Emilia yellow vein Thailand virus


Basic Information

Genus Begomovirus
Isolate Thailand
Vector
Download Genome |GFF3 |PEP |CDS

Genomic Organization


JBrowse


Genome

KY373213
ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTTTAGTGGGCCCCGCACACGCGCCTGTCCAATCTTATCCGTTGCTCAAAGCTTAATTATTAAATGGTCCCCTATAAAACTTGGTCCCTACGTTCTCGTTTTAAACATGTGGGATCCTTTATTAAACGAGTTTCCCGAAACCGTACACGGTTTTAGGTGTATGCTAGCAATTAAGTATTTGCAATTAGTAGAAAATACGTATTCTCCTGATACATTAGGTTACGATTTAATTCGTGATTTAATTCTAGTTATCCGTGCTAGGGATTATGTCGAAGCGTCCCGCAGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTACGTCGTCGGCTGAACTTCGACAGCCCGTATACCAGCCGTGCTGTTGCCCCCACTGTCCTCGTCACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAAGCCCAGGATGTACAGAATGTACAAAAGCCCTGATGTGCCCAAAGGATGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCTTATGAACAGAGGCATGATATATCACATGTTGGTAAAGTATTATGTGTTAGTGATGTTACTCGTGGAAATGGGCTTACCCATCGTGTGGGTAAGAGGTTTTGTGTGAAGTCCATTTATGTGTTGGGCAAAATATGGATGGATGAAAATATTAAGACCAAGAATCATACTAATACTGTCATGTTCTATTTGGTCCGTGATAGAAGGCCTTTTGGTACTGCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGACAATGAGCCCAGTACTGCTACTATCAAGAATGATCTTCGAGATCGTTATCAAGTTTTAAGGAAATTCACTTCAACAGTTACAGGTGGTCAATATGCTTCTAAGGAACAGGCGTTGGTTAAGAAATTTATGAAGATTAATAATTATGTAGTTTATAATCATCAAGAAGCTGCTAAGTATGACAACCATACTGAGAATGCCTTGTTATTGTATATGGCTTGTACTCATGCCAGTAATCCAGTGTATGCTACTTTAAAGATCAGAATCTATTTTTATGATTCTGTTCAGAATTAATAAATATTAAATTTTATTATGTGTGAAAATTGTACATCGATTGTTCCATCAATTACATTGTTTAATACATGATTACAAGCTCTAATTACATTGTTTATGCTAATTACACCTAAACTATTTAAATACTTCATACATTGATACTTAAATATTCTTAAGAAACGCCAAGTCGGAGGATGTAAACGAGTCCATATTTGGCAGGTTAGAAAACATTGATGTATCCCCAAAGCTTTCCTCAGGTTGTAGTTGAACTGGATCTGAACCGTTATTATGTCGTGGTTCCTCAGAAATGGTCTTTCCAGGTGTTGGGTTATCTTGAAATATAGGGGATTTGTTATCTCCCAGATATACACGCCACTCTCTGCTTGAGCTGCAGTGATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATATGAAGCGCAATTTATTGCGATGAAATATGAACACCCACACGGCAGGTCAACTCTCCTCCTGCGGACTGCCTTCTTCTTGGCGATTTGGTGTTGCACCTTGATAGGAACCTGAGTAGAGTGGGCTTTCGAGGGTGACGAAGATCGCATTCTTTGTGGCCCAATTCTTGAGTGCGGTATTCTTTTCTTCGTCCAAAAACTCTTTATAACTTGAGTTGGGCCCTGGATTGCAGAGGAAGATTGTGGGGATCCCTCCTTTAATTTGAACTGGCTTTCCGTATTTTGTATTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATAAATTCTTTAAAGTGCTTTAGATAGTGCGGATCAACGTCATCAATGACGTTGTACCACGCATTATTGCTGTACACTTTAGGGCTGAGGTCTAGATGGCCACACAAATAGTTGTGTGGTCCTAGTGATCTGGCCCACATTGTCTTCCCTGTCCTGCTATCACCCTCGATTACTATACTTACCGGTCTTAATGGCCGCGCAGCGGCACTGACGACATTATCGGCAGCCCATTCATCAAGTTCTTCTGGAACTTGATCAAAAGAAGAAGAAGAAAAAGGAGATATATATTCCTCTATTGGAGGAGTAAAAATCCTATCTAAATTACTAGTTAAATTATGAAATTGTAATACAAAATCTTTGGGAGCTTTCTCCCTTAATATATTGAGGGCCGCAGCTTTGGACCCTGAGTTGATTGCCTCGGCATATGCGTCGTTGGCAGTTTGGCAACCTCCTCTAGCCGATCTTCCATCGATTTGGAAAGATCCAAAATCAAGCACGTCTCCGTCTTTGTCCATGTAGGATTTAACATCTGACGAGCTTTTAGCTGCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGGGATGTGAGGTCGAAGAATCTGTTGTTCTGGCATTTGAATTTGCCTTCGAACTGGATGAGAACATGCAGGTGAGGATTCCCATCTTCGTGTAGTTCTCTGCAGATTCTTATGAACAATTTATTGGTTGGTGTTGTTAGGTTTTTTAATTGGGAAAGTGCTTCCTCTTTTGTTAGTGAGCATTGCGGGTATGTGAGGAAGTAATTTTTGGCATTTATTAAAAATTTTCTGGGTTGAGGCATGTTGACTTGGTCAATCGGGTCCTCTCAAACTTGTCTATGCAATTGGGGAATGGGTCCTTATTTATAGTTGAGGACCTAAATGGCATTATTGTAATTTTTAAAAAGAAATTCAAAATTCAAATCCCAAAAGCGGCCATCCGTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession ASL70127.1
Location 127-477
Gene Name AV2
Protein Name AV2 protein
Coding Region ATGTGGGATCCTTTATTAAACGAGTTTCCCGAAACCGTACACGGTTTTAGGTGTATGCTAGCAATTAAGTATTTGCAATTAGTAGAAAATACGTATTCTCCTGATACATTAGGTTACGATTTAATTCGTGATTTAATTCTAGTTATCCGTGCTAGGGATTATGTCGAAGCGTCCCGCAGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTACGTCGTCGGCTGAACTTCGACAGCCCGTATACCAGCCGTGCTGTTGCCCCCACTGTCCTCGTCACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAAGCCCAGGATGTACAGAATGTACAAAAGCCCTGA
Protein Sequence MWDPLLNEFPETVHGFRCMLAIKYLQLVENTYSPDTLGYDLIRDLILVIRARDYVEASRRYSHFHSRIQGTSSAELRQPVYQPCCCPHCPRHKQKEVMGESAHVPKAQDVQNVQKP

