Emilia yellow vein Thailand virus
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Genome
ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTTTAGTGGGCCCCGCACACGCGCCTGTCCAATCTTATCCGTTGCTCAAAGCTTAATTATTAAATGGTCCCCTATAAAACTTGGTCCCTACGTTCTCGTTTTAAACATGTGGGATCCTTTATTAAACGAGTTTCCCGAAACCGTACACGGTTTTAGGTGTATGCTAGCAATTAAGTATTTGCAATTAGTAGAAAATACGTATTCTCCTGATACATTAGGTTACGATTTAATTCGTGATTTAATTCTAGTTATCCGTGCTAGGGATTATGTCGAAGCGTCCCGCAGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTACGTCGTCGGCTGAACTTCGACAGCCCGTATACCAGCCGTGCTGTTGCCCCCACTGTCCTCGTCACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAAGCCCAGGATGTACAGAATGTACAAAAGCCCTGATGTGCCCAAAGGATGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCTTATGAACAGAGGCATGATATATCACATGTTGGTAAAGTATTATGTGTTAGTGATGTTACTCGTGGAAATGGGCTTACCCATCGTGTGGGTAAGAGGTTTTGTGTGAAGTCCATTTATGTGTTGGGCAAAATATGGATGGATGAAAATATTAAGACCAAGAATCATACTAATACTGTCATGTTCTATTTGGTCCGTGATAGAAGGCCTTTTGGTACTGCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGACAATGAGCCCAGTACTGCTACTATCAAGAATGATCTTCGAGATCGTTATCAAGTTTTAAGGAAATTCACTTCAACAGTTACAGGTGGTCAATATGCTTCTAAGGAACAGGCGTTGGTTAAGAAATTTATGAAGATTAATAATTATGTAGTTTATAATCATCAAGAAGCTGCTAAGTATGACAACCATACTGAGAATGCCTTGTTATTGTATATGGCTTGTACTCATGCCAGTAATCCAGTGTATGCTACTTTAAAGATCAGAATCTATTTTTATGATTCTGTTCAGAATTAATAAATATTAAATTTTATTATGTGTGAAAATTGTACATCGATTGTTCCATCAATTACATTGTTTAATACATGATTACAAGCTCTAATTACATTGTTTATGCTAATTACACCTAAACTATTTAAATACTTCATACATTGATACTTAAATATTCTTAAGAAACGCCAAGTCGGAGGATGTAAACGAGTCCATATTTGGCAGGTTAGAAAACATTGATGTATCCCCAAAGCTTTCCTCAGGTTGTAGTTGAACTGGATCTGAACCGTTATTATGTCGTGGTTCCTCAGAAATGGTCTTTCCAGGTGTTGGGTTATCTTGAAATATAGGGGATTTGTTATCTCCCAGATATACACGCCACTCTCTGCTTGAGCTGCAGTGATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATATGAAGCGCAATTTATTGCGATGAAATATGAACACCCACACGGCAGGTCAACTCTCCTCCTGCGGACTGCCTTCTTCTTGGCGATTTGGTGTTGCACCTTGATAGGAACCTGAGTAGAGTGGGCTTTCGAGGGTGACGAAGATCGCATTCTTTGTGGCCCAATTCTTGAGTGCGGTATTCTTTTCTTCGTCCAAAAACTCTTTATAACTTGAGTTGGGCCCTGGATTGCAGAGGAAGATTGTGGGGATCCCTCCTTTAATTTGAACTGGCTTTCCGTATTTTGTATTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATAAATTCTTTAAAGTGCTTTAGATAGTGCGGATCAACGTCATCAATGACGTTGTACCACGCATTATTGCTGTACACTTTAGGGCTGAGGTCTAGATGGCCACACAAATAGTTGTGTGGTCCTAGTGATCTGGCCCACATTGTCTTCCCTGTCCTGCTATCACCCTCGATTACTATACTTACCGGTCTTAATGGCCGCGCAGCGGCACTGACGACATTATCGGCAGCCCATTCATCAAGTTCTTCTGGAACTTGATCAAAAGAAGAAGAAGAAAAAGGAGATATATATTCCTCTATTGGAGGAGTAAAAATCCTATCTAAATTACTAGTTAAATTATGAAATTGTAATACAAAATCTTTGGGAGCTTTCTCCCTTAATATATTGAGGGCCGCAGCTTTGGACCCTGAGTTGATTGCCTCGGCATATGCGTCGTTGGCAGTTTGGCAACCTCCTCTAGCCGATCTTCCATCGATTTGGAAAGATCCAAAATCAAGCACGTCTCCGTCTTTGTCCATGTAGGATTTAACATCTGACGAGCTTTTAGCTGCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGGGATGTGAGGTCGAAGAATCTGTTGTTCTGGCATTTGAATTTGCCTTCGAACTGGATGAGAACATGCAGGTGAGGATTCCCATCTTCGTGTAGTTCTCTGCAGATTCTTATGAACAATTTATTGGTTGGTGTTGTTAGGTTTTTTAATTGGGAAAGTGCTTCCTCTTTTGTTAGTGAGCATTGCGGGTATGTGAGGAAGTAATTTTTGGCATTTATTAAAAATTTTCTGGGTTGAGGCATGTTGACTTGGTCAATCGGGTCCTCTCAAACTTGTCTATGCAATTGGGGAATGGGTCCTTATTTATAGTTGAGGACCTAAATGGCATTATTGTAATTTTTAAAAAGAAATTCAAAATTCAAATCCCAAAAGCGGCCATCCGTATAATATT
Gene Information
NCBI Accession
|
ASL70127.1
|
Location
|
127-477 |
Gene Name
|
AV2 |
Protein Name
|
AV2 protein |
Coding Region
|
ATGTGGGATCCTTTATTAAACGAGTTTCCCGAAACCGTACACGGTTTTAGGTGTATGCTAGCAATTAAGTATTTGCAATTAGTAGAAAATACGTATTCTCCTGATACATTAGGTTACGATTTAATTCGTGATTTAATTCTAGTTATCCGTGCTAGGGATTATGTCGAAGCGTCCCGCAGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTACGTCGTCGGCTGAACTTCGACAGCCCGTATACCAGCCGTGCTGTTGCCCCCACTGTCCTCGTCACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAAGCCCAGGATGTACAGAATGTACAAAAGCCCTGA |
Protein Sequence
|
MWDPLLNEFPETVHGFRCMLAIKYLQLVENTYSPDTLGYDLIRDLILVIRARDYVEASRRYSHFHSRIQGTSSAELRQPVYQPCCCPHCPRHKQKEVMGESAHVPKAQDVQNVQKP |
NCBI Accession
|
ASL70128.1
|
Location
|
287-1060 |
Gene Name
|
AV1 |
Protein Name
|
coat protein |
Coding Region
|
ATGTCGAAGCGTCCCGCAGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTACGTCGTCGGCTGAACTTCGACAGCCCGTATACCAGCCGTGCTGTTGCCCCCACTGTCCTCGTCACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAAGCCCAGGATGTACAGAATGTACAAAAGCCCTGATGTGCCCAAAGGATGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCTTATGAACAGAGGCATGATATATCACATGTTGGTAAAGTATTATGTGTTAGTGATGTTACTCGTGGAAATGGGCTTACCCATCGTGTGGGTAAGAGGTTTTGTGTGAAGTCCATTTATGTGTTGGGCAAAATATGGATGGATGAAAATATTAAGACCAAGAATCATACTAATACTGTCATGTTCTATTTGGTCCGTGATAGAAGGCCTTTTGGTACTGCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGACAATGAGCCCAGTACTGCTACTATCAAGAATGATCTTCGAGATCGTTATCAAGTTTTAAGGAAATTCACTTCAACAGTTACAGGTGGTCAATATGCTTCTAAGGAACAGGCGTTGGTTAAGAAATTTATGAAGATTAATAATTATGTAGTTTATAATCATCAAGAAGCTGCTAAGTATGACAACCATACTGAGAATGCCTTGTTATTGTATATGGCTTGTACTCATGCCAGTAATCCAGTGTATGCTACTTTAAAGATCAGAATCTATTTTTATGATTCTGTTCAGAATTAA |
Protein Sequence
|
MSKRPADIVISTPASKVRRRLNFDSPYTSRAVAPTVLVTNKRRSWVNRPMYRKPRMYRMYKSPDVPKGCEGPCKVQSYEQRHDISHVGKVLCVSDVTRGNGLTHRVGKRFCVKSIYVLGKIWMDENIKTKNHTNTVMFYLVRDRRPFGTAMDFGQVFNMYDNEPSTATIKNDLRDRYQVLRKFTSTVTGGQYASKEQALVKKFMKINNYVVYNHQEAAKYDNHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSVQN |
NCBI Accession
|
ASL70129.1
|
Location
|
1057-1461 |
Gene Name
|
AC3 |
Protein Name
|
replication enhancer protein |
Coding Region
|
ATGGATTCACGCACAGGGGAACTCATCACTGCAGCTCAAGCAGAGAGTGGCGTGTATATCTGGGAGATAACAAATCCCCTATATTTCAAGATAACCCAACACCTGGAAAGACCATTTCTGAGGAACCACGACATAATAACGGTTCAGATCCAGTTCAACTACAACCTGAGGAAAGCTTTGGGGATACATCAATGTTTTCTAACCTGCCAAATATGGACTCGTTTACATCCTCCGACTTGGCGTTTCTTAAGAATATTTAAGTATCAATGTATGAAGTATTTAAATAGTTTAGGTGTAATTAGCATAAACAATGTAATTAGAGCTTGTAATCATGTATTAAACAATGTAATTGATGGAACAATCGATGTACAATTTTCACACATAATAAAATTTAATATTTATTAA |
Protein Sequence
|
MDSRTGELITAAQAESGVYIWEITNPLYFKITQHLERPFLRNHDIITVQIQFNYNLRKALGIHQCFLTCQIWTRLHPPTWRFLRIFKYQCMKYLNSLGVISINNVIRACNHVLNNVIDGTIDVQFSHIIKFNIY |
NCBI Accession
|
ASL70130.1
|
Location
|
1202-1609 |
Gene Name
|
AC2 |
Protein Name
|
transcriptional activator protein |
Coding Region
|
ATGCGATCTTCGTCACCCTCGAAAGCCCACTCTACTCAGGTTCCTATCAAGGTGCAACACCAAATCGCCAAGAAGAAGGCAGTCCGCAGGAGGAGAGTTGACCTGCCGTGTGGGTGTTCATATTTCATCGCAATAAATTGCGCTTCATATGGATTCACGCACAGGGGAACTCATCACTGCAGCTCAAGCAGAGAGTGGCGTGTATATCTGGGAGATAACAAATCCCCTATATTTCAAGATAACCCAACACCTGGAAAGACCATTTCTGAGGAACCACGACATAATAACGGTTCAGATCCAGTTCAACTACAACCTGAGGAAAGCTTTGGGGATACATCAATGTTTTCTAACCTGCCAAATATGGACTCGTTTACATCCTCCGACTTGGCGTTTCTTAAGAATATTTAA |
Protein Sequence
|
MRSSSPSKAHSTQVPIKVQHQIAKKKAVRRRRVDLPCGCSYFIAINCASYGFTHRGTHHCSSSREWRVYLGDNKSPIFQDNPTPGKTISEEPRHNNGSDPVQLQPEESFGDTSMFSNLPNMDSFTSSDLAFLKNI |
NCBI Accession
|
ASL70132.1
|
Location
