Spilanthes yellow vein virus


Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_000873265.1
Isolate Viet Nam: Dalat
Release date 2015/2/13
Submitter Ha,C., Coombs,S., Revill,P., Harding,R., Vu,M., Dale,J., Ha,C.V., Revill,P.A., Harding,R.M., Vu,M.T., Dale,J.L.
Host
Vector
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Genomic Organization


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Genome

NC_009545
ACCGGACGGCCGCGATTTTTTATACATGGCCCCACCACGCATTAACAAAGGAAAAAGGAAAAAATGGTCCCCTGGGTTTTATCCAATCAGATCTTTTATTCAAACGTTAATAATAAATGTGGTCCCCTATTAAATGCGCTCCCCCCAAGCAAAATTCAAAAAATGTGGGATCCGCTCCTCCATCCTTTTCCAGAAACCGTACATGGTTTCCGTTGTATGTTAGCCGTAAAGTATTTACAGTTAGTAGAGTCTACGTATTCCCCAGATACGTTAGGGTTTGATCTTATACGTGATTTAATTACAGTAATTAGGTGTAGTAACTATGTCGAAGCGACCAGCAAGTATTGTCATTTCCACGCCCTCATCGAAGGTACGTCGGAGACTCAACTTCGACAGCCCGTATGCGAACCGTGCCTCTGCCCCCATTGTCCGCGTCACAAAGGGTCAGGTATGGACCAACAGACCTATGTTCCGAAAGCCTCGGATGTACAGAATGTTCAGAAGCCCTGATGTTCCCAGAGGTTGTGAGGGTCCTTGTAAGGTTCAGTCTTATGATTCTAAGCATGACATTGGTCATCTTGGTAAGGTACTTTGTGTTTCGGATGTTACCCGTGGTAACGGCCTTACCCATCGTACTGGTAAACGTTTTTGTGTTAAGTCGTTGTATGTTATTGGGAAGATATGGATGGATGAGAAGATTAAGAATAAGAATCATACTAACACCGTTATGTTCTGGTTAGTTAGAGATAGAAGGCCTTCAGGTGTACCTCAGGATTTTCAACAGGTTTTTAATGTTTATGATAATGAACCTGCGACAGCTACTGTGAAGAACGATTCTCGAGATCGTTACCAGGTTTTACGGCGTTTTCAGTCTACTGTTACTGGTGGTCAGTATGCTTCTAAAGAACAGGCTATTATTCGGAAGTTTATCCGTGTAAACACACATGTGACGTATAATCATCAAGAGGATGCGAAATATGCCAATCATACGGAGAATGCTTTGTTATTGTATATGTGTTGTACTCATCATGAGAACCCTGTGTATGGAACTCTAAAGATCCGCAGTTATTTTTACGACTCGGTATCTAATTAATAAATGTTGTATTTTATATCATTTGTCTCTTCGATATCAACTGTACCGTTAAGACGTTCATACAATACATATTTAACTGCTCTAATTACATTATTAACAGAAATTACACCTAAATTATTCAAATACATCATTAATTGGGTCTTGAAGACTCTCAAGAAACGCGATGTCTGAGGTTGTAAGCTCGTCCAGACTCGATAGGTTAGAAAACATTTGTGTATCCCCAATGCTTTCCGAAGGTTGTAGTTGAATTGTATCCTTATTGTTATGATGTCTGTCTCCATGAGGAATGGTCGGTTCTCGTGGTTGATGATCTTGAAATATAGGGGATTTGTTATTGTCCAGATATAGACGCCATTCTCTGCTTGAGCTGCAGTGATAAGTTCCCCTGTGCGAGAATCCATGGTTGACACAGTTTATTGATAGGTAGTATGTGCAACCACACTTCAGGTCAATCCTCCGTCTCCTGATGGTCTTCTTCTTCGCCTCTCGGTGCTGGACCTTGATATTCGGTAGAGTACAATGGCTCGTTGAGGGTGATGAAGATCGCATTGTAATTAGACCACCTCTTGAGCTTTGCGTTCTTTTCCTCTTCTAAAAACTCTGTATATGAAGAGGTTGGACCTGGATTGCAGAGGAAGATAGTGGGTATCCCACCTTTAATTTGAACCGGCTTTCCGTACTTTCTGTTGCTTTGCCAGTTTGTTTGGGACCCCATGAATTCTTTATAGTGCTTTAGATAGTGCGGGTCGACGTCATCTATTACGTTATACCATGCGTCGTTAGAGAACACATTAGGGTTTAAGTCTAAATGTCCACATAAGTAATTATGTGGCCCTAATGACCTGGCCCACAACGTTTTCCCGGTTCGACTTTCACCTTCAATGACAATGCCTTTGGGCCTTAGAGGCCGCGCAGCGGAATTTGTCACAAATTCTTGAGCCCATACCTTCATCATGGTCGGGACATTGTCAAATGCTGTCGTGGGAAATGGACACACAAACGGTTCTGGTGGTTTCTCGAATTCTTTTTCGATATTTGCCACTATGTTGTGCCGTTGTAATAGATATGTCCACGGTTGCTTCTCCTTTACTAATTGCTTGGCAGCATTTACGGATGTTGCGTTCCAGACCTCTGCACCAAGATCGTTAAGATCCTGTTGGCCTCCTCTAGCACTCCTTCCGTCGATCTGGAATTCTCCCCATTCCAGTGTGTCTCCGTCCTTGTCGATATAGGACTTGACATCGGAGCTTGATTTAGCTCCCTGTATGTTCGGATGGAAATGTGTTGACCGGGTTGGGGATACAAGGTCGAAGAATCGTTTATTCGTGCAGACGTATTTCCCCTCGAATTGAATAAGCACGTGGAGATGAGGGCTCCCATCTTCGTGTAGCTCTCTGCAGATTTTAATGAATTTTTTATTTGTTGGACAAACTAGGTTACTTAATTGGGAAAGTGTTTCTTCTTTGGTGAGAGAGCAGTGTGGGTATGTAAGAAAATAATTTCTGGCTGAAACTCTAAATCTGTTATTCGGAGCCATTTATTGCTCTGGATTGGTGACACTCTGAGCTCGAAGAGTATAATAGTATTGGTGACTGGTGTACAATATATAGAGGTGAGTAAAAGCCTCAAATTCCACGTGGAATCTATCGCGGCCGTCCTTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_001285760.1
Location 163-510
Gene Name AV2
Protein Name AV2 protein
Coding Region ATGTGGGATCCGCTCCTCCATCCTTTTCCAGAAACCGTACATGGTTTCCGTTGTATGTTAGCCGTAAAGTATTTACAGTTAGTAGAGTCTACGTATTCCCCAGATACGTTAGGGTTTGATCTTATACGTGATTTAATTACAGTAATTAGGTGTAGTAACTATGTCGAAGCGACCAGCAAGTATTGTCATTTCCACGCCCTCATCGAAGGTACGTCGGAGACTCAACTTCGACAGCCCGTATGCGAACCGTGCCTCTGCCCCCATTGTCCGCGTCACAAAGGGTCAGGTATGGACCAACAGACCTATGTTCCGAAAGCCTCGGATGTACAGAATGTTCAGAAGCCCTGA
Protein Sequence MWDPLLHPFPETVHGFRCMLAVKYLQLVESTYSPDTLGFDLIRDLITVIRCSNYVEATSKYCHFHALIEGTSETQLRQPVCEPCLCPHCPRHKGSGMDQQTYVPKASDVQNVQKP

