Passionfruit leaf curl virus


Basic Information

Genus Begomovirus
Isolate India
Vector
Download Genome |GFF3 |PEP |CDS

Genomic Organization


JBrowse


Genome

MK087124
ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTTAAAGTGGTCCCCAGAGCACGTGGTCCAATAATAGACGCTCCTCAAAGCTTAATTAATGGTTTGTGGGCCTATAGACTTGCCCACCAAGTAGTGGGATTTTGTCATCATGTGGGATCCTCTTTTAAACGAGTTTCCAGACACAGTGCACGGTTTTCGGTGTATGCTTGCTGTGAAATACTTGCAGCTCGTAGAAAAAACGTATTCACCGGATTCATTGGGTTACGATTTAATTCGCGATTTGATATCTGTAGTTCGTGCTCGTAACTATGTCGAAGCGACCAGCAGATATAATCATTTCCACTCCCGCATCGAAGGTGCGTCGCCGTCTGAACTTCGAGAGCCCGTACACGGGTCGTGTTGCTGTCCCCACTGTCCGCGTCACAAAGTCAAGAGCATGGGCCAACAGGCCCATGAATCGGAAACCCAGAATGTACAGAATGTACAGAAGTCCTGATGTTCCCAGAGGATGCGAAGGCCCATGTAAGGTTCAGTCGTTCGAGTCTAGACATGACATATCTCACATTGGGAAGGTTATGTGTATTAGTGATGTCACCCGTGGAATTGGGCTTACTCATAGGGTCGGTAAGAGGTTTTGTGTTAAGTCCGTATATGTATTGGGTAAGGTGTGGATGGATGAGAATATCAAGACTAAGAATCACACGAATAGTGTGATGTTTTTTTTGTGTCGTGACAGGAGGCCTGTTGACAAACCCCAGGATTTTGGTGAGGTGTTTAATATGTTTGATAATGAGCCTAGCACTGCAACCGTGAAGAATGTTCATCGTGATCGCTACCAAGTATTGAGGAAGTGGCACGCAACTGTCACTGGTGGAACCTATGCGTCCAAGGAGCAGGCTTTGGTGAAGAAGTTTGTTAGGGTTAATAATTATGTTGTGTATAACCAGCAAGAGGCTGGGAAGTATGAGAATCATAGTGAGAATGCTCTGATGTTGTATATGGCGTCTACGCACGCCTCTAATCCCGTGTATGCTACATTGAAGATACGGATCTATTTTTATGATTCTGTATCTAATTAATAAATATTGAATTTTATTGAATGTGATTGTTCAACGTACAACATGTGATGCAATACATCCCATAAAACATGATCTACTGCTCTAATTACATTGTTTAAACTAATAACACCTAAATTATCTAAATATTTAATTACTTGGGTCTTAAAAACCCTTAAGAAACGACCAGTCTGAGGTTGTGAAGTCATCCAGATTCGGAAGACTAGAAAACACTTGTGAATCCCCAATGCCTTCCTCAGGTTGTGATTGAATTGGATCTGCATTGTGACTATGTCGTGGTTCGTTAGGAATGGTCGGTTGTGGTGCTCCGTTATCTTGAAATAAAGGGGATTTTGTATCTCCCAGATATACACGCCATTCTCTGCTTGAGCTGCAGTGATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGGTTTTGGCAGGCTAATGCTATGAAGTATGAACACCCACAAGGGAGATCAACACGTCGACGCCTCGTCCCCTTCTTGGCTAGCCTGTGCTGCACTTTGATTGGAACCTGAGTAGAGTGGGCCTTCGAGGGTGACGAAGATCGCATTCTTTAAAGCCCAATTTTTGAGTGCATTATTCTTCTCTTCATCCAAGAACTCTTTATAACTTGAATTAGGTCCTGGATTGCAGAGGAAGATAGTGGGAATTCCGCCTTTAATTTGAACTGGCTTTCCGTACTTGGTATTTGATTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATGAATTCCTTAAAGTGCTTTAGGTAGTGGGGATCAACGTCATCGATGACGTTATACCACGCATCATTGCTGTAAACTTTGGGGCTTAGATCTAAATGACCGCATAGGTAATTATGAGGCCCTAATGACCTAGCCCACATCGTTTTACCCGTACGACTGTCTCCCTCAATTACTATACTTTGAGGCCTCAGAGGCCGCGCAGCGGCAGCCATGACATTTTCTGAGACCCATTCTTCAAGTTCTTCAGGAACTTGATCAAAAGAAGAAGATAAAAAAGGTGAAACATAAACCTCCAACGGAGGAGTAAAAATCCTATCTAAATTAGCATTTAAATTATGATATTGAAAAATAAATTTTTCTGGGAGTTTCTCCTTTATTATAGCCATTGCAGCCTTTTTAGAACCTGCATTTAGGGCTTCTGCAGCAGCATCATTAGCTGTCTGTTGACCTCCTCGTGCAGATCTTCCATCGATCTGGAATTCTCCCCATTCGAGGGTGTCTCCGTCCTTGTCGATGTAGGACTTGACGTCGGTGCTGGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGATCTGGTTGGGGATACCAGGTCGAAGAATCTGTTGTTTTGGCACTTGTATTTTCCTTCGAATTGTATGAGAACATGCAGGTGAGGAGTCCCATCTTCGTGGAGCTCTCTGCAGATTCTAATGAATTTTTTGTTCGTAGGGGTTTCTAAGTTTAAGAATTGGGAAAGTGCTTCTTCCTTTGTAAGGGAGCACTTTGGATAAGTAAGGAAATAATTTTTGGCATTTATTTGAAAACGTTTTGGTTGAGGCATGTTGACTTGGTCAATCGGTACTCAACAAACTTGGCTATGCAATTGGGGAATGGTACTCAATATATAGGTGAGTACCAAATGGCATGATTGTAATTTGGTAAAGTGTCATTTGAATTGCAAAACCCTCACGCTCCAAAAGCGGCCATCCGTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession QCE30487.1
Location 130-477
Gene Name AV2
Protein Name pre-coat protein
Coding Region ATGTGGGATCCTCTTTTAAACGAGTTTCCAGACACAGTGCACGGTTTTCGGTGTATGCTTGCTGTGAAATACTTGCAGCTCGTAGAAAAAACGTATTCACCGGATTCATTGGGTTACGATTTAATTCGCGATTTGATATCTGTAGTTCGTGCTCGTAACTATGTCGAAGCGACCAGCAGATATAATCATTTCCACTCCCGCATCGAAGGTGCGTCGCCGTCTGAACTTCGAGAGCCCGTACACGGGTCGTGTTGCTGTCCCCACTGTCCGCGTCACAAAGTCAAGAGCATGGGCCAACAGGCCCATGAATCGGAAACCCAGAATGTACAGAATGTACAGAAGTCCTGA
Protein Sequence MWDPLLNEFPDTVHGFRCMLAVKYLQLVEKTYSPDSLGYDLIRDLISVVRARNYVEATSRYNHFHSRIEGASPSELREPVHGSCCCPHCPRHKVKSMGQQAHESETQNVQNVQKS