NCBI Accession ASL70128.1
Location 287-1060
Gene Name AV1
Protein Name coat protein
Coding Region ATGTCGAAGCGTCCCGCAGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTACGTCGTCGGCTGAACTTCGACAGCCCGTATACCAGCCGTGCTGTTGCCCCCACTGTCCTCGTCACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAAGCCCAGGATGTACAGAATGTACAAAAGCCCTGATGTGCCCAAAGGATGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCTTATGAACAGAGGCATGATATATCACATGTTGGTAAAGTATTATGTGTTAGTGATGTTACTCGTGGAAATGGGCTTACCCATCGTGTGGGTAAGAGGTTTTGTGTGAAGTCCATTTATGTGTTGGGCAAAATATGGATGGATGAAAATATTAAGACCAAGAATCATACTAATACTGTCATGTTCTATTTGGTCCGTGATAGAAGGCCTTTTGGTACTGCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGACAATGAGCCCAGTACTGCTACTATCAAGAATGATCTTCGAGATCGTTATCAAGTTTTAAGGAAATTCACTTCAACAGTTACAGGTGGTCAATATGCTTCTAAGGAACAGGCGTTGGTTAAGAAATTTATGAAGATTAATAATTATGTAGTTTATAATCATCAAGAAGCTGCTAAGTATGACAACCATACTGAGAATGCCTTGTTATTGTATATGGCTTGTACTCATGCCAGTAATCCAGTGTATGCTACTTTAAAGATCAGAATCTATTTTTATGATTCTGTTCAGAATTAA
Protein Sequence MSKRPADIVISTPASKVRRRLNFDSPYTSRAVAPTVLVTNKRRSWVNRPMYRKPRMYRMYKSPDVPKGCEGPCKVQSYEQRHDISHVGKVLCVSDVTRGNGLTHRVGKRFCVKSIYVLGKIWMDENIKTKNHTNTVMFYLVRDRRPFGTAMDFGQVFNMYDNEPSTATIKNDLRDRYQVLRKFTSTVTGGQYASKEQALVKKFMKINNYVVYNHQEAAKYDNHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSVQN

NCBI Accession ASL70129.1
Location 1057-1461
Gene Name AC3
Protein Name replication enhancer protein
Coding Region ATGGATTCACGCACAGGGGAACTCATCACTGCAGCTCAAGCAGAGAGTGGCGTGTATATCTGGGAGATAACAAATCCCCTATATTTCAAGATAACCCAACACCTGGAAAGACCATTTCTGAGGAACCACGACATAATAACGGTTCAGATCCAGTTCAACTACAACCTGAGGAAAGCTTTGGGGATACATCAATGTTTTCTAACCTGCCAAATATGGACTCGTTTACATCCTCCGACTTGGCGTTTCTTAAGAATATTTAAGTATCAATGTATGAAGTATTTAAATAGTTTAGGTGTAATTAGCATAAACAATGTAATTAGAGCTTGTAATCATGTATTAAACAATGTAATTGATGGAACAATCGATGTACAATTTTCACACATAATAAAATTTAATATTTATTAA
Protein Sequence MDSRTGELITAAQAESGVYIWEITNPLYFKITQHLERPFLRNHDIITVQIQFNYNLRKALGIHQCFLTCQIWTRLHPPTWRFLRIFKYQCMKYLNSLGVISINNVIRACNHVLNNVIDGTIDVQFSHIIKFNIY

NCBI Accession ASL70130.1
Location 1202-1609
Gene Name AC2
Protein Name transcriptional activator protein
Coding Region ATGCGATCTTCGTCACCCTCGAAAGCCCACTCTACTCAGGTTCCTATCAAGGTGCAACACCAAATCGCCAAGAAGAAGGCAGTCCGCAGGAGGAGAGTTGACCTGCCGTGTGGGTGTTCATATTTCATCGCAATAAATTGCGCTTCATATGGATTCACGCACAGGGGAACTCATCACTGCAGCTCAAGCAGAGAGTGGCGTGTATATCTGGGAGATAACAAATCCCCTATATTTCAAGATAACCCAACACCTGGAAAGACCATTTCTGAGGAACCACGACATAATAACGGTTCAGATCCAGTTCAACTACAACCTGAGGAAAGCTTTGGGGATACATCAATGTTTTCTAACCTGCCAAATATGGACTCGTTTACATCCTCCGACTTGGCGTTTCTTAAGAATATTTAA
Protein Sequence MRSSSPSKAHSTQVPIKVQHQIAKKKAVRRRRVDLPCGCSYFIAINCASYGFTHRGTHHCSSSREWRVYLGDNKSPIFQDNPTPGKTISEEPRHNNGSDPVQLQPEESFGDTSMFSNLPNMDSFTSSDLAFLKNI

