Merremia mosaic virus


Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_000867165.1
Isolate Puerto Rico
Release date 2015/2/13
Submitter Brown,J.K., Idris,A.M., Torres-Jerez,I., Banks,G.K., Wyatt,S.D., Baumann,K., Bird,J.
Vector
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Genomic Organization


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Genome

NC_007965
ACCGGATGGCCGCCCGCCGCGCCCCCCCTGGGCCCACATATTAAAGCCGTCCAATCACAAAGCGTCCTGGAAGTCTAATTGTTTAAAATAAGCCTATAAATACATTGGAGTCCGTCTATACCCCACCAACTTTAATTTAAAATGGTTAAGAGGGACGCCCCATGGCGTTTAATGGCGGGGACCACTAAAGTTAGTCGCAACGCCAATTTCTCGCCACGTGGAGGTATGGGCCCTAAGGCCGCTGCTTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATTTATCGCACTTTGAGAGGGCCTGATGTTCCTAAAGGTTGTGAAGGCCCATGTAAGGTACAGTCTTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCTCATGTTGGTAAGGTAATCTGTATATCCGATGTAACTCGTGGTAACGGTATTACCCACCGTGTTGGCAAGCGTTTTTGTGTGAAGTCTGTGTATATTCTAGGTAAAATATGGATGGATGAGAACATAAAGCTGAAGAACCACACGAACAGCGTCATGTTTTGGTTGATTCGTGACAGGAGACCCTATGGTACCCCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGACAATGAGCCGAGTACTGCTACCGTCAAGAACGATCTTCGCGATCGATTTCAAGTCATGCATAGGTTCTATGCCAAAGTAACTGGTGGTCAGTATGCCAGTAACGAGCAGGCATTGGTTCGGCGATTTTGGAAGGTTAACAACTACGTCGTGTATAACCATCAGGAAGCAGGAAAATACGAGAATCACACGGAGAATGCTCTGTTATTGTATATGGCATCTACTCATGCTTCTAATCCTGTGTATGCTACCTTGAAAATTCGTAGTTATTTTTATGACTCCATTTCGAATTAATAAAGATTAAATTTTATTGAATGTCTTTCGAGCACACAATTTACATATGGTTTATCCGTTGCGAAACGAACAGCTCTAATGACATTGTTAAGCGAAACAACACCTAATTGATCTAAATACATTAAAACTAAATCTTTAAATCTATTTAAATATGTCGTCCCAGAAGCTTGAACTGATGTCGTCCAGATTTGGAAGTTCAGGTATGCTTTGTGTAGACTCAACGCCTTCCTCAGGTTGTAGTTGAACCGTATTTGGATGGTGTATATTCTGGTTGTGGTGTATATTGGCTCCTCCACTTGGATTATCTTGAAATAGAGGGGATTTGGAACCTCCCAGATAAAAACGCCATTCATTGCTTGATGAGCAGTGATGGGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGGTTTCTGCAGTTGATGTGTACGTAAATTGAACAGCCACAGTCCAGGTCTAACCTTCTCCGTCTAATGACAGATTTGGATCTCTTCGCTCTCCTGTGCTGTGCTTTGATAGAGGGGGGAGTTGAGGAAGATGAATTTTGCATTGTGGATCGTCCACGCTCTGAGAGATGCGTTTTCATCTTTATCGAGGAAGTCTTTATAGCTAGCCCCCTCTCCTGGATTGCACAGCACGATTGAGGGTATTCCTCCTTTAGTTTGAACTGGCTTCCCGTATTTACAGTTGGACTGCCAGTCCTTTTGGGCCCCTATCAATTCTTTCCAATGCTTTAATTTCAAATAATTAGGGCTTATGTCATCAATGACGTTATATTCGACGTCATTCGAATAGACTCTGCCATTAAAGTCAAGATGTCCACTAAGATAATTATGTTTACCTAATGAACGGGCCCACATTGTTTTTCCAGTTCGACTATCTCCTTCGATGATGATACTTATCGGTCTATCTGCCCGCGCAGCGGCACCCCTCCCAAAGTAGTTGTCTGCCCATTCTTGCATCTCATCTGGAACGTTCGTGAAGGAGGAGAGTTGAAACGGAGGAACCCATGGTTCTGGAGACTTCTGAAATATTCTTGTTGCGTTCGCAACGAGATTGTGATGTTGAAGAAAGAAGTGTTGTGGTTGTTCCTCCTTTATTATTTGCAGTGCTTCCTCTGCAGAAGCTGCGTTTAACGCCTTTGCGTATGTATCGTTAGAAGACTGCTGACCTCCTCTAGCAGATCTTCCGTCGATCTGGAATTGTCCCCATTCAATTGTATCTCCGTCCTTGTCGATGTAGGACTTGACATCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGGGATACCAAATCGAAGAATCTGTTATTCGTGCAGTTGTATTTTCCTTCGAACTGGATAAGCACATGAAGATGAGGTTCCCCATTATCGTGAAGCTCTCTACAGATCTTGATGAATTTTTTGTTTACAGGGGTGTGCAGAGCTTTGATTTGGGACAGTGCTTCTTCTTTGGCTAATGAACATATAGGGTATGTGAGGAAATAGTTTTTGGCTTTTATTGAGAATGAACCCTTCCGTGGCATTTTTGTAATAAGGGATGTTCCCCCAATTGCTCCGCTCTCAAAACTCTATATGAATCGGGGGAACTGGGGGTACATTTATACTAGAACTCTCATTAAAGGGATTTGCAACACGTGGCGGCCATCCGCTATAATATT

NC_007966
ACCGGATGGCCGCCCGCCGCGCCCCCCCTGGCCCCACATGGTGCCCACCAGCTGTGATGCACTTTGTAAAGGTAATACGTGGAACGCTCGTATGCATTCATTTGAACTAACTGTTAACTTTCTTCTTTAATTTGAATTATTGTCGCGCTACTATGAAAGGTTGGGTCATACTTACAATGATTAAATTGTTTAACGTAATGTACGATTTGGAGACGTGGACCAGTTATAACCATTATACATCGTCAAATTAGTTTGCCGTCTCTTTAAGATCTATATATATATATGCTTGAACGTGGAGTTATGTAAACATATATTTTATTAATATCTATTACTAGAATATGTATTCTTTTAGATATAGACCGTATCATTTTAATTATCGGAAACGATTTTACACACGTACGCAAGTGTCTAAACGGGTAGCCCCGTTTAAACGAGCTGATGTGAAATGTCGAACGAGGCAGACGACTATCGTTCATGATGAGACTAAGATGTCTTCGCAGCGCATTCATGAGAACCAATTTGGTCCAGAGTTTGTGATGACACATAACTCCGCCATATCCACTTTCATTAATTATCCTACTTTGAGTAAGACCGAGCCTAACAGAAGCAGATCTTACATTAAGTTGAAACGCTTGCGGTTTAAGGGTACTGTTAAAATTGAGCGTGTGTATGCGGATATGAACATGGATGGTTTGAACCCTAAAGTTGAAGGGGTATTCACTCTTGCTGTTGTAGTTGACCGAAAACCTCATTTAAAGCCATCTGGATGTCTGCATACATTTGATGAGGTATTTGGTGCACGGATTCACAGTCATGGTACGTTAGCCATTACTCCGTCACTGACAGATCGTTACTACATTCGCCATGTGTTTAAACGTGTAATGTCTGTTGAGAAGGATACTGCCATGGTTGATGTGGAAGGATCGATGTCTCTCTCTAATAAGCGTTTTAATTGTTGGGCTACGTTTAAGGATCTTGATCATGAATCTTGTAAGGGTGTTTATGACAATATTAGCAAAAACGCCTTGTTAATTTATTATTGTTGGATGTCTGATGTACCATCTAAGGCATCGTCATTTGTATCATTTGATTTGGATTATGTTGGCTAAATAAAAATATGTAATTTCTGTTTTAAATAAATAACTGTGTATTGAACAATAAATTCTATTTTAACGATTTCGGCTGAGCCGGTGTACAATTACTATTAATACACTCATGGACCGTTGATCGTACAAGATCATTTAATTGGGCCATTGACATTGTTATATTGGATTGGGCCCTTGAAGCCCCTACGATTGAAGCAGAATCACCTGGATCCAACGCACTGGTTCCCAGACGATTGAGTTGCCTGTATGGGTGTATTGCATTTTCCAGTTCCGAATCTGTGTCCGTTTGGCCTATACCGATTGTGCTTCTTGAGGCCCATGACTCGCCTGGTAATAATTCTATTGGGCTTGGTAGCCCAATTCTTGCCATTGAGATTGACCGGATCATTTTTCTTTCCCATCTCCCGTAGCCCACATGTGAGAAATCGACATCCTTCTCGGAAAATTGCTTAGACAGGATCTTCACCGCCGGAGCTCTGAATGGGATATCTACAGAATGTTTCGCTGTCGACAGTTTTAGTTTCCCTTTGAACTTGGCGAAATGTGTTCGTTGGTGTATGTTTGAATCACAGACTCTGTAGTATAGTTTCCACGGGATTGGGTCTTTCAGTGAGAAGAAAGACGAGGAAAAGTAATGAAGGTCTATGTTGCATCTGATTGGGAACGTCCATGATGCTTGTAATGATTCGTTATCCGTCATCCTTCTGTCGTGGATCTCCACAATTACAGTACCTATTGCGTTTATCGGTACCTGTTGCCTGTATTCTATGACGCAGTGATCTATTTTCATACAACTGCGACTTAATCTTGCTGATAATTGAGCCGCTGCTGACGGAAAGTGCAGTATTATCTCAGTTAAATCATGAGATAGCTGATATTCGTCTCTGTGAGATTCTATATAATTAAAGGCACTTGGAGGATTAACCAATTGAGCATCCATATAGCAAAATTAGCCCGCGCAGCGGAATGGATCTAACTGAGAGACGTCGTGGTGATTAATATAGGATGTTTTCTTGAAGAAAAGAAGATGATATTTGGGAGAGTAGATCTGGATGTTTGTGAGGTTTTTGTTGTGAAGAAGTATATGTGGTTCTGTCTATATATAGACTTTATTAATGTATTGGAAATAAACTAATAACAATTGCTTCATTGACACGTTTATGGTTGTACTATGTCTCTTACTGTTGCTAAAGAAGTTTAAGATCTATACTGGAAGCACTTAGTGGCATTTGTGTAATAAGGGATGTTCCCCCAATTGCTAAGGGGTGTTCCCCCAATTGCTCCGCTCTCAAAACTCTCTATGAATTGGGGGAACTGGGGGTACATTTATACTAGAACTCTCATTAAAGGGATTTGCAACACGTGGCGGCCATCCGCTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_579167.1
Location 142-888
Gene Name AV1
Protein Name coat protein
Coding Region ATGGTTAAGAGGGACGCCCCATGGCGTTTAATGGCGGGGACCACTAAAGTTAGTCGCAACGCCAATTTCTCGCCACGTGGAGGTATGGGCCCTAAGGCCGCTGCTTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATTTATCGCACTTTGAGAGGGCCTGATGTTCCTAAAGGTTGTGAAGGCCCATGTAAGGTACAGTCTTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCTCATGTTGGTAAGGTAATCTGTATATCCGATGTAACTCGTGGTAACGGTATTACCCACCGTGTTGGCAAGCGTTTTTGTGTGAAGTCTGTGTATATTCTAGGTAAAATATGGATGGATGAGAACATAAAGCTGAAGAACCACACGAACAGCGTCATGTTTTGGTTGATTCGTGACAGGAGACCCTATGGTACCCCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGACAATGAGCCGAGTACTGCTACCGTCAAGAACGATCTTCGCGATCGATTTCAAGTCATGCATAGGTTCTATGCCAAAGTAACTGGTGGTCAGTATGCCAGTAACGAGCAGGCATTGGTTCGGCGATTTTGGAAGGTTAACAACTACGTCGTGTATAACCATCAGGAAGCAGGAAAATACGAGAATCACACGGAGAATGCTCTGTTATTGTATATGGCATCTACTCATGCTTCTAATCCTGTGTATGCTACCTTGAAAATTCGTAGTTATTTTTATGACTCCATTTCGAATTAA
Protein Sequence MVKRDAPWRLMAGTTKVSRNANFSPRGGMGPKAAAWVNRPMYRKPRIYRTLRGPDVPKGCEGPCKVQSFEQRHDISHVGKVICISDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVMFWLIRDRRPYGTPMDFGQVFNMYDNEPSTATVKNDLRDRFQVMHRFYAKVTGGQYASNEQALVRRFWKVNNYVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMASTHASNPVYATLKIRSYFYDSISN

NCBI Accession YP_579168.1
Location 885-1283
Gene Name AC3
Protein Name AC3
Coding Region ATGGATTCACGCACAGGGGAACCCATCACTGCTCATCAAGCAATGAATGGCGTTTTTATCTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATAATCCAAGTGGAGGAGCCAATATACACCACAACCAGAATATACACCATCCAAATACGGTTCAACTACAACCTGAGGAAGGCGTTGAGTCTACACAAAGCATACCTGAACTTCCAAATCTGGACGACATCAGTTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAGATTTAAAGATTTAGTTTTAATGTATTTAGATCAATTAGGTGTTGTTTCGCTTAACAATGTCATTAGAGCTGTTCGTTTCGCAACGGATAAACCATATGTAAATTGTGTGCTCGAAAGACATTCAATAAAATTTAATCTTTATTAA
Protein Sequence MDSRTGEPITAHQAMNGVFIWEVPNPLYFKIIQVEEPIYTTTRIYTIQIRFNYNLRKALSLHKAYLNFQIWTTSVQASGTTYLNRFKDLVLMYLDQLGVVSLNNVIRAVRFATDKPYVNCVLERHSIKFNLY

NCBI Accession YP_579169.1
Location 1030-1461
Gene Name AC2
Protein Name AC2
Coding Region ATGAAAACGCATCTCTCAGAGCGTGGACGATCCACAATGCAAAATTCATCTTCCTCAACTCCCCCCTCTATCAAAGCACAGCACAGGAGAGCGAAGAGATCCAAATCTGTCATTAGACGGAGAAGGTTAGACCTGGACTGTGGCTGTTCAATTTACGTACACATCAACTGCAGAAACCATGGATTCACGCACAGGGGAACCCATCACTGCTCATCAAGCAATGAATGGCGTTTTTATCTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATAATCCAAGTGGAGGAGCCAATATACACCACAACCAGAATATACACCATCCAAATACGGTTCAACTACAACCTGAGGAAGGCGTTGAGTCTACACAAAGCATACCTGAACTTCCAAATCTGGACGACATCAGTTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAG
Protein Sequence MKTHLSERGRSTMQNSSSSTPPSIKAQHRRAKRSKSVIRRRRLDLDCGCSIYVHINCRNHGFTHRGTHHCSSSNEWRFYLGGSKSPLFQDNPSGGANIHHNQNIHHPNTVQLQPEEGVESTQSIPELPNLDDISSSFWDDIFK