NCBI Accession QCE30488.1
Location 290-1060
Gene Name AV1
Protein Name coat protein
Coding Region ATGTCGAAGCGACCAGCAGATATAATCATTTCCACTCCCGCATCGAAGGTGCGTCGCCGTCTGAACTTCGAGAGCCCGTACACGGGTCGTGTTGCTGTCCCCACTGTCCGCGTCACAAAGTCAAGAGCATGGGCCAACAGGCCCATGAATCGGAAACCCAGAATGTACAGAATGTACAGAAGTCCTGATGTTCCCAGAGGATGCGAAGGCCCATGTAAGGTTCAGTCGTTCGAGTCTAGACATGACATATCTCACATTGGGAAGGTTATGTGTATTAGTGATGTCACCCGTGGAATTGGGCTTACTCATAGGGTCGGTAAGAGGTTTTGTGTTAAGTCCGTATATGTATTGGGTAAGGTGTGGATGGATGAGAATATCAAGACTAAGAATCACACGAATAGTGTGATGTTTTTTTTGTGTCGTGACAGGAGGCCTGTTGACAAACCCCAGGATTTTGGTGAGGTGTTTAATATGTTTGATAATGAGCCTAGCACTGCAACCGTGAAGAATGTTCATCGTGATCGCTACCAAGTATTGAGGAAGTGGCACGCAACTGTCACTGGTGGAACCTATGCGTCCAAGGAGCAGGCTTTGGTGAAGAAGTTTGTTAGGGTTAATAATTATGTTGTGTATAACCAGCAAGAGGCTGGGAAGTATGAGAATCATAGTGAGAATGCTCTGATGTTGTATATGGCGTCTACGCACGCCTCTAATCCCGTGTATGCTACATTGAAGATACGGATCTATTTTTATGATTCTGTATCTAATTAA
Protein Sequence MSKRPADIIISTPASKVRRRLNFESPYTGRVAVPTVRVTKSRAWANRPMNRKPRMYRMYRSPDVPRGCEGPCKVQSFESRHDISHIGKVMCISDVTRGIGLTHRVGKRFCVKSVYVLGKVWMDENIKTKNHTNSVMFFLCRDRRPVDKPQDFGEVFNMFDNEPSTATVKNVHRDRYQVLRKWHATVTGGTYASKEQALVKKFVRVNNYVVYNQQEAGKYENHSENALMLYMASTHASNPVYATLKIRIYFYDSVSN