NCBI Accession ASL70132.1
Location 1509-2597
Gene Name AC1
Protein Name replication associated protein
Coding Region ATGCCTCAACCCAGAAAATTTTTAATAAATGCCAAAAATTACTTCCTCACATACCCGCAATGCTCACTAACAAAAGAGGAAGCACTTTCCCAATTAAAAAACCTAACAACACCAACCAATAAATTGTTCATAAGAATCTGCAGAGAACTACACGAAGATGGGAATCCTCACCTGCATGTTCTCATCCAGTTCGAAGGCAAATTCAAATGCCAGAACAACAGATTCTTCGACCTCACATCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGCAGCTAAAAGCTCGTCAGATGTTAAATCCTACATGGACAAAGACGGAGACGTGCTTGATTTTGGATCTTTCCAAATCGATGGAAGATCGGCTAGAGGAGGTTGCCAAACTGCCAACGACGCATATGCCGAGGCAATCAACTCAGGGTCCAAAGCTGCGGCCCTCAATATATTAAGGGAGAAAGCTCCCAAAGATTTTGTATTACAATTTCATAATTTAACTAGTAATTTAGATAGGATTTTTACTCCTCCAATAGAGGAATATATATCTCCTTTTTCTTCTTCTTCTTTTGATCAAGTTCCAGAAGAACTTGATGAATGGGCTGCCGATAATGTCGTCAGTGCCGCTGCGCGGCCATTAAGACCGGTAAGTATAGTAATCGAGGGTGATAGCAGGACAGGGAAGACAATGTGGGCCAGATCACTAGGACCACACAACTATTTGTGTGGCCATCTAGACCTCAGCCCTAAAGTGTACAGCAATAATGCGTGGTACAACGTCATTGATGACGTTGATCCGCACTATCTAAAGCACTTTAAAGAATTTATGGGGGCCCAAAGGGACTGGCAAAGCAATACAAAATACGGAAAGCCAGTTCAAATTAAAGGAGGGATCCCCACAATCTTCCTCTGCAATCCAGGGCCCAACTCAAGTTATAAAGAGTTTTTGGACGAAGAAAAGAATACCGCACTCAAGAATTGGGCCACAAAGAATGCGATCTTCGTCACCCTCGAAAGCCCACTCTACTCAGGTTCCTATCAAGGTGCAACACCAAATCGCCAAGAAGAAGGCAGTCCGCAGGAGGAGAGTTGA
Protein Sequence MPQPRKFLINAKNYFLTYPQCSLTKEEALSQLKNLTTPTNKLFIRICRELHEDGNPHLHVLIQFEGKFKCQNNRFFDLTSPTRSAHFHPNIQAAKSSSDVKSYMDKDGDVLDFGSFQIDGRSARGGCQTANDAYAEAINSGSKAAALNILREKAPKDFVLQFHNLTSNLDRIFTPPIEEYISPFSSSSFDQVPEELDEWAADNVVSAAARPLRPVSIVIEGDSRTGKTMWARSLGPHNYLCGHLDLSPKVYSNNAWYNVIDDVDPHYLKHFKEFMGAQRDWQSNTKYGKPVQIKGGIPTIFLCNPGPNSSYKEFLDEEKNTALKNWATKNAIFVTLESPLYSGSYQGATPNRQEEGSPQEES

NCBI Accession ASL70131.1
Location 2147-2440
Gene Name AC4
Protein Name AC4 protein
Coding Region ATGGGAATCCTCACCTGCATGTTCTCATCCAGTTCGAAGGCAAATTCAAATGCCAGAACAACAGATTCTTCGACCTCACATCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGCAGCTAAAAGCTCGTCAGATGTTAAATCCTACATGGACAAAGACGGAGACGTGCTTGATTTTGGATCTTTCCAAATCGATGGAAGATCGGCTAGAGGAGGTTGCCAAACTGCCAACGACGCATATGCCGAGGCAATCAACTCAGGGTCCAAAGCTGCGGCCCTCAATATATTAA
Protein Sequence MGILTCMFSSSSKANSNARTTDSSTSHPQPGQHISIRTFRQLKARQMLNPTWTKTETCLILDLSKSMEDRLEEVAKLPTTHMPRQSTQGPKLRPSIY