NCBI Accession YP_001285761.1
Location 323-1093
Gene Name AV1
Protein Name CP protein
Coding Region ATGTCGAAGCGACCAGCAAGTATTGTCATTTCCACGCCCTCATCGAAGGTACGTCGGAGACTCAACTTCGACAGCCCGTATGCGAACCGTGCCTCTGCCCCCATTGTCCGCGTCACAAAGGGTCAGGTATGGACCAACAGACCTATGTTCCGAAAGCCTCGGATGTACAGAATGTTCAGAAGCCCTGATGTTCCCAGAGGTTGTGAGGGTCCTTGTAAGGTTCAGTCTTATGATTCTAAGCATGACATTGGTCATCTTGGTAAGGTACTTTGTGTTTCGGATGTTACCCGTGGTAACGGCCTTACCCATCGTACTGGTAAACGTTTTTGTGTTAAGTCGTTGTATGTTATTGGGAAGATATGGATGGATGAGAAGATTAAGAATAAGAATCATACTAACACCGTTATGTTCTGGTTAGTTAGAGATAGAAGGCCTTCAGGTGTACCTCAGGATTTTCAACAGGTTTTTAATGTTTATGATAATGAACCTGCGACAGCTACTGTGAAGAACGATTCTCGAGATCGTTACCAGGTTTTACGGCGTTTTCAGTCTACTGTTACTGGTGGTCAGTATGCTTCTAAAGAACAGGCTATTATTCGGAAGTTTATCCGTGTAAACACACATGTGACGTATAATCATCAAGAGGATGCGAAATATGCCAATCATACGGAGAATGCTTTGTTATTGTATATGTGTTGTACTCATCATGAGAACCCTGTGTATGGAACTCTAAAGATCCGCAGTTATTTTTACGACTCGGTATCTAATTAA
Protein Sequence MSKRPASIVISTPSSKVRRRLNFDSPYANRASAPIVRVTKGQVWTNRPMFRKPRMYRMFRSPDVPRGCEGPCKVQSYDSKHDIGHLGKVLCVSDVTRGNGLTHRTGKRFCVKSLYVIGKIWMDEKIKNKNHTNTVMFWLVRDRRPSGVPQDFQQVFNVYDNEPATATVKNDSRDRYQVLRRFQSTVTGGQYASKEQAIIRKFIRVNTHVTYNHQEDAKYANHTENALLLYMCCTHHENPVYGTLKIRSYFYDSVSN

