Stachytarpheta leaf curl virus


Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_000843765.1
Isolate China:Hainan province
Release date 2015/2/12
Submitter Zhou,X., Fan,S.
Host
Vector
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Genomic Organization


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Genome

NC_004091
CCGGATGGCCGCGATTTTTTTAAGGTGGTCCCACCCACGTGCATTGGTCGGCCACTGAGAACGCTCCCTCAAAGCCTATTTAATTCAAATGTATTATAAATACTTGGTCCCCAAGTACTAAAGCTAAACATGTGGGATCCACTTGTAAACGAGTTCCCTGAAACCGTACATGGTCTACGGTGCATGCTCGCTGTAAAATACTTGCAGTTAGTTGAGCAGACATACTCTCCGGATACGTTGGGGTACGATCTCGTGCGAGATTTAATTTTAGTTATCAGAGCTCGAGACTATGTCGAAGCGTCCCGCCGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTGCGTCGCCGGCTGAACTTCGACAGCCCGTATGTCAACCGTGCTGCTGCCCCCACTGTCCTCGTCACAAACAAAAGGAGGACGTGGGTGAATCGGCCCATGTATCGCAAGCCCAGACTATTCAGAACGTACAGAAGTCCTGATGTGCCCAAAGGTTGTGAAGGCCCATGCAAAGTCCAATCGTATGAACAGAGGCACGACATATCCCATGTGGGTAAAGTATTATGTGTTAGTGATGTCACTCGTGGTAGTGGGCTTACCCATCGTGTTGGTAAGAGATTCTGTGTGAAGTCCGTTTATGTATTGGGTAAAATATGGATGGATGAAAATATCAAGACGAAGAACCATACGAACACTGTGATGTTTTATCTTGTTCGTGATAGAAGGCCCTTTGGTACTGCTATGGACTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGATAATGAGCCCAGTACTGCTACTATCAAGAATGATCTTCGAGATCGTTATCAAGTTTTGAGGAAATTCACTTCAACAGTCACAGGTGGTCAATATGCTTCTAAGGAACAGGCGTTGGTTAGGAAATTTATGAAGATAAATAATTATGTAGTTTATAATCATCAAGAAGCTGCTAAGTATGAGAATCATACTGAGAATGCGTTATTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCAGTAATCCAGTGTATGCTACTTTGAAGATCAAAATCTATTTCTATGATTCTGTTCAGAATTAATAAAAATTGAATTTTATTATACTTGATAATTCTTCATCAATTGTCCCCTCTAATACATTGTATAATACATGAGAAAATGCCCTAATTACATTGTTTATACTAATCACTCCCAAATTGTCTAAATATTTAATACATTGATACTTAAATACTTTTAAAAAACACCAAGTCTGAGGACGTAAATGAGTCCAAATTCTGCAGATTAGAAAACATTGGTGTATCCCCAACGCTTTCCTCAGGTTGTAGTTGAATTGGACTTGGAGTGTTATTACGTCGTGGTTCGTTGAGAACGGCCTCTGGTCGTGCTGGGTGATTTTGAAATATAGGGGATTTCTGACCGTCCAGATATACACGCCATTCTCTGCTTGAGCTGCAGTGATGGGTTCCCCGGTGCGAAAATCCATGATTGTGGCAGCCTATAGCTATGAAATAAGAGCATCCACAAGGGAGGTCAACTCGTCGTCTCCTCGTTGTTCGCTTGGCTATTTTGTGTTGCACCTTGATTGGAACCTGAGTAGAGTGGCCGTTGGATGGTGACGAAGATCGCATTATGTATAGCCCAATTTTTTAATGCGGAATTCTTTTCTTCGTCTAAGAACTCTTTATAGCTGGAATTGGGTCCTGGATTGCATAGGAAGATTGTTGGGATACCACCTTTAATTTGAACTGGCTTCCCATACTTTGTATTGGATTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATGAATTCCTTAAAGTGCTTTAGATAGTGGGGGTCGACGTCATCAATGACGTTATACCAAGCATCATTGCTGTATACCTTTGGGCTGAGATCAAGATGTCCACACAGATAATTGTGTGGTCCTAACGACCTAGCCCACATTGTTTTACCAGTACGACTATCACCTTCTATCACAATACTAATCGGTCTCAAAGGCCGCGCAGCGGCATTGACAACATTATTTGCAGACCATTCATGAAGTTCTTCTGGAACTTGATCGAAAGAAGAAGAAGAAAAAGGACAAACAAATACCTCTAAAGGAGGTGCAAAAATCCTATCTAAATTAGCATTTAAATTATGAAATTGTAAAACATAATCTTTTGGAGCTAACTCCTTAATTACATTAAGAGCCTCTGACTTACTGCCTGTGTTAAGTGCTGCGGCGTAAGCGTCATTGGCTGATTGTTGTCCCCCTCTTGCAGATCGTCCGTCGATCTGAAACTCTCCCCACTCGAGGGTGTCTCCGTCCTTATCGATATAGGACTTGACGTCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGGGAGACCAAGTCGAAGAATCTGTTATTCGTGCAGACGTATTTTCCCTCGAACTGGATAAGCACGTGGATATGAGGGCTCCCATCTTCGTGAAGCTCTCTGCAGATTTTGATGTATTTTTTGTTGGTTGGGGTTTCTAGGTTTTGAAGTTGGGAGAGTGCTTCCTCTTTAGTTAGAGAGCACTGTGGATAAGTGAGGAAATAATTTTTAGCTTGTATTTTAAAACGACGCGGGGGAGGCATTTTGAGCGTCGTTTTGTATTGGAGACAATCAACTCTATGAAATGAATTGGAGACTGGAGTACAATATATAGTGTGTCTCCAAATGGCATTCTCGTAATTCCTCATAGAAATTCAAAATTTGAATTGGTAAAGCGGCCATCCGTATAATATTA