NCBI Accession YP_579170.1
Location 1346-2422
Gene Name AC1
Protein Name AC1
Coding Region ATGCCACGGAAGGGTTCATTCTCAATAAAAGCCAAAAACTATTTCCTCACATACCCTATATGTTCATTAGCCAAAGAAGAAGCACTGTCCCAAATCAAAGCTCTGCACACCCCTGTAAACAAAAAATTCATCAAGATCTGTAGAGAGCTTCACGATAATGGGGAACCTCATCTTCATGTGCTTATCCAGTTCGAAGGAAAATACAACTGCACGAATAACAGATTCTTCGATTTGGTATCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAATCCAGCTCCGATGTCAAGTCCTACATCGACAAGGACGGAGATACAATTGAATGGGGACAATTCCAGATCGACGGAAGATCTGCTAGAGGAGGTCAGCAGTCTTCTAACGATACATACGCAAAGGCGTTAAACGCAGCTTCTGCAGAGGAAGCACTGCAAATAATAAAGGAGGAACAACCACAACACTTCTTTCTTCAACATCACAATCTCGTTGCGAACGCAACAAGAATATTTCAGAAGTCTCCAGAACCATGGGTTCCTCCGTTTCAACTCTCCTCCTTCACGAACGTTCCAGATGAGATGCAAGAATGGGCAGACAACTACTTTGGGAGGGGTGCCGCTGCGCGGGCAGATAGACCGATAAGTATCATCATCGAAGGAGATAGTCGAACTGGAAAAACAATGTGGGCCCGTTCATTAGGTAAACATAATTATCTTAGTGGACATCTTGACTTTAATGGCAGAGTCTATTCGAATGACGTCGAATATAACGTCATTGATGACATAAGCCCTAATTATTTGAAATTAAAGCATTGGAAAGAATTGATAGGGGCCCAAAAGGACTGGCAGTCCAACTGTAAATACGGGAAGCCAGTTCAAACTAAAGGAGGAATACCCTCAATCGTGCTGTGCAATCCAGGAGAGGGGGCTAGCTATAAAGACTTCCTCGATAAAGATGAAAACGCATCTCTCAGAGCGTGGACGATCCACAATGCAAAATTCATCTTCCTCAACTCCCCCCTCTATCAAAGCACAGCACAGGAGAGCGAAGAGATCCAAATCTGTCATTAG
Protein Sequence MPRKGSFSIKAKNYFLTYPICSLAKEEALSQIKALHTPVNKKFIKICRELHDNGEPHLHVLIQFEGKYNCTNNRFFDLVSPTRSAHFHPNIQGAKSSSDVKSYIDKDGDTIEWGQFQIDGRSARGGQQSSNDTYAKALNAASAEEALQIIKEEQPQHFFLQHHNLVANATRIFQKSPEPWVPPFQLSSFTNVPDEMQEWADNYFGRGAAARADRPISIIIEGDSRTGKTMWARSLGKHNYLSGHLDFNGRVYSNDVEYNVIDDISPNYLKLKHWKELIGAQKDWQSNCKYGKPVQTKGGIPSIVLCNPGEGASYKDFLDKDENASLRAWTIHNAKFIFLNSPLYQSTAQESEEIQICH

NCBI Accession YP_579171.1
Location 339-1109
Protein Name BV1 protein
Coding Region ATGTATTCTTTTAGATATAGACCGTATCATTTTAATTATCGGAAACGATTTTACACACGTACGCAAGTGTCTAAACGGGTAGCCCCGTTTAAACGAGCTGATGTGAAATGTCGAACGAGGCAGACGACTATCGTTCATGATGAGACTAAGATGTCTTCGCAGCGCATTCATGAGAACCAATTTGGTCCAGAGTTTGTGATGACACATAACTCCGCCATATCCACTTTCATTAATTATCCTACTTTGAGTAAGACCGAGCCTAACAGAAGCAGATCTTACATTAAGTTGAAACGCTTGCGGTTTAAGGGTACTGTTAAAATTGAGCGTGTGTATGCGGATATGAACATGGATGGTTTGAACCCTAAAGTTGAAGGGGTATTCACTCTTGCTGTTGTAGTTGACCGAAAACCTCATTTAAAGCCATCTGGATGTCTGCATACATTTGATGAGGTATTTGGTGCACGGATTCACAGTCATGGTACGTTAGCCATTACTCCGTCACTGACAGATCGTTACTACATTCGCCATGTGTTTAAACGTGTAATGTCTGTTGAGAAGGATACTGCCATGGTTGATGTGGAAGGATCGATGTCTCTCTCTAATAAGCGTTTTAATTGTTGGGCTACGTTTAAGGATCTTGATCATGAATCTTGTAAGGGTGTTTATGACAATATTAGCAAAAACGCCTTGTTAATTTATTATTGTTGGATGTCTGATGTACCATCTAAGGCATCGTCATTTGTATCATTTGATTTGGATTATGTTGGCTAA
Protein Sequence MYSFRYRPYHFNYRKRFYTRTQVSKRVAPFKRADVKCRTRQTTIVHDETKMSSQRIHENQFGPEFVMTHNSAISTFINYPTLSKTEPNRSRSYIKLKRLRFKGTVKIERVYADMNMDGLNPKVEGVFTLAVVVDRKPHLKPSGCLHTFDEVFGARIHSHGTLAITPSLTDRYYIRHVFKRVMSVEKDTAMVDVEGSMSLSNKRFNCWATFKDLDHESCKGVYDNISKNALLIYYCWMSDVPSKASSFVSFDLDYVG

NCBI Accession YP_579172.1
Location 1165-2046
Protein Name BC1 protein
Coding Region ATGGATGCTCAATTGGTTAATCCTCCAAGTGCCTTTAATTATATAGAATCTCACAGAGACGAATATCAGCTATCTCATGATTTAACTGAGATAATACTGCACTTTCCGTCAGCAGCGGCTCAATTATCAGCAAGATTAAGTCGCAGTTGTATGAAAATAGATCACTGCGTCATAGAATACAGGCAACAGGTACCGATAAACGCAATAGGTACTGTAATTGTGGAGATCCACGACAGAAGGATGACGGATAACGAATCATTACAAGCATCATGGACGTTCCCAATCAGATGCAACATAGACCTTCATTACTTTTCCTCGTCTTTCTTCTCACTGAAAGACCCAATCCCGTGGAAACTATACTACAGAGTCTGTGATTCAAACATACACCAACGAACACATTTCGCCAAGTTCAAAGGGAAACTAAAACTGTCGACAGCGAAACATTCTGTAGATATCCCATTCAGAGCTCCGGCGGTGAAGATCCTGTCTAAGCAATTTTCCGAGAAGGATGTCGATTTCTCACATGTGGGCTACGGGAGATGGGAAAGAAAAATGATCCGGTCAATCTCAATGGCAAGAATTGGGCTACCAAGCCCAATAGAATTATTACCAGGCGAGTCATGGGCCTCAAGAAGCACAATCGGTATAGGCCAAACGGACACAGATTCGGAACTGGAAAATGCAATACACCCATACAGGCAACTCAATCGTCTGGGAACCAGTGCGTTGGATCCAGGTGATTCTGCTTCAATCGTAGGGGCTTCAAGGGCCCAATCCAATATAACAATGTCAATGGCCCAATTAAATGATCTTGTACGATCAACGGTCCATGAGTGTATTAATAGTAATTGTACACCGGCTCAGCCGAAATCGTTAAAATAG
Protein Sequence MDAQLVNPPSAFNYIESHRDEYQLSHDLTEIILHFPSAAAQLSARLSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINAIGTVIVEIHDRRMTDNESLQASWTFPIRCNIDLHYFSSSFFSLKDPIPWKLYYRVCDSNIHQRTHFAKFKGKLKLSTAKHSVDIPFRAPAVKILSKQFSEKDVDFSHVGYGRWERKMIRSISMARIGLPSPIELLPGESWASRSTIGIGQTDTDSELENAIHPYRQLNRLGTSALDPGDSASIVGASRAQSNITMSMAQLNDLVRSTVHECINSNCTPAQPKSLK