NCBI Accession QCE30489.1
Location 1057-1461
Gene Name AC3
Protein Name replication enhancer protein
Coding Region ATGGATTCACGCACAGGGGAACTCATCACTGCAGCTCAAGCAGAGAATGGCGTGTATATCTGGGAGATACAAAATCCCCTTTATTTCAAGATAACGGAGCACCACAACCGACCATTCCTAACGAACCACGACATAGTCACAATGCAGATCCAATTCAATCACAACCTGAGGAAGGCATTGGGGATTCACAAGTGTTTTCTAGTCTTCCGAATCTGGATGACTTCACAACCTCAGACTGGTCGTTTCTTAAGGGTTTTTAAGACCCAAGTAATTAAATATTTAGATAATTTAGGTGTTATTAGTTTAAACAATGTAATTAGAGCAGTAGATCATGTTTTATGGGATGTATTGCATCACATGTTGTACGTTGAACAATCACATTCAATAAAATTCAATATTTATTAA
Protein Sequence MDSRTGELITAAQAENGVYIWEIQNPLYFKITEHHNRPFLTNHDIVTMQIQFNHNLRKALGIHKCFLVFRIWMTSQPQTGRFLRVFKTQVIKYLDNLGVISLNNVIRAVDHVLWDVLHHMLYVEQSHSIKFNIY

NCBI Accession QCE30490.1
Location 1202-1606
Gene Name AC2
Protein Name transcription activator protein
Coding Region ATGCGATCTTCGTCACCCTCGAAGGCCCACTCTACTCAGGTTCCAATCAAAGTGCAGCACAGGCTAGCCAAGAAGGGGACGAGGCGTCGACGTGTTGATCTCCCTTGTGGGTGTTCATACTTCATAGCATTAGCCTGCCAAAACCATGGATTCACGCACAGGGGAACTCATCACTGCAGCTCAAGCAGAGAATGGCGTGTATATCTGGGAGATACAAAATCCCCTTTATTTCAAGATAACGGAGCACCACAACCGACCATTCCTAACGAACCACGACATAGTCACAATGCAGATCCAATTCAATCACAACCTGAGGAAGGCATTGGGGATTCACAAGTGTTTTCTAGTCTTCCGAATCTGGATGACTTCACAACCTCAGACTGGTCGTTTCTTAAGGGTTTTTAA
Protein Sequence MRSSSPSKAHSTQVPIKVQHRLAKKGTRRRRVDLPCGCSYFIALACQNHGFTHRGTHHCSSSREWRVYLGDTKSPLFQDNGAPQPTIPNEPRHSHNADPIQSQPEEGIGDSQVFSSLPNLDDFTTSDWSFLKGF

NCBI Accession QCE30491.1
Location 1509-2594
Gene Name AC1
Protein Name replication initiator protein
Coding Region ATGCCTCAACCAAAACGTTTTCAAATAAATGCCAAAAATTATTTCCTTACTTATCCAAAGTGCTCCCTTACAAAGGAAGAAGCACTTTCCCAATTCTTAAACTTAGAAACCCCTACGAACAAAAAATTCATTAGAATCTGCAGAGAGCTCCACGAAGATGGGACTCCTCACCTGCATGTTCTCATACAATTCGAAGGAAAATACAAGTGCCAAAACAACAGATTCTTCGACCTGGTATCCCCAACCAGATCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAATCCAGCACCGACGTCAAGTCCTACATCGACAAGGACGGAGACACCCTCGAATGGGGAGAATTCCAGATCGATGGAAGATCTGCACGAGGAGGTCAACAGACAGCTAATGATGCTGCTGCAGAAGCCCTAAATGCAGGTTCTAAAAAGGCTGCAATGGCTATAATAAAGGAGAAACTCCCAGAAAAATTTATTTTTCAATATCATAATTTAAATGCTAATTTAGATAGGATTTTTACTCCTCCGTTGGAGGTTTATGTTTCACCTTTTTTATCTTCTTCTTTTGATCAAGTTCCTGAAGAACTTGAAGAATGGGTCTCAGAAAATGTCATGGCTGCCGCTGCGCGGCCTCTGAGGCCTCAAAGTATAGTAATTGAGGGAGACAGTCGTACGGGTAAAACGATGTGGGCTAGGTCATTAGGGCCTCATAATTACCTATGCGGTCATTTAGATCTAAGCCCCAAAGTTTACAGCAATGATGCGTGGTATAACGTCATCGATGACGTTGATCCCCACTACCTAAAGCACTTTAAGGAATTCATGGGGGCCCAAAGGGACTGGCAATCAAATACCAAGTACGGAAAGCCAGTTCAAATTAAAGGCGGAATTCCCACTATCTTCCTCTGCAATCCAGGACCTAATTCAAGTTATAAAGAGTTCTTGGATGAAGAGAAGAATAATGCACTCAAAAATTGGGCTTTAAAGAATGCGATCTTCGTCACCCTCGAAGGCCCACTCTACTCAGGTTCCAATCAAAGTGCAGCACAGGCTAGCCAAGAAGGGGACGAGGCGTCGACGTGTTGA
Protein Sequence MPQPKRFQINAKNYFLTYPKCSLTKEEALSQFLNLETPTNKKFIRICRELHEDGTPHLHVLIQFEGKYKCQNNRFFDLVSPTRSAHFHPNIQGAKSSTDVKSYIDKDGDTLEWGEFQIDGRSARGGQQTANDAAAEALNAGSKKAAMAIIKEKLPEKFIFQYHNLNANLDRIFTPPLEVYVSPFLSSSFDQVPEELEEWVSENVMAAAARPLRPQSIVIEGDSRTGKTMWARSLGPHNYLCGHLDLSPKVYSNDAWYNVIDDVDPHYLKHFKEFMGAQRDWQSNTKYGKPVQIKGGIPTIFLCNPGPNSSYKEFLDEEKNNALKNWALKNAIFVTLEGPLYSGSNQSAAQASQEGDEASTC

NCBI Accession QCE30492.1
Location 2180-2437
Gene Name AC4
Protein Name AC4
Coding Region ATGGGACTCCTCACCTGCATGTTCTCATACAATTCGAAGGAAAATACAAGTGCCAAAACAACAGATTCTTCGACCTGGTATCCCCAACCAGATCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAATCCAGCACCGACGTCAAGTCCTACATCGACAAGGACGGAGACACCCTCGAATGGGGAGAATTCCAGATCGATGGAAGATCTGCACGAGGAGGTCAACAGACAGCTAATGATGCTGCTGCAGAAGCCCTAA
Protein Sequence MGLLTCMFSYNSKENTSAKTTDSSTWYPQPDQHISIRTFRELNPAPTSSPTSTRTETPSNGENSRSMEDLHEEVNRQLMMLLQKP