Merremia mosaic virus
Basic Information
Genus |
Begomovirus
|
NCBI Assembly |
GCF_000867165.1 |
Isolate |
Puerto Rico |
Release date |
2015/2/13 |
Submitter |
Brown,J.K., Idris,A.M., Torres-Jerez,I., Banks,G.K., Wyatt,S.D., Baumann,K., Bird,J. |
Vector |
|
Download |
Genome
|GFF3
|PEP
|CDS |
Genomic Organization
JBrowse
Genome
ACCGGATGGCCGCCCGCCGCGCCCCCCCTGGGCCCACATATTAAAGCCGTCCAATCACAAAGCGTCCTGGAAGTCTAATTGTTTAAAATAAGCCTATAAATACATTGGAGTCCGTCTATACCCCACCAACTTTAATTTAAAATGGTTAAGAGGGACGCCCCATGGCGTTTAATGGCGGGGACCACTAAAGTTAGTCGCAACGCCAATTTCTCGCCACGTGGAGGTATGGGCCCTAAGGCCGCTGCTTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATTTATCGCACTTTGAGAGGGCCTGATGTTCCTAAAGGTTGTGAAGGCCCATGTAAGGTACAGTCTTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCTCATGTTGGTAAGGTAATCTGTATATCCGATGTAACTCGTGGTAACGGTATTACCCACCGTGTTGGCAAGCGTTTTTGTGTGAAGTCTGTGTATATTCTAGGTAAAATATGGATGGATGAGAACATAAAGCTGAAGAACCACACGAACAGCGTCATGTTTTGGTTGATTCGTGACAGGAGACCCTATGGTACCCCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGACAATGAGCCGAGTACTGCTACCGTCAAGAACGATCTTCGCGATCGATTTCAAGTCATGCATAGGTTCTATGCCAAAGTAACTGGTGGTCAGTATGCCAGTAACGAGCAGGCATTGGTTCGGCGATTTTGGAAGGTTAACAACTACGTCGTGTATAACCATCAGGAAGCAGGAAAATACGAGAATCACACGGAGAATGCTCTGTTATTGTATATGGCATCTACTCATGCTTCTAATCCTGTGTATGCTACCTTGAAAATTCGTAGTTATTTTTATGACTCCATTTCGAATTAATAAAGATTAAATTTTATTGAATGTCTTTCGAGCACACAATTTACATATGGTTTATCCGTTGCGAAACGAACAGCTCTAATGACATTGTTAAGCGAAACAACACCTAATTGATCTAAATACATTAAAACTAAATCTTTAAATCTATTTAAATATGTCGTCCCAGAAGCTTGAACTGATGTCGTCCAGATTTGGAAGTTCAGGTATGCTTTGTGTAGACTCAACGCCTTCCTCAGGTTGTAGTTGAACCGTATTTGGATGGTGTATATTCTGGTTGTGGTGTATATTGGCTCCTCCACTTGGATTATCTTGAAATAGAGGGGATTTGGAACCTCCCAGATAAAAACGCCATTCATTGCTTGATGAGCAGTGATGGGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGGTTTCTGCAGTTGATGTGTACGTAAATTGAACAGCCACAGTCCAGGTCTAACCTTCTCCGTCTAATGACAGATTTGGATCTCTTCGCTCTCCTGTGCTGTGCTTTGATAGAGGGGGGAGTTGAGGAAGATGAATTTTGCATTGTGGATCGTCCACGCTCTGAGAGATGCGTTTTCATCTTTATCGAGGAAGTCTTTATAGCTAGCCCCCTCTCCTGGATTGCACAGCACGATTGAGGGTATTCCTCCTTTAGTTTGAACTGGCTTCCCGTATTTACAGTTGGACTGCCAGTCCTTTTGGGCCCCTATCAATTCTTTCCAATGCTTTAATTTCAAATAATTAGGGCTTATGTCATCAATGACGTTATATTCGACGTCATTCGAATAGACTCTGCCATTAAAGTCAAGATGTCCACTAAGATAATTATGTTTACCTAATGAACGGGCCCACATTGTTTTTCCAGTTCGACTATCTCCTTCGATGATGATACTTATCGGTCTATCTGCCCGCGCAGCGGCACCCCTCCCAAAGTAGTTGTCTGCCCATTCTTGCATCTCATCTGGAACGTTCGTGAAGGAGGAGAGTTGAAACGGAGGAACCCATGGTTCTGGAGACTTCTGAAATATTCTTGTTGCGTTCGCAACGAGATTGTGATGTTGAAGAAAGAAGTGTTGTGGTTGTTCCTCCTTTATTATTTGCAGTGCTTCCTCTGCAGAAGCTGCGTTTAACGCCTTTGCGTATGTATCGTTAGAAGACTGCTGACCTCCTCTAGCAGATCTTCCGTCGATCTGGAATTGTCCCCATTCAATTGTATCTCCGTCCTTGTCGATGTAGGACTTGACATCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGGGATACCAAATCGAAGAATCTGTTATTCGTGCAGTTGTATTTTCCTTCGAACTGGATAAGCACATGAAGATGAGGTTCCCCATTATCGTGAAGCTCTCTACAGATCTTGATGAATTTTTTGTTTACAGGGGTGTGCAGAGCTTTGATTTGGGACAGTGCTTCTTCTTTGGCTAATGAACATATAGGGTATGTGAGGAAATAGTTTTTGGCTTTTATTGAGAATGAACCCTTCCGTGGCATTTTTGTAATAAGGGATGTTCCCCCAATTGCTCCGCTCTCAAAACTCTATATGAATCGGGGGAACTGGGGGTACATTTATACTAGAACTCTCATTAAAGGGATTTGCAACACGTGGCGGCCATCCGCTATAATATT
ACCGGATGGCCGCCCGCCGCGCCCCCCCTGGCCCCACATGGTGCCCACCAGCTGTGATGCACTTTGTAAAGGTAATACGTGGAACGCTCGTATGCATTCATTTGAACTAACTGTTAACTTTCTTCTTTAATTTGAATTATTGTCGCGCTACTATGAAAGGTTGGGTCATACTTACAATGATTAAATTGTTTAACGTAATGTACGATTTGGAGACGTGGACCAGTTATAACCATTATACATCGTCAAATTAGTTTGCCGTCTCTTTAAGATCTATATATATATATGCTTGAACGTGGAGTTATGTAAACATATATTTTATTAATATCTATTACTAGAATATGTATTCTTTTAGATATAGACCGTATCATTTTAATTATCGGAAACGATTTTACACACGTACGCAAGTGTCTAAACGGGTAGCCCCGTTTAAACGAGCTGATGTGAAATGTCGAACGAGGCAGACGACTATCGTTCATGATGAGACTAAGATGTCTTCGCAGCGCATTCATGAGAACCAATTTGGTCCAGAGTTTGTGATGACACATAACTCCGCCATATCCACTTTCATTAATTATCCTACTTTGAGTAAGACCGAGCCTAACAGAAGCAGATCTTACATTAAGTTGAAACGCTTGCGGTTTAAGGGTACTGTTAAAATTGAGCGTGTGTATGCGGATATGAACATGGATGGTTTGAACCCTAAAGTTGAAGGGGTATTCACTCTTGCTGTTGTAGTTGACCGAAAACCTCATTTAAAGCCATCTGGATGTCTGCATACATTTGATGAGGTATTTGGTGCACGGATTCACAGTCATGGTACGTTAGCCATTACTCCGTCACTGACAGATCGTTACTACATTCGCCATGTGTTTAAACGTGTAATGTCTGTTGAGAAGGATACTGCCATGGTTGATGTGGAAGGATCGATGTCTCTCTCTAATAAGCGTTTTAATTGTTGGGCTACGTTTAAGGATCTTGATCATGAATCTTGTAAGGGTGTTTATGACAATATTAGCAAAAACGCCTTGTTAATTTATTATTGTTGGATGTCTGATGTACCATCTAAGGCATCGTCATTTGTATCATTTGATTTGGATTATGTTGGCTAAATAAAAATATGTAATTTCTGTTTTAAATAAATAACTGTGTATTGAACAATAAATTCTATTTTAACGATTTCGGCTGAGCCGGTGTACAATTACTATTAATACACTCATGGACCGTTGATCGTACAAGATCATTTAATTGGGCCATTGACATTGTTATATTGGATTGGGCCCTTGAAGCCCCTACGATTGAAGCAGAATCACCTGGATCCAACGCACTGGTTCCCAGACGATTGAGTTGCCTGTATGGGTGTATTGCATTTTCCAGTTCCGAATCTGTGTCCGTTTGGCCTATACCGATTGTGCTTCTTGAGGCCCATGACTCGCCTGGTAATAATTCTATTGGGCTTGGTAGCCCAATTCTTGCCATTGAGATTGACCGGATCATTTTTCTTTCCCATCTCCCGTAGCCCACATGTGAGAAATCGACATCCTTCTCGGAAAATTGCTTAGACAGGATCTTCACCGCCGGAGCTCTGAATGGGATATCTACAGAATGTTTCGCTGTCGACAGTTTTAGTTTCCCTTTGAACTTGGCGAAATGTGTTCGTTGGTGTATGTTTGAATCACAGACTCTGTAGTATAGTTTCCACGGGATTGGGTCTTTCAGTGAGAAGAAAGACGAGGAAAAGTAATGAAGGTCTATGTTGCATCTGATTGGGAACGTCCATGATGCTTGTAATGATTCGTTATCCGTCATCCTTCTGTCGTGGATCTCCACAATTACAGTACCTATTGCGTTTATCGGTACCTGTTGCCTGTATTCTATGACGCAGTGATCTATTTTCATACAACTGCGACTTAATCTTGCTGATAATTGAGCCGCTGCTGACGGAAAGTGCAGTATTATCTCAGTTAAATCATGAGATAGCTGATATTCGTCTCTGTGAGATTCTATATAATTAAAGGCACTTGGAGGATTAACCAATTGAGCATCCATATAGCAAAATTAGCCCGCGCAGCGGAATGGATCTAACTGAGAGACGTCGTGGTGATTAATATAGGATGTTTTCTTGAAGAAAAGAAGATGATATTTGGGAGAGTAGATCTGGATGTTTGTGAGGTTTTTGTTGTGAAGAAGTATATGTGGTTCTGTCTATATATAGACTTTATTAATGTATTGGAAATAAACTAATAACAATTGCTTCATTGACACGTTTATGGTTGTACTATGTCTCTTACTGTTGCTAAAGAAGTTTAAGATCTATACTGGAAGCACTTAGTGGCATTTGTGTAATAAGGGATGTTCCCCCAATTGCTAAGGGGTGTTCCCCCAATTGCTCCGCTCTCAAAACTCTCTATGAATTGGGGGAACTGGGGGTACATTTATACTAGAACTCTCATTAAAGGGATTTGCAACACGTGGCGGCCATCCGCTATAATATT
Gene Information
NCBI Accession
|
YP_579167.1
|
Location
|
142-888 |
Gene Name
|
AV1 |
Protein Name
|
coat protein |
Coding Region
|
ATGGTTAAGAGGGACGCCCCATGGCGTTTAATGGCGGGGACCACTAAAGTTAGTCGCAACGCCAATTTCTCGCCACGTGGAGGTATGGGCCCTAAGGCCGCTGCTTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATTTATCGCACTTTGAGAGGGCCTGATGTTCCTAAAGGTTGTGAAGGCCCATGTAAGGTACAGTCTTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCTCATGTTGGTAAGGTAATCTGTATATCCGATGTAACTCGTGGTAACGGTATTACCCACCGTGTTGGCAAGCGTTTTTGTGTGAAGTCTGTGTATATTCTAGGTAAAATATGGATGGATGAGAACATAAAGCTGAAGAACCACACGAACAGCGTCATGTTTTGGTTGATTCGTGACAGGAGACCCTATGGTACCCCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGACAATGAGCCGAGTACTGCTACCGTCAAGAACGATCTTCGCGATCGATTTCAAGTCATGCATAGGTTCTATGCCAAAGTAACTGGTGGTCAGTATGCCAGTAACGAGCAGGCATTGGTTCGGCGATTTTGGAAGGTTAACAACTACGTCGTGTATAACCATCAGGAAGCAGGAAAATACGAGAATCACACGGAGAATGCTCTGTTATTGTATATGGCATCTACTCATGCTTCTAATCCTGTGTATGCTACCTTGAAAATTCGTAGTTATTTTTATGACTCCATTTCGAATTAA |