NCBI Accession YP_001285762.1
Location 1090-1494
Gene Name AC3
Protein Name REn protein
Coding Region ATGGATTCTCGCACAGGGGAACTTATCACTGCAGCTCAAGCAGAGAATGGCGTCTATATCTGGACAATAACAAATCCCCTATATTTCAAGATCATCAACCACGAGAACCGACCATTCCTCATGGAGACAGACATCATAACAATAAGGATACAATTCAACTACAACCTTCGGAAAGCATTGGGGATACACAAATGTTTTCTAACCTATCGAGTCTGGACGAGCTTACAACCTCAGACATCGCGTTTCTTGAGAGTCTTCAAGACCCAATTAATGATGTATTTGAATAATTTAGGTGTAATTTCTGTTAATAATGTAATTAGAGCAGTTAAATATGTATTGTATGAACGTCTTAACGGTACAGTTGATATCGAAGAGACAAATGATATAAAATACAACATTTATTAA
Protein Sequence MDSRTGELITAAQAENGVYIWTITNPLYFKIINHENRPFLMETDIITIRIQFNYNLRKALGIHKCFLTYRVWTSLQPQTSRFLRVFKTQLMMYLNNLGVISVNNVIRAVKYVLYERLNGTVDIEETNDIKYNIY

NCBI Accession YP_001285763.1
Location 1208-1642
Gene Name AC2
Protein Name TrAP protein
Coding Region ATGCGATCTTCATCACCCTCAACGAGCCATTGTACTCTACCGAATATCAAGGTCCAGCACCGAGAGGCGAAGAAGAAGACCATCAGGAGACGGAGGATTGACCTGAAGTGTGGTTGCACATACTACCTATCAATAAACTGTGTCAACCATGGATTCTCGCACAGGGGAACTTATCACTGCAGCTCAAGCAGAGAATGGCGTCTATATCTGGACAATAACAAATCCCCTATATTTCAAGATCATCAACCACGAGAACCGACCATTCCTCATGGAGACAGACATCATAACAATAAGGATACAATTCAACTACAACCTTCGGAAAGCATTGGGGATACACAAATGTTTTCTAACCTATCGAGTCTGGACGAGCTTACAACCTCAGACATCGCGTTTCTTGAGAGTCTTCAAGACCCAATTAATGATGTATTTGAATAA
Protein Sequence MRSSSPSTSHCTLPNIKVQHREAKKKTIRRRRIDLKCGCTYYLSINCVNHGFSHRGTYHCSSSREWRLYLDNNKSPIFQDHQPREPTIPHGDRHHNNKDTIQLQPSESIGDTQMFSNLSSLDELTTSDIAFLESLQDPINDVFE

