Okra mottle virus


Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_000875625.1
Isolate Brazil
Release date 2015/2/13
Submitter Aranha,S.A., Inoue-Nagata,A.K.
Host
Download Genome |GFF3 |PEP |CDS

Genomic Organization


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Genome

NC_011181
ACCGGATGGCCGCGCGATTTTTCCCCCCTTTCTTGACGTGGCGCTCTGGTGGCCGCCCGATCCTCCTCTCCCTCTCCGCTCTCGTGGAGTACACCTTGCCCGCGCGCTGTTCTCCTTTAATTCAAATTAAAGGATTTAACTTTTGTCCGACCAATTATAGTGCGCCTGAGGAGCCTAGATATTTGCGAAAGACTTGGGCCCTAAGTTGTTGGACGACTATATAATTAAGTCATGTATGACGTCAGTAATTATTTCAAAATGCCCAAGCGGGATCCCTCATGGCGCCAGATGGCGGGAACCTCAAAGGTTAGCCGCACTACCAACTTTTCCCCTCGTGGAGGTGGAGGCCCAAAGTACAACAAGGCCTCGGAGTGGGTTCACAGGCCTATGTATAGGAAGCCCAGGATATACAGGATGATAAGGACTCCTGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGGCCCTGCAAGGTTCAATCCTACGAGCAGCGTCACGACATCTCACATGTCGGGAAGGTCATGTGCATATCTGATGTCACACGTGGCAATGGTATAACCCACCGTGTCGGTAAGCGTTTCTGCGTTAAGTCTGTGTACATTTTAGGGAAGATATGGATGGACGAGAACATCAAGCTCAAGAACCACACGAACAGTGTCATATTCTGGTTGGTCAGAGACCGTAGACCGTATGGTACCCCTATGGAGTTTGGCCAGGTGTTTAACATGTTTGACAACGAGCCCAGCACTGCTACGGTGAAGAACGATCTCCGTGATCGTTATCAAGTCATGCACAAGTTCTATGCCAAGGTCACTGGTGGTCAATATGCCAGCAACGAACAGGCTCTGGTCAAGAGGTTCTGGAAGGTCAACAATCATGTGGTGTACAATCACCAGGAGGCTGGGAAGTATGAGAATCACACGGAGAATGCTCTGTTACTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTGTATGCAACGCTTAAGATTCGGATCTATTTCTACGATTCGATCACGAATTAATAAAGTTTGAATTTTATTGAATGATTTTCGAGTACATAACTGACATATGGCCTGTCTGTTGCGAAACGAACAGCTCTAATTACATTATTAATGGCAATTACACCTAATTGGTCTAAGTACATCATGACTAGCATCTTAAACCTAGCTAAATATGTCGTCCCAGAAGCTGTCAGAGAAGTCGTCCAGACTTGGAAGTTGAGGTAGGCCTTGTGGAGACCCAATGCTCTCCTGAGGTTGTGGTTGAACCTTATCTGTATGTGGTATATTCTGGTTCTCGTGTACGGTAGATCCTCTAGGTTGTATATCTTGAAATAGAGGGGATTTGGAACCTCCCAGATATAGACGCCATTCTCTGTCTGAGGTGCAGTTATGAATTCCCCGGTGCGTGAATCCATGGCCGTTGCAGTTGAAGTGGACGTATATCGAGCAGCCGCACTCTAGGTCCACTCGTCTACGCCTGATGGCTCTCTTCTTGGCAATCCTGTGTCTCGGTTTGATAGAGGGGGGCGTCGAGGAAGATGAATTTAGCATTGTGGAGTGTCCACGATTTCAGAGCTGCATTTTCCTCCTTGTCTAGGAAGTCTTTATAGCTAGCCCCCTCTCCAGGATTGCACAGCACGATTGATGGGATGCCACCTTTAATTTGAACTGGCTTTCCGTATTTGCAATTTGACTGCCAGTCTTTTTGAGCACCAATCAATTCCTTCCAGTGCTTTAACTTTAGATATTGCGGTGTGACATCGTCAATGACGTTGTATTCCACTTCGTTCGAGTAAACCTTAGAATTGAAGTCCAGATGACCACTCAAGTAATTATGTGGGCCTAACGCACGAGCCCACATCGTCTTCCCTGTCCTTGAATCACCTTCGACTATCAAACTCATAGGTCTGAATGGCCGCGCAGCGGAACCTCTCCCAAAATATTCATCGGCCCACTCTTGCATCTCGTCGGGAACGTTAGTGAAGGAGGAGAGGTTAAACGGAGGAACCCACGGCTCCGGAGCCTTTGAGAAAATTCTATCTAAATTAGAATTTAAATTATGAAACTGAAAAAGATATTTCTCTGGCAATTTTTCCCGAATTAACTGAAGAGCCGTCTGTTTATCAGGAGCGTTTAACGCCTCAGCTGCAGCGTCATTAGCTGTCTGTTGGCCTCCCCTAGAACTCCTTCCGTCGACCTGGAAGTCACCCCATTCTACTGTATCTCCATCTTTGTCGATGTAAGACTTGACGTCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTTGTTGGGGAAACCAGGTCGAACAATCTGTTATTTGTGATTTGGACCTTTCCTTCCAATTGCAACAGGACGTGGAGGTGAGGTTCCCCATTTTCGTGAAGCTCTCTGCAAATCTTGATGAATTTCTTATTAGAGGGTAATTGAATAGCTTGCAATTGGGAAAGTGCCTCCTCTTTTGTAAGAGAGCACTGTGGATAAGTAAGGAAAATGTTTTTAGCTTGGAGTCTAAAACGACGTGGTTTGGATGGCATTTTTGTAAATAAGGGAGTGTACTCCGCTTGAGAGCTCGCTCATAAGTCTATATGAATTGGAGTATGGAGTACAATATATAGTAATAGGAGTTCCTAAGGCCATCCGTATAATATT

NC_011182
ACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTCCCCCCCCCCTACGTGGCGCGCTGGTGCCCGTTGGATACCGCTCTCCCTGGTGGGCCTCCCCCTTGGTGCTACTCCCCCCCCTCTCCCGGCTCAATTCAATTGAGCGCTTTTTTGGAGTCCGCGAAATGAGTTAAACGCAATTTTTGATGTCCGCCTTCATTCAGCGCCTTTAATTTGAATTAAAGGCATATCATTATGTTGTCCACTCATTTCGGTCTGCTTGTCTCCTCGCGCGACGCTCGCTTTTGCCCAACCGGATGAGATGTGATCTTGGTCGTTGGATAATAATATAATTTATTCAGCCACTTTAATTTGAAACTTGAATTATTTGCGAGCGTCGTGGTACCATGTCCCATCGTACGAACTTGATGAGCTGGACCAGTGAAGTTGCACCTACAGAGTTAAATTGATCAAGGAATTTATGTTTAAATTCCCGGGTGATAGATGGTGATATCAGGTTAATTGAGCACGTCTATTGTTTGAGTAGCTACAGTTAACAGTTGTGTGTTAGTCAATTTTAAAACATGTTTCCCATTAGGTATAGACGTGGTTGGTCGTCTAATCAGCGACGAGGTTACACACGTAATCCCGTGTTTAAGCGTTATTATGTAGCTAAACGAAGTGATTTCAAGCGACGACCCAGTAATACTAACAAGGCCCAAGAAGATGGCAAGATGTCTACTCAACGTATACACGAGAACCAGTTTGGGCCTGAATTTGTAATGGGCCACAACTCAGCCATTTCAACGTTTATTACATTTCCTAGCCTCGGTAAGACCGAGCCTAACCGAACCAGGTCCTATGTCAAGCTAAAACGACTCCGTTTTAAGGGTACTGTGAAGATTGAACGTGTTTACAATGACGTCATCATGGATGGTTCAACCCCAAAGATTGAAGGAGTCTTTTCCCTCGTGGTCGTGGTAGATCGTAAACCCCACTTGGGATCATCTGGGTGTCTGCACACGTTTGACGAGTTATTCGGTGCCAGGATCCACAGTCATGGCAATCTGGCTATAACACCCTCCCTGAAAGACCGCTTTTACATTCGACACGTGTTCAAACGTGTGTTATCTGTGGAGAAAGACACTTTGATGGTTGATCTTGAAGGGACTACATACCTCTCTAACAGGCGTTTTAATTGTTGGTCAACGTTTAAGGATATTGACCGTGAATCATGTAACGGTGTTTATGCAAACATAAGCAAGAACGCCCTGTTAGTTTACTACTGTTGGATGTCGGACTCGTCGTCCAAGGCATCGACATTTGTATCATATGATCTCGATTACATCGGTTAAACATATAGACATATTTTCATTAATAACATTGTTATTGATTAATCACATATTAACTTAATGATTTGGGCTGTGGGGGAATACAATTTGTTTTAATACACTCCTGGACCGCACTCCTCACTAGGTCGTTTAATTGTGCCTCGGACATGGTTATATGCGATTCGGCCCTTCTCGCAGCAACTATGGAAGCCGAGTCACCTGGGTCCAACATGCTGGTGCCCAGTTTATGGAGCCCTCTATATGGGTGTGTTGCGTTCTCTACCTCTGACTCGGTGCTCGATTGACCGATCCCTATGGTACTGCGTGAAGCCCATGTCTCACCTGGATCAATGGTTATTGGGCTTGGGAGCCCATACTTGACTGTGGATGCGGATCGGATCAATTTCCTTTCCCATTTCCCATAGCCCACGTGGCTGAAATCTACGTCTCTATCTGTGAACTGTTTAGATAAGATCTTCACCGTCGGTGCTCGGAAAGGAATGTCGACGGAATGTTTCGCCGTTGACAGCTTTAGCTTCCCCTTGAATTTCGCGAAGTGCGTTCTCTGGTGAACATTCGTGTCGCTCACTCTGTAATACAATTTCCAGGGAATTGGGTCTTTCAGGGAGAAGAACGAGCATGAAAAGTAGTGGAGATCTATGTTGCACCTGATCGGGAATGTCCAGGACGCCTGTAACGATTCATTGTCCGTCATTCTCTTGTCGTGGATCTCCACGATGACGGAACCTGTGGCGTTTATGGGTACCTGTTGCCTGTATTCTATGACGCAGTGGTCTATCTTCATACAGCTGCGACTGAGCCTGGCGCTTATCTGAGCCGCCGCAGAAGGAAACTGCAGAACGATCTCAGTTAGGTCATGAGAAAGCTGATACTCATCACGCTGAGATTCTATATAATTAAAGGCATTGGGTGGATTAACTAACTGAGAACCCATTTTAACTATTAATCTAAGAAGAATAGGCCGCGCAGCGTAATCTGTAGGTGAAGTGAATAAGGCGAAAGCGGAAAAGAATATGGCGTCAGTCAAACTGAGAAGACAATTGTGTTAGGGTTTCAGTTGTTGAGAGGACGGATTAAGATGAGATATGAGGTGAAGGAATCTGTGTCTAACACCAATCTATAGGATTTATTTATAGATAGATGGGCTGGGTTCTGTCGGGTTATTTTTCCTATCGACTAAAACGACGAGGTTTTGATGTCATGACTATGCTTTGGATGGCATTTTTGTAAATAAGACTGTGTACTCCGCTTGAGAGCTCTTTCATAAGTCTATATGAATTGGAGTAAGGAGTACAATATATAGTAATAGGAGTTCCTAAGGCCATCCGTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_002154617.1
Location 259-1014
Gene Name AV1
Protein Name coat protein
Coding Region ATGCCCAAGCGGGATCCCTCATGGCGCCAGATGGCGGGAACCTCAAAGGTTAGCCGCACTACCAACTTTTCCCCTCGTGGAGGTGGAGGCCCAAAGTACAACAAGGCCTCGGAGTGGGTTCACAGGCCTATGTATAGGAAGCCCAGGATATACAGGATGATAAGGACTCCTGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGGCCCTGCAAGGTTCAATCCTACGAGCAGCGTCACGACATCTCACATGTCGGGAAGGTCATGTGCATATCTGATGTCACACGTGGCAATGGTATAACCCACCGTGTCGGTAAGCGTTTCTGCGTTAAGTCTGTGTACATTTTAGGGAAGATATGGATGGACGAGAACATCAAGCTCAAGAACCACACGAACAGTGTCATATTCTGGTTGGTCAGAGACCGTAGACCGTATGGTACCCCTATGGAGTTTGGCCAGGTGTTTAACATGTTTGACAACGAGCCCAGCACTGCTACGGTGAAGAACGATCTCCGTGATCGTTATCAAGTCATGCACAAGTTCTATGCCAAGGTCACTGGTGGTCAATATGCCAGCAACGAACAGGCTCTGGTCAAGAGGTTCTGGAAGGTCAACAATCATGTGGTGTACAATCACCAGGAGGCTGGGAAGTATGAGAATCACACGGAGAATGCTCTGTTACTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTGTATGCAACGCTTAAGATTCGGATCTATTTCTACGATTCGATCACGAATTAA
Protein Sequence MPKRDPSWRQMAGTSKVSRTTNFSPRGGGGPKYNKASEWVHRPMYRKPRIYRMIRTPDVPRGCEGPCKVQSYEQRHDISHVGKVMCISDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVIFWLVRDRRPYGTPMEFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRYQVMHKFYAKVTGGQYASNEQALVKRFWKVNNHVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSITN

NCBI Accession YP_002154618.1
Location 1011-1409
Gene Name AC3
Protein Name replication enhancer protein
Coding Region ATGGATTCACGCACCGGGGAATTCATAACTGCACCTCAGACAGAGAATGGCGTCTATATCTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATATACAACCTAGAGGATCTACCGTACACGAGAACCAGAATATACCACATACAGATAAGGTTCAACCACAACCTCAGGAGAGCATTGGGTCTCCACAAGGCCTACCTCAACTTCCAAGTCTGGACGACTTCTCTGACAGCTTCTGGGACGACATATTTAGCTAGGTTTAAGATGCTAGTCATGATGTACTTAGACCAATTAGGTGTAATTGCCATTAATAATGTAATTAGAGCTGTTCGTTTCGCAACAGACAGGCCATATGTCAGTTATGTACTCGAAAATCATTCAATAAAATTCAAACTTTATTAA
Protein Sequence MDSRTGEFITAPQTENGVYIWEVPNPLYFKIYNLEDLPYTRTRIYHIQIRFNHNLRRALGLHKAYLNFQVWTTSLTASGTTYLARFKMLVMMYLDQLGVIAINNVIRAVRFATDRPYVSYVLENHSIKFKLY

NCBI Accession YP_002154619.1
Location 1156-1545
Gene Name AC2
Protein Name transactivation protein
Coding Region ATGCTAAATTCATCTTCCTCGACGCCCCCCTCTATCAAACCGAGACACAGGATTGCCAAGAAGAGAGCCATCAGGCGTAGACGAGTGGACCTAGAGTGCGGCTGCTCGATATACGTCCACTTCAACTGCAACGGCCATGGATTCACGCACCGGGGAATTCATAACTGCACCTCAGACAGAGAATGGCGTCTATATCTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATATACAACCTAGAGGATCTACCGTACACGAGAACCAGAATATACCACATACAGATAAGGTTCAACCACAACCTCAGGAGAGCATTGGGTCTCCACAAGGCCTACCTCAACTTCCAAGTCTGGACGACTTCTCTGACAGCTTCTGGGACGACATATTTAGCTAG
Protein Sequence MLNSSSSTPPSIKPRHRIAKKRAIRRRRVDLECGCSIYVHFNCNGHGFTHRGIHNCTSDREWRLYLGGSKSPLFQDIQPRGSTVHENQNIPHTDKVQPQPQESIGSPQGLPQLPSLDDFSDSFWDDIFS