|
1509-2597 |
Gene Name
|
AC1 |
Protein Name
|
replication associated protein |
Coding Region
|
ATGCCTCAACCCAGAAAATTTTTAATAAATGCCAAAAATTACTTCCTCACATACCCGCAATGCTCACTAACAAAAGAGGAAGCACTTTCCCAATTAAAAAACCTAACAACACCAACCAATAAATTGTTCATAAGAATCTGCAGAGAACTACACGAAGATGGGAATCCTCACCTGCATGTTCTCATCCAGTTCGAAGGCAAATTCAAATGCCAGAACAACAGATTCTTCGACCTCACATCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGCAGCTAAAAGCTCGTCAGATGTTAAATCCTACATGGACAAAGACGGAGACGTGCTTGATTTTGGATCTTTCCAAATCGATGGAAGATCGGCTAGAGGAGGTTGCCAAACTGCCAACGACGCATATGCCGAGGCAATCAACTCAGGGTCCAAAGCTGCGGCCCTCAATATATTAAGGGAGAAAGCTCCCAAAGATTTTGTATTACAATTTCATAATTTAACTAGTAATTTAGATAGGATTTTTACTCCTCCAATAGAGGAATATATATCTCCTTTTTCTTCTTCTTCTTTTGATCAAGTTCCAGAAGAACTTGATGAATGGGCTGCCGATAATGTCGTCAGTGCCGCTGCGCGGCCATTAAGACCGGTAAGTATAGTAATCGAGGGTGATAGCAGGACAGGGAAGACAATGTGGGCCAGATCACTAGGACCACACAACTATTTGTGTGGCCATCTAGACCTCAGCCCTAAAGTGTACAGCAATAATGCGTGGTACAACGTCATTGATGACGTTGATCCGCACTATCTAAAGCACTTTAAAGAATTTATGGGGGCCCAAAGGGACTGGCAAAGCAATACAAAATACGGAAAGCCAGTTCAAATTAAAGGAGGGATCCCCACAATCTTCCTCTGCAATCCAGGGCCCAACTCAAGTTATAAAGAGTTTTTGGACGAAGAAAAGAATACCGCACTCAAGAATTGGGCCACAAAGAATGCGATCTTCGTCACCCTCGAAAGCCCACTCTACTCAGGTTCCTATCAAGGTGCAACACCAAATCGCCAAGAAGAAGGCAGTCCGCAGGAGGAGAGTTGA |
Protein Sequence
|
MPQPRKFLINAKNYFLTYPQCSLTKEEALSQLKNLTTPTNKLFIRICRELHEDGNPHLHVLIQFEGKFKCQNNRFFDLTSPTRSAHFHPNIQAAKSSSDVKSYMDKDGDVLDFGSFQIDGRSARGGCQTANDAYAEAINSGSKAAALNILREKAPKDFVLQFHNLTSNLDRIFTPPIEEYISPFSSSSFDQVPEELDEWAADNVVSAAARPLRPVSIVIEGDSRTGKTMWARSLGPHNYLCGHLDLSPKVYSNNAWYNVIDDVDPHYLKHFKEFMGAQRDWQSNTKYGKPVQIKGGIPTIFLCNPGPNSSYKEFLDEEKNTALKNWATKNAIFVTLESPLYSGSYQGATPNRQEEGSPQEES |
NCBI Accession
|
ASL70131.1
|
Location
|
2147-2440 |
Gene Name
|
AC4 |
Protein Name
|
AC4 protein |
Coding Region
|
ATGGGAATCCTCACCTGCATGTTCTCATCCAGTTCGAAGGCAAATTCAAATGCCAGAACAACAGATTCTTCGACCTCACATCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGCAGCTAAAAGCTCGTCAGATGTTAAATCCTACATGGACAAAGACGGAGACGTGCTTGATTTTGGATCTTTCCAAATCGATGGAAGATCGGCTAGAGGAGGTTGCCAAACTGCCAACGACGCATATGCCGAGGCAATCAACTCAGGGTCCAAAGCTGCGGCCCTCAATATATTAA |
Protein Sequence
|
MGILTCMFSSSSKANSNARTTDSSTSHPQPGQHISIRTFRQLKARQMLNPTWTKTETCLILDLSKSMEDRLEEVAKLPTTHMPRQSTQGPKLRPSIY |