Gene Information

NCBI Accession NP_671448.1
Location 130-480
Gene Name AV2
Protein Name pre-coat protein
Coding Region ATGTGGGATCCACTTGTAAACGAGTTCCCTGAAACCGTACATGGTCTACGGTGCATGCTCGCTGTAAAATACTTGCAGTTAGTTGAGCAGACATACTCTCCGGATACGTTGGGGTACGATCTCGTGCGAGATTTAATTTTAGTTATCAGAGCTCGAGACTATGTCGAAGCGTCCCGCCGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTGCGTCGCCGGCTGAACTTCGACAGCCCGTATGTCAACCGTGCTGCTGCCCCCACTGTCCTCGTCACAAACAAAAGGAGGACGTGGGTGAATCGGCCCATGTATCGCAAGCCCAGACTATTCAGAACGTACAGAAGTCCTGA
Protein Sequence MWDPLVNEFPETVHGLRCMLAVKYLQLVEQTYSPDTLGYDLVRDLILVIRARDYVEASRRYSHFHSRIQGASPAELRQPVCQPCCCPHCPRHKQKEDVGESAHVSQAQTIQNVQKS

NCBI Accession NP_671449.1
Location 290-1063
Gene Name AV1
Protein Name coat protein
Coding Region ATGTCGAAGCGTCCCGCCGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTGCGTCGCCGGCTGAACTTCGACAGCCCGTATGTCAACCGTGCTGCTGCCCCCACTGTCCTCGTCACAAACAAAAGGAGGACGTGGGTGAATCGGCCCATGTATCGCAAGCCCAGACTATTCAGAACGTACAGAAGTCCTGATGTGCCCAAAGGTTGTGAAGGCCCATGCAAAGTCCAATCGTATGAACAGAGGCACGACATATCCCATGTGGGTAAAGTATTATGTGTTAGTGATGTCACTCGTGGTAGTGGGCTTACCCATCGTGTTGGTAAGAGATTCTGTGTGAAGTCCGTTTATGTATTGGGTAAAATATGGATGGATGAAAATATCAAGACGAAGAACCATACGAACACTGTGATGTTTTATCTTGTTCGTGATAGAAGGCCCTTTGGTACTGCTATGGACTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGATAATGAGCCCAGTACTGCTACTATCAAGAATGATCTTCGAGATCGTTATCAAGTTTTGAGGAAATTCACTTCAACAGTCACAGGTGGTCAATATGCTTCTAAGGAACAGGCGTTGGTTAGGAAATTTATGAAGATAAATAATTATGTAGTTTATAATCATCAAGAAGCTGCTAAGTATGAGAATCATACTGAGAATGCGTTATTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCAGTAATCCAGTGTATGCTACTTTGAAGATCAAAATCTATTTCTATGATTCTGTTCAGAATTAA