NCBI Accession YP_002154620.1
Location 1466-2545
Gene Name AC1
Protein Name replication associated protein
Coding Region ATGCCATCCAAACCACGTCGTTTTAGACTCCAAGCTAAAAACATTTTCCTTACTTATCCACAGTGCTCTCTTACAAAAGAGGAGGCACTTTCCCAATTGCAAGCTATTCAATTACCCTCTAATAAGAAATTCATCAAGATTTGCAGAGAGCTTCACGAAAATGGGGAACCTCACCTCCACGTCCTGTTGCAATTGGAAGGAAAGGTCCAAATCACAAATAACAGATTGTTCGACCTGGTTTCCCCAACAAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAATCCAGCTCCGACGTCAAGTCTTACATCGACAAAGATGGAGATACAGTAGAATGGGGTGACTTCCAGGTCGACGGAAGGAGTTCTAGGGGAGGCCAACAGACAGCTAATGACGCTGCAGCTGAGGCGTTAAACGCTCCTGATAAACAGACGGCTCTTCAGTTAATTCGGGAAAAATTGCCAGAGAAATATCTTTTTCAGTTTCATAATTTAAATTCTAATTTAGATAGAATTTTCTCAAAGGCTCCGGAGCCGTGGGTTCCTCCGTTTAACCTCTCCTCCTTCACTAACGTTCCCGACGAGATGCAAGAGTGGGCCGATGAATATTTTGGGAGAGGTTCCGCTGCGCGGCCATTCAGACCTATGAGTTTGATAGTCGAAGGTGATTCAAGGACAGGGAAGACGATGTGGGCTCGTGCGTTAGGCCCACATAATTACTTGAGTGGTCATCTGGACTTCAATTCTAAGGTTTACTCGAACGAAGTGGAATACAACGTCATTGACGATGTCACACCGCAATATCTAAAGTTAAAGCACTGGAAGGAATTGATTGGTGCTCAAAAAGACTGGCAGTCAAATTGCAAATACGGAAAGCCAGTTCAAATTAAAGGTGGCATCCCATCAATCGTGCTGTGCAATCCTGGAGAGGGGGCTAGCTATAAAGACTTCCTAGACAAGGAGGAAAATGCAGCTCTGAAATCGTGGACACTCCACAATGCTAAATTCATCTTCCTCGACGCCCCCCTCTATCAAACCGAGACACAGGATTGCCAAGAAGAGAGCCATCAGGCGTAG
Protein Sequence MPSKPRRFRLQAKNIFLTYPQCSLTKEEALSQLQAIQLPSNKKFIKICRELHENGEPHLHVLLQLEGKVQITNNRLFDLVSPTRSAHFHPNIQGAKSSSDVKSYIDKDGDTVEWGDFQVDGRSSRGGQQTANDAAAEALNAPDKQTALQLIREKLPEKYLFQFHNLNSNLDRIFSKAPEPWVPPFNLSSFTNVPDEMQEWADEYFGRGSAARPFRPMSLIVEGDSRTGKTMWARALGPHNYLSGHLDFNSKVYSNEVEYNVIDDVTPQYLKLKHWKELIGAQKDWQSNCKYGKPVQIKGGIPSIVLCNPGEGASYKDFLDKEENAALKSWTLHNAKFIFLDAPLYQTETQDCQEESHQA

NCBI Accession YP_002154621.1
Location 549-1319
Gene Name BV1
Protein Name nuclear shuttle protein
Coding Region