Protein Sequence
|
MVKRDAPWRLMAGTTKVSRNANFSPRGGMGPKAAAWVNRPMYRKPRIYRTLRGPDVPKGCEGPCKVQSFEQRHDISHVGKVICISDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVMFWLIRDRRPYGTPMDFGQVFNMYDNEPSTATVKNDLRDRFQVMHRFYAKVTGGQYASNEQALVRRFWKVNNYVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMASTHASNPVYATLKIRSYFYDSISN |
NCBI Accession
|
YP_579168.1
|
Location
|
885-1283 |
Gene Name
|
AC3 |
Protein Name
|
AC3 |
Coding Region
|
ATGGATTCACGCACAGGGGAACCCATCACTGCTCATCAAGCAATGAATGGCGTTTTTATCTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATAATCCAAGTGGAGGAGCCAATATACACCACAACCAGAATATACACCATCCAAATACGGTTCAACTACAACCTGAGGAAGGCGTTGAGTCTACACAAAGCATACCTGAACTTCCAAATCTGGACGACATCAGTTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAGATTTAAAGATTTAGTTTTAATGTATTTAGATCAATTAGGTGTTGTTTCGCTTAACAATGTCATTAGAGCTGTTCGTTTCGCAACGGATAAACCATATGTAAATTGTGTGCTCGAAAGACATTCAATAAAATTTAATCTTTATTAA |
Protein Sequence
|
MDSRTGEPITAHQAMNGVFIWEVPNPLYFKIIQVEEPIYTTTRIYTIQIRFNYNLRKALSLHKAYLNFQIWTTSVQASGTTYLNRFKDLVLMYLDQLGVVSLNNVIRAVRFATDKPYVNCVLERHSIKFNLY |
NCBI Accession
|
YP_579169.1
|
Location
|
1030-1461 |
Gene Name
|
AC2 |
Protein Name
|
AC2 |
Coding Region
|
ATGAAAACGCATCTCTCAGAGCGTGGACGATCCACAATGCAAAATTCATCTTCCTCAACTCCCCCCTCTATCAAAGCACAGCACAGGAGAGCGAAGAGATCCAAATCTGTCATTAGACGGAGAAGGTTAGACCTGGACTGTGGCTGTTCAATTTACGTACACATCAACTGCAGAAACCATGGATTCACGCACAGGGGAACCCATCACTGCTCATCAAGCAATGAATGGCGTTTTTATCTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATAATCCAAGTGGAGGAGCCAATATACACCACAACCAGAATATACACCATCCAAATACGGTTCAACTACAACCTGAGGAAGGCGTTGAGTCTACACAAAGCATACCTGAACTTCCAAATCTGGACGACATCAGTTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAG |
Protein Sequence
|
MKTHLSERGRSTMQNSSSSTPPSIKAQHRRAKRSKSVIRRRRLDLDCGCSIYVHINCRNHGFTHRGTHHCSSSNEWRFYLGGSKSPLFQDNPSGGANIHHNQNIHHPNTVQLQPEEGVESTQSIPELPNLDDISSSFWDDIFK |