Protein Sequence MSKRPADIVISTPASKVRRRLNFDSPYVNRAAAPTVLVTNKRRTWVNRPMYRKPRLFRTYRSPDVPKGCEGPCKVQSYEQRHDISHVGKVLCVSDVTRGSGLTHRVGKRFCVKSVYVLGKIWMDENIKTKNHTNTVMFYLVRDRRPFGTAMDFGQVFNMYDNEPSTATIKNDLRDRYQVLRKFTSTVTGGQYASKEQALVRKFMKINNYVVYNHQEAAKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIKIYFYDSVQN

NCBI Accession NP_671450.1
Location 1060-1464
Gene Name AC3
Protein Name replication enhancer protein
Coding Region ATGGATTTTCGCACCGGGGAACCCATCACTGCAGCTCAAGCAGAGAATGGCGTGTATATCTGGACGGTCAGAAATCCCCTATATTTCAAAATCACCCAGCACGACCAGAGGCCGTTCTCAACGAACCACGACGTAATAACACTCCAAGTCCAATTCAACTACAACCTGAGGAAAGCGTTGGGGATACACCAATGTTTTCTAATCTGCAGAATTTGGACTCATTTACGTCCTCAGACTTGGTGTTTTTTAAAAGTATTTAAGTATCAATGTATTAAATATTTAGACAATTTGGGAGTGATTAGTATAAACAATGTAATTAGGGCATTTTCTCATGTATTATACAATGTATTAGAGGGGACAATTGATGAAGAATTATCAAGTATAATAAAATTCAATTTTTATTAA
Protein Sequence MDFRTGEPITAAQAENGVYIWTVRNPLYFKITQHDQRPFSTNHDVITLQVQFNYNLRKALGIHQCFLICRIWTHLRPQTWCFLKVFKYQCIKYLDNLGVISINNVIRAFSHVLYNVLEGTIDEELSSIIKFNFY

NCBI Accession NP_671451.1
Location 1205-1609
Gene Name AC2
Protein Name transcriptional activator protein
Coding Region ATGCGATCTTCGTCACCATCCAACGGCCACTCTACTCAGGTTCCAATCAAGGTGCAACACAAAATAGCCAAGCGAACAACGAGGAGACGACGAGTTGACCTCCCTTGTGGATGCTCTTATTTCATAGCTATAGGCTGCCACAATCATGGATTTTCGCACCGGGGAACCCATCACTGCAGCTCAAGCAGAGAATGGCGTGTATATCTGGACGGTCAGAAATCCCCTATATTTCAAAATCACCCAGCACGACCAGAGGCCGTTCTCAACGAACCACGACGTAATAACACTCCAAGTCCAATTCAACTACAACCTGAGGAAAGCGTTGGGGATACACCAATGTTTTCTAATCTGCAGAATTTGGACTCATTTACGTCCTCAGACTTGGTGTTTTTTAAAAGTATTTAA
Protein Sequence MRSSSPSNGHSTQVPIKVQHKIAKRTTRRRRVDLPCGCSYFIAIGCHNHGFSHRGTHHCSSSREWRVYLDGQKSPIFQNHPARPEAVLNEPRRNNTPSPIQLQPEESVGDTPMFSNLQNLDSFTSSDLVFFKSI