ATGTTTCCCATTAGGTATAGACGTGGTTGGTCGTCTAATCAGCGACGAGGTTACACACGTAATCCCGTGTTTAAGCGTTATTATGTAGCTAAACGAAGTGATTTCAAGCGACGACCCAGTAATACTAACAAGGCCCAAGAAGATGGCAAGATGTCTACTCAACGTATACACGAGAACCAGTTTGGGCCTGAATTTGTAATGGGCCACAACTCAGCCATTTCAACGTTTATTACATTTCCTAGCCTCGGTAAGACCGAGCCTAACCGAACCAGGTCCTATGTCAAGCTAAAACGACTCCGTTTTAAGGGTACTGTGAAGATTGAACGTGTTTACAATGACGTCATCATGGATGGTTCAACCCCAAAGATTGAAGGAGTCTTTTCCCTCGTGGTCGTGGTAGATCGTAAACCCCACTTGGGATCATCTGGGTGTCTGCACACGTTTGACGAGTTATTCGGTGCCAGGATCCACAGTCATGGCAATCTGGCTATAACACCCTCCCTGAAAGACCGCTTTTACATTCGACACGTGTTCAAACGTGTGTTATCTGTGGAGAAAGACACTTTGATGGTTGATCTTGAAGGGACTACATACCTCTCTAACAGGCGTTTTAATTGTTGGTCAACGTTTAAGGATATTGACCGTGAATCATGTAACGGTGTTTATGCAAACATAAGCAAGAACGCCCTGTTAGTTTACTACTGTTGGATGTCGGACTCGTCGTCCAAGGCATCGACATTTGTATCATATGATCTCGATTACATCGGTTAA
Protein Sequence MFPIRYRRGWSSNQRRGYTRNPVFKRYYVAKRSDFKRRPSNTNKAQEDGKMSTQRIHENQFGPEFVMGHNSAISTFITFPSLGKTEPNRTRSYVKLKRLRFKGTVKIERVYNDVIMDGSTPKIEGVFSLVVVVDRKPHLGSSGCLHTFDELFGARIHSHGNLAITPSLKDRFYIRHVFKRVLSVEKDTLMVDLEGTTYLSNRRFNCWSTFKDIDRESCNGVYANISKNALLVYYCWMSDSSSKASTFVSYDLDYIG

NCBI Accession YP_002154622.1
Location 1369-2250
Gene Name BC1
Protein Name movement protein
Coding Region ATGGGTTCTCAGTTAGTTAATCCACCCAATGCCTTTAATTATATAGAATCTCAGCGTGATGAGTATCAGCTTTCTCATGACCTAACTGAGATCGTTCTGCAGTTTCCTTCTGCGGCGGCTCAGATAAGCGCCAGGCTCAGTCGCAGCTGTATGAAGATAGACCACTGCGTCATAGAATACAGGCAACAGGTACCCATAAACGCCACAGGTTCCGTCATCGTGGAGATCCACGACAAGAGAATGACGGACAATGAATCGTTACAGGCGTCCTGGACATTCCCGATCAGGTGCAACATAGATCTCCACTACTTTTCATGCTCGTTCTTCTCCCTGAAAGACCCAATTCCCTGGAAATTGTATTACAGAGTGAGCGACACGAATGTTCACCAGAGAACGCACTTCGCGAAATTCAAGGGGAAGCTAAAGCTGTCAACGGCGAAACATTCCGTCGACATTCCTTTCCGAGCACCGACGGTGAAGATCTTATCTAAACAGTTCACAGATAGAGACGTAGATTTCAGCCACGTGGGCTATGGGAAATGGGAAAGGAAATTGATCCGATCCGCATCCACAGTCAAGTATGGGCTCCCAAGCCCAATAACCATTGATCCAGGTGAGACATGGGCTTCACGCAGTACCATAGGGATCGGTCAATCGAGCACCGAGTCAGAGGTAGAGAACGCAACACACCCATATAGAGGGCTCCATAAACTGGGCACCAGCATGTTGGACCCAGGTGACTCGGCTTCCATAGTTGCTGCGAGAAGGGCCGAATCGCATATAACCATGTCCGAGGCACAATTAAACGACCTAGTGAGGAGTGCGGTCCAGGAGTGTATTAAAACAAATTGTATTCCCCCACAGCCCAAATCATTAAGTTAA
Protein Sequence MGSQLVNPPNAFNYIESQRDEYQLSHDLTEIVLQFPSAAAQISARLSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINATGSVIVEIHDKRMTDNESLQASWTFPIRCNIDLHYFSCSFFSLKDPIPWKLYYRVSDTNVHQRTHFAKFKGKLKLSTAKHSVDIPFRAPTVKILSKQFTDRDVDFSHVGYGKWERKLIRSASTVKYGLPSPITIDPGETWASRSTIGIGQSSTESEVENATHPYRGLHKLGTSMLDPGDSASIVAARRAESHITMSEAQLNDLVRSAVQECIKTNCIPPQPKSLS