NCBI Accession
|
YP_579170.1
|
Location
|
1346-2422 |
Gene Name
|
AC1 |
Protein Name
|
AC1 |
Coding Region
|
ATGCCACGGAAGGGTTCATTCTCAATAAAAGCCAAAAACTATTTCCTCACATACCCTATATGTTCATTAGCCAAAGAAGAAGCACTGTCCCAAATCAAAGCTCTGCACACCCCTGTAAACAAAAAATTCATCAAGATCTGTAGAGAGCTTCACGATAATGGGGAACCTCATCTTCATGTGCTTATCCAGTTCGAAGGAAAATACAACTGCACGAATAACAGATTCTTCGATTTGGTATCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAATCCAGCTCCGATGTCAAGTCCTACATCGACAAGGACGGAGATACAATTGAATGGGGACAATTCCAGATCGACGGAAGATCTGCTAGAGGAGGTCAGCAGTCTTCTAACGATACATACGCAAAGGCGTTAAACGCAGCTTCTGCAGAGGAAGCACTGCAAATAATAAAGGAGGAACAACCACAACACTTCTTTCTTCAACATCACAATCTCGTTGCGAACGCAACAAGAATATTTCAGAAGTCTCCAGAACCATGGGTTCCTCCGTTTCAACTCTCCTCCTTCACGAACGTTCCAGATGAGATGCAAGAATGGGCAGACAACTACTTTGGGAGGGGTGCCGCTGCGCGGGCAGATAGACCGATAAGTATCATCATCGAAGGAGATAGTCGAACTGGAAAAACAATGTGGGCCCGTTCATTAGGTAAACATAATTATCTTAGTGGACATCTTGACTTTAATGGCAGAGTCTATTCGAATGACGTCGAATATAACGTCATTGATGACATAAGCCCTAATTATTTGAAATTAAAGCATTGGAAAGAATTGATAGGGGCCCAAAAGGACTGGCAGTCCAACTGTAAATACGGGAAGCCAGTTCAAACTAAAGGAGGAATACCCTCAATCGTGCTGTGCAATCCAGGAGAGGGGGCTAGCTATAAAGACTTCCTCGATAAAGATGAAAACGCATCTCTCAGAGCGTGGACGATCCACAATGCAAAATTCATCTTCCTCAACTCCCCCCTCTATCAAAGCACAGCACAGGAGAGCGAAGAGATCCAAATCTGTCATTAG |
Protein Sequence
|
MPRKGSFSIKAKNYFLTYPICSLAKEEALSQIKALHTPVNKKFIKICRELHDNGEPHLHVLIQFEGKYNCTNNRFFDLVSPTRSAHFHPNIQGAKSSSDVKSYIDKDGDTIEWGQFQIDGRSARGGQQSSNDTYAKALNAASAEEALQIIKEEQPQHFFLQHHNLVANATRIFQKSPEPWVPPFQLSSFTNVPDEMQEWADNYFGRGAAARADRPISIIIEGDSRTGKTMWARSLGKHNYLSGHLDFNGRVYSNDVEYNVIDDISPNYLKLKHWKELIGAQKDWQSNCKYGKPVQTKGGIPSIVLCNPGEGASYKDFLDKDENASLRAWTIHNAKFIFLNSPLYQSTAQESEEIQICH |
NCBI Accession
|
YP_579171.1
|
Location
|
339-1109 |
Protein Name
|
BV1 protein |
Coding Region
|
ATGTATTCTTTTAGATATAGACCGTATCATTTTAATTATCGGAAACGATTTTACACACGTACGCAAGTGTCTAAACGGGTAGCCCCGTTTAAACGAGCTGATGTGAAATGTCGAACGAGGCAGACGACTATCGTTCATGATGAGACTAAGATGTCTTCGCAGCGCATTCATGAGAACCAATTTGGTCCAGAGTTTGTGATGACACATAACTCCGCCATATCCACTTTCATTAATTATCCTACTTTGAGTAAGACCGAGCCTAACAGAAGCAGATCTTACATTAAGTTGAAACGCTTGCGGTTTAAGGGTACTGTTAAAATTGAGCGTGTGTATGCGGATATGAACATGGATGGTTTGAACCCTAAAGTTGAAGGGGTATTCACTCTTGCTGTTGTAGTTGACCGAAAACCTCATTTAAAGCCATCTGGATGTCTGCATACATTTGATGAGGTATTTGGTGCACGGATTCACAGTCATGGTACGTTAGCCATTACTCCGTCACTGACAGATCGTTACTACATTCGCCATGTGTTTAAACGTGTAATGTCTGTTGAGAAGGATACTGCCATGGTTGATGTGGAAGGATCGATGTCTCTCTCTAATAAGCGTTTTAATTGTTGGGCTACGTTTAAGGATCTTGATCATGAATCTTGTAAGGGTGTTTATGACAATATTAGCAAAAACGCCTTGTTAATTTATTATTGTTGGATGTCTGATGTACCATCTAAGGCATCGTCATTTGTATCATTTGATTTGGATTATGTTGGCTAA |
Protein Sequence
|
MYSFRYRPYHFNYRKRFYTRTQVSKRVAPFKRADVKCRTRQTTIVHDETKMSSQRIHENQFGPEFVMTHNSAISTFINYPTLSKTEPNRSRSYIKLKRLRFKGTVKIERVYADMNMDGLNPKVEGVFTLAVVVDRKPHLKPSGCLHTFDEVFGARIHSHGTLAITPSLTDRYYIRHVFKRVMSVEKDTAMVDVEGSMSLSNKRFNCWATFKDLDHESCKGVYDNISKNALLIYYCWMSDVPSKASSFVSFDLDYVG |
NCBI Accession
|
YP_579172.1
|
Location
|
1165-2046 |
Protein Name
|
BC1 protein |
Coding Region
|
ATGGATGCTCAATTGGTTAATCCTCCAAGTGCCTTTAATTATATAGAATCTCACAGAGACGAATATCAGCTATCTCATGATTTAACTGAGATAATACTGCACTTTCCGTCAGCAGCGGCTCAATTATCAGCAAGATTAAGTCGCAGTTGTATGAAAATAGATCACTGCGTCATAGAATACAGGCAACAGGTACCGATAAACGCAATAGGTACTGTAATTGTGGAGATCCACGACAGAAGGATGACGGATAACGAATCATTACAAGCATCATGGACGTTCCCAATCAGATGCAACATAGACCTTCATTACTTTTCCTCGTCTTTCTTCTCACTGAAAGACCCAATCCCGTGGAAACTATACTACAGAGTCTGTGATTCAAACATACACCAACGAACACATTTCGCCAAGTTCAAAGGGAAACTAAAACTGTCGACAGCGAAACATTCTGTAGATATCCCATTCAGAGCTCCGGCGGTGAAGATCCTGTCTAAGCAATTTTCCGAGAAGGATGTCGATTTCTCACATGTGGGCTACGGGAGATGGGAAAGAAAAATGATCCGGTCAATCTCAATGGCAAGAATTGGGCTACCAAGCCCAATAGAATTATTACCAGGCGAGTCATGGGCCTCAAGAAGCACAATCGGTATAGGCCAAACGGACACAGATTCGGAACTGGAAAATGCAATACACCCATACAGGCAACTCAATCGTCTGGGAACCAGTGCGTTGGATCCAGGTGATTCTGCTTCAATCGTAGGGGCTTCAAGGGCCCAATCCAATATAACAATGTCAATGGCCCAATTAAATGATCTTGTACGATCAACGGTCCATGAGTGTATTAATAGTAATTGTACACCGGCTCAGCCGAAATCGTTAAAATAG |
Protein Sequence
|
MDAQLVNPPSAFNYIESHRDEYQLSHDLTEIILHFPSAAAQLSARLSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINAIGTVIVEIHDRRMTDNESLQASWTFPIRCNIDLHYFSSSFFSLKDPIPWKLYYRVCDSNIHQRTHFAKFKGKLKLSTAKHSVDIPFRAPAVKILSKQFSEKDVDFSHVGYGRWERKMIRSISMARIGLPSPIELLPGESWASRSTIGIGQTDTDSELENAIHPYRQLNRLGTSALDPGDSASIVGASRAQSNITMSMAQLNDLVRSTVHECINSNCTPAQPKSLK |