NCBI Accession NP_671452.1
Location 1512-2597
Gene Name AC1
Protein Name rep protein
Coding Region ATGCCTCCCCCGCGTCGTTTTAAAATACAAGCTAAAAATTATTTCCTCACTTATCCACAGTGCTCTCTAACTAAAGAGGAAGCACTCTCCCAACTTCAAAACCTAGAAACCCCAACCAACAAAAAATACATCAAAATCTGCAGAGAGCTTCACGAAGATGGGAGCCCTCATATCCACGTGCTTATCCAGTTCGAGGGAAAATACGTCTGCACGAATAACAGATTCTTCGACTTGGTCTCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAATCCAGCTCCGACGTCAAGTCCTATATCGATAAGGACGGAGACACCCTCGAGTGGGGAGAGTTTCAGATCGACGGACGATCTGCAAGAGGGGGACAACAATCAGCCAATGACGCTTACGCCGCAGCACTTAACACAGGCAGTAAGTCAGAGGCTCTTAATGTAATTAAGGAGTTAGCTCCAAAAGATTATGTTTTACAATTTCATAATTTAAATGCTAATTTAGATAGGATTTTTGCACCTCCTTTAGAGGTATTTGTTTGTCCTTTTTCTTCTTCTTCTTTCGATCAAGTTCCAGAAGAACTTCATGAATGGTCTGCAAATAATGTTGTCAATGCCGCTGCGCGGCCTTTGAGACCGATTAGTATTGTGATAGAAGGTGATAGTCGTACTGGTAAAACAATGTGGGCTAGGTCGTTAGGACCACACAATTATCTGTGTGGACATCTTGATCTCAGCCCAAAGGTATACAGCAATGATGCTTGGTATAACGTCATTGATGACGTCGACCCCCACTATCTAAAGCACTTTAAGGAATTCATGGGGGCCCAAAGGGACTGGCAATCCAATACAAAGTATGGGAAGCCAGTTCAAATTAAAGGTGGTATCCCAACAATCTTCCTATGCAATCCAGGACCCAATTCCAGCTATAAAGAGTTCTTAGACGAAGAAAAGAATTCCGCATTAAAAAATTGGGCTATACATAATGCGATCTTCGTCACCATCCAACGGCCACTCTACTCAGGTTCCAATCAAGGTGCAACACAAAATAGCCAAGCGAACAACGAGGAGACGACGAGTTGA
Protein Sequence MPPPRRFKIQAKNYFLTYPQCSLTKEEALSQLQNLETPTNKKYIKICRELHEDGSPHIHVLIQFEGKYVCTNNRFFDLVSPTRSAHFHPNIQGAKSSSDVKSYIDKDGDTLEWGEFQIDGRSARGGQQSANDAYAAALNTGSKSEALNVIKELAPKDYVLQFHNLNANLDRIFAPPLEVFVCPFSSSSFDQVPEELHEWSANNVVNAAARPLRPISIVIEGDSRTGKTMWARSLGPHNYLCGHLDLSPKVYSNDAWYNVIDDVDPHYLKHFKEFMGAQRDWQSNTKYGKPVQIKGGIPTIFLCNPGPNSSYKEFLDEEKNSALKNWAIHNAIFVTIQRPLYSGSNQGATQNSQANNEETTS

NCBI Accession NP_671453.1
Location 2150-2440
Gene Name AC4
Protein Name transcriptional regulator protein
Coding Region ATGGGAGCCCTCATATCCACGTGCTTATCCAGTTCGAGGGAAAATACGTCTGCACGAATAACAGATTCTTCGACTTGGTCTCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAATCCAGCTCCGACGTCAAGTCCTATATCGATAAGGACGGAGACACCCTCGAGTGGGGAGAGTTTCAGATCGACGGACGATCTGCAAGAGGGGGACAACAATCAGCCAATGACGCTTACGCCGCAGCACTTAACACAGGCAGTAAGTCAGAGGCTCTTAATGTAA
Protein Sequence MGALISTCLSSSRENTSARITDSSTWSPQPGQHISIRTFRELNPAPTSSPISIRTETPSSGESFRSTDDLQEGDNNQPMTLTPQHLTQAVSQRLLM