEAAIVKRFFRLNHHVTYNHQEGAKYENHTENALLLYMACTHASNPVYASLKIRMYFYDSVLN

NCBI Accession YP_009259494.1
Location 1072-1476
Protein Name AC3
Coding Region ATGGATTTGCGCACCGGGGAACTCATCACTGCGGATCAAGCGCAGAATTCCGTCTACTTTTGGACGATACACAATCCCCTGTACTTCAAAATAATAGACCACGCGGAACGGCCCTTCTCGTTCCCCCACGACATAATATCAATTCAAATCCGGTTCAACCACAACCTGAGGAAGGAACTGGGGATTCACAAGTGTTTTCTGAACTTCAAAGTCTGGACGACCTTACGTCCTCCGACTGGTCTTTTCTTAAAAGTCTTTAGGACTCAGGTTGTGAAATACCTAGATATGGTCGGTGTAATTTCCATTAATTTTGTCGTTAGAGCTGTCGCTCATGTACTGTTTGACGTCCTAGACGGGACGATTGATGTAATTGACAAACATGATATAAAATTCAAGCTTTATTAA
Protein Sequence MDLRTGELITADQAQNSVYFWTIHNPLYFKIIDHAERPFSFPHDIISIQIRFNHNLRKELGIHKCFLNFKVWTTLRPPTGLFLKVFRTQVVKYLDMVGVISINFVVRAVAHVLFDVLDGTIDVIDKHDIKFKLY

NCBI Accession YP_009259495.1
Location 1217-1624
Protein Name AC2
Coding Region ATGCGAGCTTCGTCACCATCCAAGAGCCACTGTTCTCAAGTGCCGATCAAGGTCAGTCACCAAATCGCCAAGAAGAAGGCGATACGACGGAAGCGCATTGATCTCGATTGCGGCTGCTCGTTCTACCTGCACATAGACTGCGCTCTGAATGGATTTGCGCACCGGGGAACTCATCACTGCGGATCAAGCGCAGAATTCCGTCTACTTTTGGACGATACACAATCCCCTGTACTTCAAAATAATAGACCACGCGGAACGGCCCTTCTCGTTCCCCCACGACATAATATCAATTCAAATCCGGTTCAACCACAACCTGAGGAAGGAACTGGGGATTCACAAGTGTTTTCTGAACTTCAAAGTCTGGACGACCTTACGTCCTCCGACTGGTCTTTTCTTAAAAGTCTTTAG
Protein Sequence MRASSPSKSHCSQVPIKVSHQIAKKKAIRRKRIDLDCGCSFYLHIDCALNGFAHRGTHHCGSSAEFRLLLDDTQSPVLQNNRPRGTALLVPPRHNINSNPVQPQPEEGTGDSQVFSELQSLDDLTSSDWSFLKSL

NCBI Accession YP_009259496.1
Location 1524-2609
Protein Name AC1
Coding Region ATGAGACACCCACGTTTTAGAGTACAGGGTAAAAATATATTCCTCACATATCCCAAATGCTCTATCGCAAAAGAGGCTCTCTTGGCGTTTCTCCGAAACCTGTCGCTTCCCACAAATCCTAAATACATCAAAATCTGTCGAGAGCTTCATCAGAATGGGGAGCCTCATCTCCACGTGCTTATCCAGTTCGAGGGGAAACTCACGTGCACCAACAATCGTCTCTTCGATTGTGTACACCCAAGCTGTAGCACCAGTTTCCACCCCAACATTCAGGGCGCTAAGTCCAGTTCCGACGTCAAGTCGTATTTGGACAAGGACGGAGATACACTCGAATGGGGAGAGTTTCAGATCGACGGGAGATCGGCACGAGGGGGCCAACAATCAGCTAACGACGCATATGCAAAGGCACTTAACACAGGAAGTAAATCGGAGGCTCTTAATGTAATACGAGAGTTGGCCCCCAAGGATTATTTATTACATTTTCACAATTTAAACAGTAATTTAGATCGTATTTTCCAGACTCCGCCGGAAACATACACATCTCCCTTCCGGTCGTCTTCTTTCACGAGAGTTCCGGAGGAACTTGAAGAATGGGTCAGTGAAAACGTCAAGCCTGCAGCTGCGCGGCCTTTTAGGCCCAATAGTATAGTAATAGAGGGGGATAGTAGGACGGGCAAAACTTGTTGGGCCCGTTCGTTGGGTCCGCACAATTATCTGTGCGGTCATTTGGACCTAAGCCCAAAGGTGTACAGTAACGAAGCATGGTATAACGTCATTGATGACGTCGACCCGCACTATCTAAAGCACTTTAAGGAATTCATGGGGGCCCAGCGGGACTGGCAAAGCAACACAAAGTACGGAAAGCCGATTCAAATTAAAGGCGGAATTCCCACTATCTTCCTGTGCAATCCTGGGTCGACGTCCTCGTATAAAGATTTCTTGGACGAAGAAAAGAATGCAGCTTTGAAAGCTTGGGCATTAAAGAATGCGAGCTTCGTCACCATCCAAGAGCCACTGTTCTCAAGTGCCGATCAAGGTCAGTCACCAAATCGCCAAGAAGAAGGCGATACGACGGAAGCGCATTGA
Protein Sequence MRHPRFRVQGKNIFLTYPKCSIAKEALLAFLRNLSLPTNPKYIKICRELHQNGEPHLHVLIQFEGKLTCTNNRLFDCVHPSCSTSFHPNIQGAKSSSDVKSYLDKDGDTLEWGEFQIDGRSARGGQQSANDAYAKALNTGSKSEALNVIRELAPKDYLLHFHNLNSNLDRIFQTPPETYTSPFRSSSFTRVPEELEEWVSENVKPAAARPFRPNSIVIEGDSRTGKTCWARSLGPHNYLCGHLDLSPKVYSNEAWYNVIDDVDPHYLKHFKEFMGAQRDWQSNTKYGKPIQIKGGIPTIFLCNPGSTSSYKDFLDEEKNAALKAWALKNASFVTIQEPLFSSADQGQSPNRQEEGDTTEAH

NCBI Accession YP_009259497.1
Location 2165-2455
Protein Name AC4
Coding Region ATGGGGAGCCTCATCTCCACGTGCTTATCCAGTTCGAGGGGAAACTCACGTGCACCAACAATCGTCTCTTCGATTGTGTACACCCAAGCTGTAGCACCAGTTTCCACCCCAACATTCAGGGCGCTAAGTCCAGTTCCGACGTCAAGTCGTATTTGGACAAGGACGGAGATACACTCGAATGGGGAGAGTTTCAGATCGACGGGAGATCGGCACGAGGGGGCCAACAATCAGCTAACGACGCATATGCAAAGGCACTTAACACAGGAAGTAAATCGGAGGCTCTTAATGTAA
Protein Sequence MGSLISTCLSSSRGNSRAPTIVSSIVYTQAVAPVSTPTFRALSPVPTSSRIWTRTEIHSNGESFRSTGDRHEGANNQLTTHMQRHLTQEVNRRLLM