NCBI Accession YP_001285764.1
Location 1542-2630
Gene Name AC1
Protein Name rep protein
Coding Region ATGGCTCCGAATAACAGATTTAGAGTTTCAGCCAGAAATTATTTTCTTACATACCCACACTGCTCTCTCACCAAAGAAGAAACACTTTCCCAATTAAGTAACCTAGTTTGTCCAACAAATAAAAAATTCATTAAAATCTGCAGAGAGCTACACGAAGATGGGAGCCCTCATCTCCACGTGCTTATTCAATTCGAGGGGAAATACGTCTGCACGAATAAACGATTCTTCGACCTTGTATCCCCAACCCGGTCAACACATTTCCATCCGAACATACAGGGAGCTAAATCAAGCTCCGATGTCAAGTCCTATATCGACAAGGACGGAGACACACTGGAATGGGGAGAATTCCAGATCGACGGAAGGAGTGCTAGAGGAGGCCAACAGGATCTTAACGATCTTGGTGCAGAGGTCTGGAACGCAACATCCGTAAATGCTGCCAAGCAATTAGTAAAGGAGAAGCAACCGTGGACATATCTATTACAACGGCACAACATAGTGGCAAATATCGAAAAAGAATTCGAGAAACCACCAGAACCGTTTGTGTGTCCATTTCCCACGACAGCATTTGACAATGTCCCGACCATGATGAAGGTATGGGCTCAAGAATTTGTGACAAATTCCGCTGCGCGGCCTCTAAGGCCCAAAGGCATTGTCATTGAAGGTGAAAGTCGAACCGGGAAAACGTTGTGGGCCAGGTCATTAGGGCCACATAATTACTTATGTGGACATTTAGACTTAAACCCTAATGTGTTCTCTAACGACGCATGGTATAACGTAATAGATGACGTCGACCCGCACTATCTAAAGCACTATAAAGAATTCATGGGGTCCCAAACAAACTGGCAAAGCAACAGAAAGTACGGAAAGCCGGTTCAAATTAAAGGTGGGATACCCACTATCTTCCTCTGCAATCCAGGTCCAACCTCTTCATATACAGAGTTTTTAGAAGAGGAAAAGAACGCAAAGCTCAAGAGGTGGTCTAATTACAATGCGATCTTCATCACCCTCAACGAGCCATTGTACTCTACCGAATATCAAGGTCCAGCACCGAGAGGCGAAGAAGAAGACCATCAGGAGACGGAGGATTGA
Protein Sequence MAPNNRFRVSARNYFLTYPHCSLTKEETLSQLSNLVCPTNKKFIKICRELHEDGSPHLHVLIQFEGKYVCTNKRFFDLVSPTRSTHFHPNIQGAKSSSDVKSYIDKDGDTLEWGEFQIDGRSARGGQQDLNDLGAEVWNATSVNAAKQLVKEKQPWTYLLQRHNIVANIEKEFEKPPEPFVCPFPTTAFDNVPTMMKVWAQEFVTNSAARPLRPKGIVIEGESRTGKTLWARSLGPHNYLCGHLDLNPNVFSNDAWYNVIDDVDPHYLKHYKEFMGSQTNWQSNRKYGKPVQIKGGIPTIFLCNPGPTSSYTEFLEEEKNAKLKRWSNYNAIFITLNEPLYSTEYQGPAPRGEEEDHQETED

NCBI Accession YP_001285765.1
Location 2201-2473
Gene Name AC4
Protein Name AC4 protein
Coding Region ATGGGAGCCCTCATCTCCACGTGCTTATTCAATTCGAGGGGAAATACGTCTGCACGAATAAACGATTCTTCGACCTTGTATCCCCAACCCGGTCAACACATTTCCATCCGAACATACAGGGAGCTAAATCAAGCTCCGATGTCAAGTCCTATATCGACAAGGACGGAGACACACTGGAATGGGGAGAATTCCAGATCGACGGAAGGAGTGCTAGAGGAGGCCAACAGGATCTTAACGATCTTGGTGCAGAGGTCTGGAACGCAACATCCGTAA
Protein Sequence MGALISTCLFNSRGNTSARINDSSTLYPQPGQHISIRTYRELNQAPMSSPISTRTETHWNGENSRSTEGVLEEANRILTILVQRSGTQHP